EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020009251 (Gene tree)
Gene ID: 112642408
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26453 bases
Position: chrQKWQ01002063.1:6334005-6360457
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020011956	PAZ	PF02170.22	1.1e-28	1	1
ENSCAFP00020011946	PAZ	PF02170.22	1.1e-28	1	1
ENSCAFP00020011762	PAZ	PF02170.22	1.1e-28	1	1
ENSCAFP00020011939	PAZ	PF02170.22	1.2e-28	1	1
ENSCAFP00020012155	PAZ	PF02170.22	2e-28	1	1
ENSCAFP00020012304	PAZ	PF02170.22	2.4e-28	1	1
ENSCAFP00020011820	PAZ	PF02170.22	2.5e-28	1	1
ENSCAFP00020012304	Piwi	PF02171.17	1.3e-110	1	1
ENSCAFP00020011820	Piwi	PF02171.17	1.4e-110	1	1
ENSCAFP00020011956	Piwi	PF02171.17	1.4e-110	1	1
ENSCAFP00020011762	Piwi	PF02171.17	1.4e-110	1	1
ENSCAFP00020011946	Piwi	PF02171.17	1.5e-110	1	1
ENSCAFP00020011939	Piwi	PF02171.17	1.5e-110	1	1
ENSCAFP00020012155	Piwi	PF02171.17	1.2e-103	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020014201	AGO1-207	2490	-	ENSCAFP00020012304	829 (aa)	-	-
ENSCAFT00020013790	AGO1-204	2580	-	ENSCAFP00020011946	859 (aa)	-	-
ENSCAFT00020013592	AGO1-201	2577	-	ENSCAFP00020011762	858 (aa)	-	-
ENSCAFT00020014020	AGO1-206	2151	-	ENSCAFP00020012155	716 (aa)	-	-
ENSCAFT00020013783	AGO1-203	2598	-	ENSCAFP00020011939	865 (aa)	-	-
ENSCAFT00020013657	AGO1-202	2547	-	ENSCAFP00020011820	848 (aa)	-	-
ENSCAFT00020013800	AGO1-205	2565	-	ENSCAFP00020011956	854 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	88.571	ENSCAFG00020014198	AGO2	100	82.442
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	91.111	ENSCAFG00020009051	AGO3	99	91.401
ENSCAFG00020009251	AGO1	87	30.952	ENSCAFG00020016521	PIWIL4	76	38.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSAPOG00000024299	ago1	98	96.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	98.133	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020009251	AGO1	85	91.607	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSAOCG00000017727	ago1	98	96.667	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.667	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSATEG00000008523	ago1	98	96.667	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSAPLG00000010440	AGO1	97	93.483	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00020009251	AGO1	92	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSANAG00000037711	AGO1	100	98.133	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSACLG00000000890	ago1	98	96.429	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020009251	AGO1	83	98.108	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	98.016	Bos_taurus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	98.133	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	98.133	Canis_familiaris
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCHIG00000011848	-	100	97.216	Capra_hircus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSTSYG00000009767	-	99	99.762	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	78.749	ENSTSYG00000032426	-	100	78.706	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020009251	AGO1	90	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	98.133	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	98.133	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCLAG00000011507	AGO1	99	99.762	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	98.133	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020009251	AGO1	86	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	98.016	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCANG00000039798	AGO1	100	98.133	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	98.133	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	99.762	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSCSEG00000001051	ago1	99	95.182	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.667	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	97.778	ENSDARG00000092644	ago1	99	96.122	Danio_rerio
ENSCAFG00020009251	AGO1	92	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020009251	AGO1	92	99.845	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020009251	AGO1	83	92.232	ENSETEG00000007626	AGO1	100	90.985	Echinops_telfairi
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSEASG00005012086	AGO1	100	98.133	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSECAG00000024353	AGO1	100	98.133	Equus_caballus
ENSCAFG00020009251	AGO1	92	99.683	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSCAFG00020009251	AGO1	91	98.095	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	98.133	Felis_catus
ENSCAFG00020009251	AGO1	91	99.683	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSFDAG00000017210	AGO1	99	99.289	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.738	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020009251	AGO1	87	97.152	ENSGMOG00000019413	ago1	90	97.152	Gadus_morhua
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSGALG00000002249	AGO1	100	98.016	Gallus_gallus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSGAFG00000009775	ago1	99	95.887	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020009251	AGO1	90	96.937	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00020009251	AGO1	92	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	98.133	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSHBUG00000010459	ago1	98	96.429	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	98.133	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	98.133	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.667	Hippocampus_comes
ENSCAFG00020009251	AGO1	100	98.095	ENSIPUG00000023216	ago1	99	95.770	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	98.133	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	98.133	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSKMAG00000019464	ago1	98	96.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSLBEG00000007694	ago1	99	95.770	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	93.238	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.238	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	94.174	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.655	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.762	Loxodonta_africana
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	98.133	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	94.887	ENSMMUG00000006251	AGO1	99	95.000	Macaca_mulatta
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	95.853	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	98.133	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSMAMG00000008381	ago1	98	96.667	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSMZEG00005007996	ago1	98	96.429	Maylandia_zebra
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.054	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	93.772	Meleagris_gallopavo
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	98.133	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSMICG00000016147	AGO1	100	98.133	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	98.016	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00020009251	AGO1	81	98.212	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSMODG00000023335	AGO1	100	97.900	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.548	Monopterus_albus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	Mus_caroli
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ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.458	Mus_pahari
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.458	Mus_spretus
ENSCAFG00020009251	AGO1	87	99.583	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00020009251	AGO1	61	98.453	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	98.453	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSNGAG00000017448	Ago1	99	99.058	Nannospalax_galili
ENSCAFG00020009251	AGO1	91	98.095	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	98.250	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00020009251	AGO1	86	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCAFG00020009251	AGO1	92	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	91	100.000	Ochotona_princeps
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSODEG00000005321	AGO1	100	98.133	Octodon_degus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.429	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSOANG00000002080	AGO1	100	90.233	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	98.016	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSORLG00000014965	ago1	98	96.667	Oryzias_latipes
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSORLG00020018253	ago1	98	96.667	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSORLG00015003287	ago1	98	96.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	ENSOMEG00000020528	ago1	98	96.667	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSOGAG00000010279	AGO1	98	99.762	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSOARG00000019591	AGO1	100	98.016	Ovis_aries
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	98.133	Pan_paniscus
ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	98.133	Panthera_pardus
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