EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020009633 (Gene tree)
Gene ID: 112655594
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 40907 bases
Position: chrQKWQ01000972.1:402721-443627
Accession: 112655594
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020011989	GTP_EFTU	PF00009.27	3.7e-45	1	1
ENSCAFP00020012001	GTP_EFTU	PF00009.27	4e-45	1	1
ENSCAFP00020011989	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-12	1	1
ENSCAFP00020012001	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.4e-12	1	1
ENSCAFP00020011989	EFG_IV	PF03764.18	2.8e-23	1	1
ENSCAFP00020012001	EFG_IV	PF03764.18	2.9e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020013850	EFTUD2-202	3055	-	ENSCAFP00020012001	1016 (aa)	-	-
ENSCAFT00020013835	EFTUD2-201	2923	-	ENSCAFP00020011989	972 (aa)	XP_025296563	UPI00005A1B35

Gene Model

Click here to download ENSCAFG00020009633's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCAFG00020009633's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	87	38.832	ENSCAFG00020007212	-	99	38.832
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	87	38.832	ENSCAFG00020018386	-	99	38.832
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	51	30.986	ENSCAFG00020005878	GFM1	60	30.986

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.897	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	100.000	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	88.683	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.477	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.284	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.078	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.593	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.387	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	99	94.439	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.439	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	97.634	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.691	Bos_taurus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	70.041	Caenorhabditis_elegans
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	100.000	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	Capra_hircus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.383	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.177	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.177	Cavia_aperea
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.177	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.794	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.074	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.663	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	99	78.106	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.794	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.770	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.387	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.049	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.177	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.177	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.588	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	75.282	FBgn0039566	CG4849	100	75.179	Drosophila_melanogaster
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	100.000	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.897	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.897	Equus_caballus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.897	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	Felis_catus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.045	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.383	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.490	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.152	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.564	Gadus_morhua
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.148	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	Gallus_gallus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.872	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.794	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.078	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.971	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.971	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.971	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.152	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	Hippocampus_comes
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.872	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.461	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	95	91.909	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	94.239	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.074	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	Loxodonta_africana
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.794	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.794	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.794	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.593	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.387	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.975	Maylandia_zebra
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.152	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	Meleagris_gallopavo
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.486	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.794	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.588	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	92	81.685	ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.486	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.280	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.280	Mus_caroli
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.280	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.280	Mus_musculus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.280	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	Mus_pahari
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.280	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.280	Mus_spretus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	97	99.788	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.894	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	100.000	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	100.000	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	Nannospalax_galili
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.078	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	97	97.981	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	97	97.479	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	95.782	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	Notamacropus_eugenii
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.461	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	Ochotona_princeps
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.663	ENSODEG00000018041	-	100	98.663	Octodon_degus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.975	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	97.531	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.531	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.691	Ovis_aries
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.897	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.897	Pan_paniscus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	100.000	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	100.000	Panthera_pardus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	100.000	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.897	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	Pan_troglodytes
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.794	Papio_anubis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	93	97.354	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	Pelodiscus_sinensis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	84.671	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.486	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.486	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.486	Phascolarctos_cinereus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.354	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	Pongo_abelii
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	95.473	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	Procavia_capensis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	Propithecus_coquereli
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	95.062	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.078	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.872	Pundamilia_nyererei
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	Pygocentrus_nattereri
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.280	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	Rattus_norvegicus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.691	Rhinopithecus_bieti
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	Rhinopithecus_roxellana
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	97	34.190	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	97	99.467	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	Sarcophilus_harrisii
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.770	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.975	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.770	Scophthalmus_maximus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.284	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	Seriola_dumerili
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.387	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.181	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.152	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	Sorex_araneus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	97.531	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	Sphenodon_punctatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.387	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.181	Stegastes_partitus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	Sus_scrofa
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	84	97.445	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	Taeniopygia_guttata
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.358	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	Takifugu_rubripes
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	86.885	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	Tetraodon_nigroviridis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	94.136	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	Tupaia_belangeri
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.871	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.871	Ursus_americanus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	100.000	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	100.000	Ursus_maritimus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	100.000	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	97	94.776	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus