EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020010400 (Gene tree)
Gene ID: 112649658
Gene Symbol: ETF1
Alias: ERF|ERF1|RF1|SUP45L1|TB3-1
Full Name: eukaryotic translation termination factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29742 bases
Position: chrQKWQ01002178.1:16449988-16479729
Accession: 112649658
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020012907	eRF1_2	PF03464.15	3.1e-46	1	1
ENSCAFP00020012907	eRF1_3	PF03465.15	9.4e-39	1	1
ENSCAFP00020012907	eRF1_1	PF03463.15	5.9e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020014901	ETF1-201	1332	-	ENSCAFP00020012907	437 (aa)	XP_025287829	UPI00001110CB

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSG00000120705	ETF1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	95.370	ENSAPOG00000004622	etf1a	100	95.260	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	98.856	ENSAMEG00000016547	ETF1	100	98.856	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	96.796	ENSACIG00000014875	etf1a	100	96.796	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	95.370	ENSAOCG00000015573	etf1a	100	95.260	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	95.370	ENSAPEG00000015124	etf1a	100	95.260	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	95.370	ENSATEG00000009599	etf1a	100	95.260	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020010400	ETF1	93	100.000	ENSAPLG00000009740	ETF1	99	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	99.771	ENSACAG00000015818	ETF1	100	99.771	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSANAG00000025638	-	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020010400	ETF1	99	74.771	ENSANAG00000021905	-	99	74.771	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	81.465	ENSANAG00000023525	-	100	81.465	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	90.160	ENSANAG00000014418	-	100	90.160	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	95.485	ENSACLG00000010368	etf1a	100	95.485	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	94.676	ENSAMXG00000037774	etf1a	100	94.357	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	95.602	ENSAMXG00000040685	etf1b	100	95.260	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSBTAG00000011415	ETF1	100	100.000	Bos_taurus
ENSCAFG00020010400	ETF1	98	78.738	WBGene00020269	erfa-1	97	78.886	Caenorhabditis_elegans
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSCJAG00000006776	ETF1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSCAFG00000015396	-	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSCAFG00000001282	ETF1	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSCHIG00000009685	-	100	100.000	Capra_hircus
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSTSYG00000011754	ETF1	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	71.934	ENSTSYG00000036069	-	95	77.461	Carlito_syrichta
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ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSCPOG00000002361	ETF1	100	100.000	Cavia_porcellus
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ENSCAFG00020010400	ETF1	100	68.192	ENSCCAG00000024925	-	100	68.192	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020010400	ETF1	93	100.000	ENSCATG00000031628	-	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020010400	ETF1	86	66.138	ENSCATG00000029533	-	96	66.138	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	79.405	ENSCATG00000030269	-	100	79.405	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSCLAG00000007158	-	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020010400	ETF1	98	71.663	ENSCLAG00000001221	-	97	71.663	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020010400	ETF1	65	100.000	ENSCHOG00000007697	ETF1	65	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSCPBG00000021239	ETF1	100	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020010400	ETF1	99	87.298	ENSCING00000002292	-	99	87.298	Ciona_intestinalis
ENSCAFG00020010400	ETF1	99	86.374	ENSCSAVG00000003039	-	99	86.374	Ciona_savignyi
ENSCAFG00020010400	ETF1	80	77.364	ENSCANG00000035977	-	96	77.364	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	74.600	ENSCANG00000043675	-	90	74.600	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020010400	ETF1	87	74.219	ENSCANG00000037950	-	96	74.219	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	85.584	ENSCGRG00001007046	Etf1	100	85.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020010400	ETF1	93	99.755	ENSCGRG00000008154	Etf1	99	99.755	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	95.370	ENSCSEG00000006451	etf1a	100	95.260	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020010400	ETF1	97	95.370	ENSCVAG00000011438	etf1a	100	95.260	Cyprinodon_variegatus
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ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSDORG00000006134	Etf1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	85.194	FBgn0036974	eRF1	100	85.194	Drosophila_melanogaster
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	89.016	ENSETEG00000007362	ETF1	100	89.016	Echinops_telfairi
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ENSCAFG00020010400	ETF1	92	66.912	ENSEBUG00000012821	-	100	66.912	Eptatretus_burgeri
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ENSCAFG00020010400	ETF1	100	92.777	ENSIPUG00000020217	etf1b	100	92.777	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	100.000	ENSSTOG00000025996	ETF1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSCAFG00020010400	ETF1	97	95.370	ENSLBEG00000001321	etf1a	100	95.260	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020010400	ETF1	100	97.712	ENSLACG00000004339	ETF1	100	97.712	Latimeria_chalumnae
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ENSCAFG00020010400	ETF1	93	100.000	ENSMLEG00000030877	-	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
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