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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020017397 (Gene tree)
Gene ID: 112660583
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 53711 bases
Position: chrQKWQ01000243.1:28407586-28461296
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020024291	IBN_N	PF03810.19	6e-17	1	1
ENSCAFP00020024205	IBN_N	PF03810.19	6.5e-16	1	1
ENSCAFP00020024262	IBN_N	PF03810.19	6.7e-16	1	1
ENSCAFP00020024203	IBN_N	PF03810.19	6.9e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020027949	TNPO1-202	2637	-	ENSCAFP00020024205	878 (aa)	-	-
ENSCAFT00020028010	TNPO1-203	2622	-	ENSCAFP00020024262	873 (aa)	-	-
ENSCAFT00020028045	TNPO1-204	408	-	ENSCAFP00020024291	135 (aa)	-	-
ENSCAFT00020027947	TNPO1-201	2682	-	ENSCAFP00020024203	893 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	83.089	ENSCAFG00020005115	TNPO2	99	83.089

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.461	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	91.461	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	95.991	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.991	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020017397	TNPO1	87	90.181	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	90.402	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.573	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	91.573	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.573	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	91.573	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.124	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	91.124	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	89.966	ENSAPLG00000009619	-	97	90.920	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	93.933	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.933	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.404	ENSANAG00000022453	-	99	96.404	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	61.863	ENSANAG00000027118	-	99	61.973	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	85.618	ENSANAG00000025351	-	99	85.618	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	89.213	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	89.213	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.247	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	89.910	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.292	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	98.292	Bos_taurus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	96.517	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	96.499	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	96.499	Canis_familiaris
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.629	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	96.629	Capra_hircus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	92.655	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	95.088	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.404	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.404	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	82	94.595	ENSCCAG00000020805	-	71	94.595	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.400	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	96.854	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.404	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.404	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	96.854	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	81	100.000	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	83.790	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	95.056	ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	93.127	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020017397	TNPO1	79	78.505	ENSCING00000021247	-	99	78.169	Ciona_intestinalis
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	73.625	ENSCSAVG00000010981	-	99	73.625	Ciona_savignyi
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.969	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	98.969	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	96.517	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	96.374	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	96.374	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	89.775	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	89.775	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.787	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	90.787	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.011	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	89.675	Danio_rerio
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.594	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	90.594	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	93	96.506	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	96.502	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	56.659	FBgn0035693	CG8219	99	56.208	Drosophila_melanogaster
ENSCAFG00020017397	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	Echinops_telfairi
ENSCAFG00020017397	TNPO1	94	82.857	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	82.976	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	96.854	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.629	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	96.629	Equus_caballus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	83.878	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	83.442	Esox_lucius
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	96.854	Felis_catus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	94.831	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.831	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	96.517	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.134	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	91.134	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	87.794	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	87.794	Gadus_morhua
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	94.045	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	94.045	Gallus_gallus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	89.910	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	89.910	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.674	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	90.674	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	94.831	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.831	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	80.157	ENSGGOG00000022535	-	98	80.157	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.855	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	98.855	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.787	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	90.787	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.180	ENSHGLG00000000970	-	99	96.180	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020017397	TNPO1	74	91.000	ENSHGLG00000001198	-	93	84.821	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020017397	TNPO1	97	74.767	ENSHGLG00100000963	-	99	74.186	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	95.911	ENSHGLG00100017090	-	99	95.911	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020017397	TNPO1	82	98.198	ENSSTOG00000021784	-	100	98.876	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.629	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	96.629	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.011	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	91.011	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	90	87.546	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	87.546	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	86.628	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.628	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	92.809	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	92.809	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	97	95.958	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	95.958	Loxodonta_africana
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.062	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	98.062	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.742	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	96.742	Macaca_mulatta
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.969	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	98.969	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.969	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	98.969	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.124	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	91.124	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.562	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	90.562	Maylandia_zebra
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	92.697	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	92.697	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.517	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00020017397	TNPO1	87	89.820	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	90.039	Mola_mola
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.000	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	90.000	Monopterus_albus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.292	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.404	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.292	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.742	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	96.742	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	96.042	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.042	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	96.517	Nannospalax_galili
ENSCAFG00020017397	TNPO1	87	90.052	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	90.272	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	96.854	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00020017397	TNPO1	89	93.617	ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.617	Ochotona_princeps
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.180	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	96.180	Octodon_degus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	82	86.486	ENSODEG00000009802	-	93	86.992	Octodon_degus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.067	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	90.067	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	92	94.878	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.878	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	89.953	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	89.953	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	86	89.883	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	90.104	Oryzias_latipes
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	90.530	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	90.530	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	90.643	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	90.643	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	90.530	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	90.530	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	96.854	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.742	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.742	Ovis_aries
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.855	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	98.855	Pan_paniscus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	96.854	Panthera_pardus
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	96.854	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	97.523	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	97.523	Pan_troglodytes
ENSCAFG00020017397	TNPO1	94	83.287	ENSPTRG00000047731	-	100	83.287	Pan_troglodytes
ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	97.948	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	97.948	Papio_anubis
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