EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020023234 (Gene tree)
Gene ID: 112651695
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1462 bases
Position: chrQKWQ01001938.1:4432243-4433704
Accession: 112651695
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020029818	eRF1_2	PF03464.15	1.9e-37	1	1
ENSCAFP00020029818	eRF1_3	PF03465.15	8.3e-27	1	1
ENSCAFP00020029818	eRF1_1	PF03463.15	2e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020034375	PELO-201	1165	-	ENSCAFP00020029818	385 (aa)	XP_025290792	UPI00004A43F7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.442	ENSG00000152684	PELO	100	98.442	Homo_sapiens
ENSCAFG00020023234	PELO	64	81.377	ENSAPOG00000000616	pelo	90	81.377	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020023234	PELO	64	81.377	ENSAPOG00000023700	-	90	81.377	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	99.740	ENSAMEG00000007734	PELO	100	99.740	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020023234	PELO	97	77.212	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.519	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.519	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.519	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.519	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.558	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020023234	PELO	77	85.570	ENSAPLG00000013265	PELO	100	85.570	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00020023234	PELO	98	90.426	ENSACAG00000004352	PELO	100	90.130	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.701	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020023234	PELO	97	81.233	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.182	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.182	Bos_taurus
ENSCAFG00020023234	PELO	99	58.005	WBGene00011280	pelo-1	100	58.005	Caenorhabditis_elegans
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.701	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.922	ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.922	Capra_hircus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.701	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020023234	PELO	100	99.221	ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.701	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.961	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.701	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.961	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.922	ENSCHOG00000000523	PELO	100	97.922	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020023234	PELO	98	93.883	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020023234	PELO	97	69.437	ENSCING00000001979	-	100	69.870	Ciona_intestinalis
ENSCAFG00020023234	PELO	100	70.390	ENSCSAVG00000006158	-	100	70.390	Ciona_savignyi
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.961	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	95.325	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.325	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020023234	PELO	100	96.623	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.000	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.818	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	Danio_rerio
ENSCAFG00020023234	PELO	100	95.596	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.596	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.442	ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.442	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020023234	PELO	96	67.655	FBgn0011207	pelo	96	67.546	Drosophila_melanogaster
ENSCAFG00020023234	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.961	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.779	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	Esox_lucius
ENSCAFG00020023234	PELO	100	99.481	ENSFCAG00000032341	PELO	100	99.481	Felis_catus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	95.325	ENSFALG00000004559	PELO	100	95.325	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00020023234	PELO	74	97.887	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.887	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.000	ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020023234	PELO	98	79.576	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.481	Gadus_morhua
ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.039	ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.779	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00020023234	PELO	98	94.149	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.961	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.182	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.182	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020023234	PELO	100	95.844	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.844	Heterocephalus_glaber_male
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ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.961	Macaca_nemestrina
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ENSCAFG00020023234	PELO	97	82.842	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	Mastacembelus_armatus
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ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.701	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.403	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.403	Microtus_ochrogaster
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ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.662	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.662	Mus_pahari
ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.403	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.403	Mus_spretus
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ENSCAFG00020023234	PELO	100	94.805	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.805	Notamacropus_eugenii
ENSCAFG00020023234	PELO	98	97.625	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.625	Ochotona_princeps
ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.662	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	Octodon_degus
ENSCAFG00020023234	PELO	96	80.541	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.260	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.558	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes
ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.818	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	ENSOMEG00000021567	pelo	100	82.078	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.442	ENSOGAG00000027940	PELO	100	98.442	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.182	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.182	Ovis_aries
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.961	Pan_paniscus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	99.481	ENSPPRG00000018800	PELO	100	99.481	Panthera_pardus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	99.481	ENSPTIG00000019988	PELO	100	99.481	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.701	Pan_troglodytes
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.961	Papio_anubis
ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.857	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00020023234	PELO	98	93.617	ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	Pelodiscus_sinensis
ENSCAFG00020023234	PELO	67	79.070	ENSPMGG00000014561	pelo	95	79.070	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.143	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00020023234	PELO	100	96.623	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.623	Phascolarctos_cinereus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.818	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	Poecilia_formosa
ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	Poecilia_latipinna
ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.818	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	Poecilia_mexicana
ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	Poecilia_reticulata
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	ENSPPYG00000015451	PELO	96	98.701	Pongo_abelii
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ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.260	Pundamilia_nyererei
ENSCAFG00020023234	PELO	97	81.769	ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.519	Pygocentrus_nattereri
ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.662	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.662	Rattus_norvegicus
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSRBIG00000007299	PELO	100	98.961	Rhinopithecus_bieti
ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.961	Rhinopithecus_roxellana
ENSCAFG00020023234	PELO	98	35.325	YNL001W	-	98	35.325	Saccharomyces_cerevisiae
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