EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020026859 (Gene tree)
Gene ID: 112672969
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27676 bases
Position: chrQKWQ01001844.1:45989676-46017351
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020034673	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.6e-28	1	2
ENSCAFP00020034673	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.6e-28	2	2
ENSCAFP00020034671	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.7e-28	1	2
ENSCAFP00020034671	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.7e-28	2	2
ENSCAFP00020034669	PAP_RNA-bind	PF04926.15	9.1e-28	1	2
ENSCAFP00020034669	PAP_RNA-bind	PF04926.15	9.1e-28	2	2
ENSCAFP00020034665	PAP_RNA-bind	PF04926.15	9.7e-28	1	2
ENSCAFP00020034665	PAP_RNA-bind	PF04926.15	9.7e-28	2	2
ENSCAFP00020034664	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1e-27	1	2
ENSCAFP00020034664	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020040033	PAPOLG-204	2106	-	ENSCAFP00020034671	701 (aa)	-	-
ENSCAFT00020040025	PAPOLG-201	2235	-	ENSCAFP00020034664	744 (aa)	-	-
ENSCAFT00020040026	PAPOLG-202	2211	-	ENSCAFP00020034665	736 (aa)	-	-
ENSCAFT00020040030	PAPOLG-203	2151	-	ENSCAFP00020034669	716 (aa)	-	-
ENSCAFT00020040035	PAPOLG-205	2100	-	ENSCAFP00020034673	699 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSCAFG00020026859's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCAFG00020026859's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	63.239	ENSCAFG00020011550	PAPOLA	97	73.126

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.842	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.155	ENSAPOG00000004798	papolg	99	72.119	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	97.305	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	97.305	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.016	ENSACIG00000010546	papolg	99	71.309	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.829	ENSAOCG00000010254	papolg	89	71.600	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.963	ENSAPEG00000006944	papolg	98	71.294	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.386	ENSATEG00000009007	papolg	99	71.989	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	72.944	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.973	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	81	63.681	ENSACAG00000015048	-	100	63.666	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.378	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	94.244	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	69.610	ENSACLG00000015592	papolg	89	69.520	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.405	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.405	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.252	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	96.252	Bos_taurus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.511	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.511	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	99.059	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	96.373	Canis_familiaris
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	95.716	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.716	Capra_hircus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	95.315	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	95.181	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	55	91.864	ENSCAPG00000014901	-	100	91.864	Cavia_aperea
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.378	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.378	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.715	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.715	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	91	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	95.047	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.047	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.244	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	94.244	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	89	92.922	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.922	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	72	64.752	ENSCING00000024664	-	90	65.844	Ciona_intestinalis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	69	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.580	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	94.580	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	92.287	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	91.340	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	92.287	ENSCGRG00000005552	-	100	91.340	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	70.845	ENSCSEG00000000771	papolg	98	71.955	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	82.162	ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.661	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.787	ENSDARG00000012141	papolg	100	72.644	Danio_rerio
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	92.771	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	91.834	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	60	99.534	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	73.522	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.458	Echinops_telfairi
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	68	56.695	ENSEBUG00000005042	-	81	57.173	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	63	71.094	ENSEBUG00000004020	papolg	90	70.649	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.118	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	96.118	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	95.984	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	95.565	Equus_caballus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	83.534	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.266	Erinaceus_europaeus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	75.186	ENSELUG00000014497	papolg	96	73.913	Esox_lucius
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.519	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	96.519	Felis_catus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	64.954	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	64.954	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.378	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	94.378	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	67	60.646	ENSFHEG00000019080	papolg	90	62.083	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	88	83.456	ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.852	Gadus_morhua
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.623	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	71.623	Gallus_gallus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	68.206	ENSGAFG00000003263	papolg	99	68.979	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.014	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.748	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.110	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	94.110	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	69.610	ENSHBUG00000004882	papolg	89	69.650	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	94.482	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.482	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.906	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	94.906	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	71.763	ENSHCOG00000006782	papolg	89	70.306	Hippocampus_comes
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	74.646	ENSIPUG00000021642	papolg	100	73.425	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.645	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	94.645	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	60	99.301	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.301	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.012	ENSKMAG00000016439	papolg	97	70.874	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	68.401	ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.066	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	70.159	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.159	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.382	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.150	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.458	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.779	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	94.779	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.779	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	94.779	Macaca_mulatta
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	85.904	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	85.904	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.580	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	94.580	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.983	ENSMAMG00000010667	papolg	99	72.040	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	72.496	ENSMZEG00005018140	papolg	99	72.090	Maylandia_zebra
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	70.281	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.281	Meleagris_gallopavo
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	92.287	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	91.340	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.722	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	94.722	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	92.637	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	91.700	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	70.696	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.448	Mola_mola
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	86.835	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	86.835	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.580	ENSMALG00000007012	papolg	98	71.182	Monopterus_albus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.440	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.766	Mus_caroli
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.574	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	Mus_musculus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.173	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	92.236	Mus_pahari
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.173	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	Mus_spretus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	97.450	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	97.450	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	93.817	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	93.011	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.378	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	93.440	Nannospalax_galili
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	62.565	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.081	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	60	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	82	78.082	ENSMEUG00000013605	-	87	78.082	Notamacropus_eugenii
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.244	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	93.440	Ochotona_princeps
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	60	94.313	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	Octodon_degus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	65.282	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.550	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	85.505	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.505	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	95.315	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	94.511	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	70.400	ENSORLG00000001577	papolg	98	70.421	Oryzias_latipes
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	70.455	ENSORLG00020002482	papolg	98	71.020	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	70.400	ENSORLG00015008836	papolg	98	70.421	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	69.415	ENSOMEG00000001406	papolg	99	69.372	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	57	91.220	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	91.220	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	95.716	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	95.716	Ovis_aries
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.842	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	93.842	Pan_paniscus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.519	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	96.519	Panthera_pardus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.386	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.386	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.842	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	93.842	Pan_troglodytes
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	90.387	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	90.387	Papio_anubis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	74.309	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.895	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	98	70.308	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	100	69.402	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	78.476	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.476	Pelodiscus_sinensis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	91.881	ENSPEMG00000008960	-	100	90.934	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	54.178	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.856	Petromyzon_marinus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	71	62.926	ENSPMAG00000004864	-	98	62.926	Petromyzon_marinus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	87.152	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.152	Phascolarctos_cinereus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	68.571	ENSPFOG00000012909	papolg	99	68.848	Poecilia_formosa
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	68.442	ENSPLAG00000018445	papolg	97	68.325	Poecilia_latipinna
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	89	83.243	ENSPMEG00000003961	papolg	97	68.497	Poecilia_mexicana
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	68.807	ENSPREG00000010358	papolg	98	69.251	Poecilia_reticulata
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.976	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.976	Pongo_abelii
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	81.107	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.107	Procavia_capensis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	86.528	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	86.528	Propithecus_coquereli
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	90	94.434	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.681	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.639	ENSPNYG00000006729	papolg	99	72.663	Pundamilia_nyererei
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	73.360	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.360	Pygocentrus_nattereri
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.039	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	92.102	Rattus_norvegicus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	88.353	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	88.353	Rhinopithecus_bieti
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.244	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.244	Rhinopithecus_roxellana
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.511	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.511	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	94	87.201	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.201	Sarcophilus_harrisii
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	63.961	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.549	Scleropages_formosus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	69.986	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.295	Scleropages_formosus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	98	82.616	ENSSMAG00000015598	papolg	99	67.097	Scophthalmus_maximus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	73.757	ENSSDUG00000000912	papolg	99	73.247	Seriola_dumerili
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.193	ENSSLDG00000001217	papolg	99	71.011	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	79.726	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	79.726	Sphenodon_punctatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.845	ENSSPAG00000009004	papolg	99	72.365	Stegastes_partitus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.386	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.386	Sus_scrofa
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	78	76.753	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	100	76.753	Taeniopygia_guttata
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.840	ENSTRUG00000006410	papolg	99	72.840	Takifugu_rubripes
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	66.144	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.144	Tetraodon_nigroviridis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	87.755	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	87.755	Tupaia_belangeri
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	91.432	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	91.432	Tursiops_truncatus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.801	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	97.558	Ursus_americanus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	97.558	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	97.558	Ursus_maritimus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	92.038	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.038	Vicugna_pacos
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	98.925	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	98.925	Vulpes_vulpes
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	74.177	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.177	Xenopus_tropicalis
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	70	85.976	ENSXCOG00000006611	papolg	74	85.200	Xiphophorus_couchianus
ENSCAFG00020026859	PAPOLG	77	82.530	ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.635	Xiphophorus_maculatus