EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020027217 (Gene tree)
Gene ID: 112660784
Gene Symbol: URB2
Alias: KIAA0133|NET10|NPA2
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20919 bases
Position: chrQKWQ01001535.1:9695772-9716690
Accession: 28967
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020035135	Urb2	PF10441.9	4.3e-25	1	1
ENSCAFP00020035134	Urb2	PF10441.9	4.5e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020040563	URB2-202	4197	-	ENSCAFP00020035135	1398 (aa)	-	-
ENSCAFT00020040562	URB2-201	4308	-	ENSCAFP00020035134	1435 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.250	ENSG00000135763	URB2	100	83.333	Homo_sapiens
ENSCAFG00020027217	URB2	94	35.111	ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.180	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	90.352	ENSAMEG00000009206	URB2	93	90.352	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020027217	URB2	94	34.873	ENSAOCG00000019961	urb2	86	34.941	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020027217	URB2	94	34.941	ENSAPEG00000005263	urb2	86	35.010	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020027217	URB2	99	32.878	ENSATEG00000020930	urb2	94	32.837	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	49.655	ENSAPLG00000002998	URB2	96	49.655	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00020027217	URB2	99	46.291	ENSACAG00000001285	URB2	94	46.291	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020027217	URB2	99	82.163	ENSANAG00000033963	URB2	93	82.093	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020027217	URB2	95	34.088	ENSACLG00000009254	urb2	95	33.973	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020027217	URB2	99	34.578	ENSAMXG00000003474	urb2	93	34.578	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	72.944	ENSBTAG00000010180	URB2	93	72.944	Bos_taurus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.601	ENSCJAG00000010968	URB2	93	87.234	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	99.719	ENSCAFG00000012118	URB2	93	99.719	Canis_familiaris
ENSCAFG00020027217	URB2	99	73.226	ENSCHIG00000014513	URB2	93	73.226	Capra_hircus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	78.988	ENSTSYG00000006924	URB2	93	78.988	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020027217	URB2	61	74.107	ENSCPOG00000020777	-	90	71.736	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	82.120	ENSCCAG00000023932	URB2	93	81.812	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.975	ENSCATG00000043366	URB2	93	81.975	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020027217	URB2	99	73.577	ENSCLAG00000006268	URB2	93	73.577	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.812	ENSCSAG00000010599	URB2	93	81.812	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020027217	URB2	69	81.268	ENSCHOG00000010163	URB2	67	81.268	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020027217	URB2	99	53.005	ENSCPBG00000006191	URB2	94	53.005	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.882	ENSCANG00000023711	URB2	93	81.882	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	70.997	ENSCGRG00001009591	Urb2	93	70.997	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020027217	URB2	99	70.997	ENSCGRG00000011259	Urb2	93	70.997	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020027217	URB2	83	50.455	ENSCSEG00000000299	urb2	80	50.455	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020027217	URB2	98	33.003	ENSCVAG00000011011	urb2	93	32.980	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	35.197	ENSDARG00000003217	urb2	93	35.420	Danio_rerio
ENSCAFG00020027217	URB2	99	58.931	ENSDNOG00000043064	URB2	96	59.001	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	72.670	ENSDORG00000014975	Urb2	93	72.670	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020027217	URB2	94	73.013	ENSETEG00000002869	URB2	88	73.013	Echinops_telfairi
ENSCAFG00020027217	URB2	99	82.853	ENSEASG00005012060	URB2	93	82.853	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020027217	URB2	93	91.489	ENSECAG00000012338	URB2	93	91.489	Equus_caballus
ENSCAFG00020027217	URB2	93	82.979	ENSEEUG00000002669	URB2	86	82.979	Erinaceus_europaeus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	37.688	ENSELUG00000014647	urb2	99	37.517	Esox_lucius
ENSCAFG00020027217	URB2	99	84.025	ENSFCAG00000007662	URB2	93	84.025	Felis_catus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	48.624	ENSFALG00000003385	URB2	94	48.656	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00020027217	URB2	99	73.315	ENSFDAG00000021079	URB2	93	73.315	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020027217	URB2	98	33.247	ENSFHEG00000010357	urb2	93	33.268	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020027217	URB2	89	37.143	ENSGMOG00000012459	urb2	92	33.723	Gadus_morhua
ENSCAFG00020027217	URB2	99	49.898	ENSGALG00000011101	URB2	94	49.830	Gallus_gallus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	34.908	ENSGACG00000016179	urb2	93	34.973	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	53.187	ENSGAGG00000021879	URB2	94	53.187	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.531	ENSGGOG00000025643	URB2	93	81.531	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020027217	URB2	95	34.405	ENSHBUG00000018469	urb2	87	34.223	Haplochromis_burtoni
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ENSCAFG00020027217	URB2	99	72.472	ENSHGLG00100001838	URB2	93	72.472	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020027217	URB2	99	34.323	ENSIPUG00000020315	urb2	93	34.438	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	72.804	ENSSTOG00000025323	URB2	93	72.804	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSCAFG00020027217	URB2	99	31.821	ENSKMAG00000020129	urb2	95	31.652	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00020027217	URB2	99	44.634	ENSLACG00000002038	URB2	94	45.318	Latimeria_chalumnae
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ENSCAFG00020027217	URB2	99	77.161	ENSLAFG00000012484	URB2	93	77.161	Loxodonta_africana
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ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.461	ENSMNEG00000038762	URB2	93	81.461	Macaca_nemestrina
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ENSCAFG00020027217	URB2	98	32.678	ENSOMEG00000010076	urb2	93	32.700	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00020027217	URB2	99	75.913	ENSOGAG00000003021	URB2	93	75.913	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020027217	URB2	99	73.015	ENSOARG00000003102	URB2	93	73.015	Ovis_aries
ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.601	ENSPPAG00000040629	URB2	93	81.601	Pan_paniscus
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ENSCAFG00020027217	URB2	94	90.909	ENSPTIG00000012577	URB2	93	90.909	Panthera_tigris_altaica
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ENSCAFG00020027217	URB2	99	79.424	ENSPANG00000002245	URB2	93	79.424	Papio_anubis
ENSCAFG00020027217	URB2	99	37.766	ENSPKIG00000005787	urb2	94	37.654	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00020027217	URB2	99	52.793	ENSPSIG00000002690	URB2	94	52.793	Pelodiscus_sinensis
ENSCAFG00020027217	URB2	94	69.779	ENSPEMG00000019551	Urb2	93	69.779	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00020027217	URB2	99	62.596	ENSPCIG00000030071	URB2	94	62.596	Phascolarctos_cinereus
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ENSCAFG00020027217	URB2	99	35.428	ENSPNAG00000013684	urb2	93	35.428	Pygocentrus_nattereri
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