EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020027568 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24205 bases
Position: chrQKWQ01000558.1:10166684-10190888
Accession: 112661213
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020035634	MMR_HSR1	PF01926.23	9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020041153	SRPRB-201	1893	XM_025449124	ENSCAFP00020035634	271 (aa)	XP_025304909	UPI00005A435C

Gene Model

Click here to download ENSCAFG00020027568's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCAFG00020027568's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSG00000144867	SRPRB	99	97.484	Homo_sapiens
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	90.775	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	90.775	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	94.465	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	94.465	Bos_taurus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	90.775	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.775	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	93.358	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	93.358	Capra_hircus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	88.930	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	88.561	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	81.919	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	81.919	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	88.561	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	88.561	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	92.989	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	88.930	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.930	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	92.989	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	84.133	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	84.133	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	76.015	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	76.015	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	89.299	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	88.930	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020027568	SRPRB	95	90.698	ENSCGRG00000014367	Srprb	97	91.700	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	89.668	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	89.668	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	90	80.392	ENSDORG00000000764	Srprb	85	88.584	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	94.096	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	94.096	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	94.096	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	94.096	Equus_caballus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	95.203	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	95.203	Felis_catus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	88.930	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.930	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	93.358	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	93.358	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	90.037	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	90.037	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	90.037	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	90.037	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	84.502	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.502	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	92.989	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	92.989	Macaca_mulatta
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	92.989	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	92.989	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	89.668	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	89.299	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	91.144	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	91.144	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	85.240	ENSMODG00000018493	SRPRB	95	87.795	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	89.668	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	89.299	Mus_caroli
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	89.668	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	89.299	Mus_musculus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	90.775	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	90.406	Mus_pahari
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	90.406	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	90.037	Mus_spretus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	94.465	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	94.465	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	88.930	ENSNGAG00000024311	-	94	91.339	Nannospalax_galili
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.251	ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	92.251	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	89.299	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	89.299	Octodon_degus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.620	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	92.620	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	90.775	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	90.775	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020027568	SRPRB	85	90.435	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	94.064	Ovis_aries
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	92.989	Pan_paniscus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	95.203	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	95.203	Panthera_pardus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	95.203	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	95.203	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	92.989	Pan_troglodytes
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.620	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	92.620	Papio_anubis
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	89.299	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	88.930	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.620	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	92.620	Pongo_abelii
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	80.812	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	80.443	Procavia_capensis
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	95.203	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	95.203	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	92.989	Rhinopithecus_bieti
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.989	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	92.989	Rhinopithecus_roxellana
ENSCAFG00020027568	SRPRB	74	88.060	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.251	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.251	Sorex_araneus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.251	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	92.251	Sus_scrofa
ENSCAFG00020027568	SRPRB	99	88.476	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	Tupaia_belangeri
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	85.978	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	85.978	Tursiops_truncatus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	94.465	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	94.465	Ursus_americanus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	94.096	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	94.096	Ursus_maritimus
ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	99.262	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	99.262	Vulpes_vulpes