EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCANG00000028883 (Gene tree)
Gene ID: 105511660
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Colobus_angolensis_palliatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 64047 bases
Position: chrKN980508.1:5393783-5457829
Accession: 105511660
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCANP00000011125	CRM1_C	PF08767.11	3.1e-134	1	1
ENSCANP00000011189	CRM1_C	PF08767.11	1.2e-133	1	1
ENSCANP00000011189	Xpo1	PF08389.12	8.4e-42	1	1
ENSCANP00000011189	IBN_N	PF03810.19	3.5e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCANT00000034085	XPO1-202	3099	XM_011941837	ENSCANP00000011189	1032 (aa)	XP_011797227	A0A2K5I3H1
ENSCANT00000034020	XPO1-201	4663	-	ENSCANP00000011125	564 (aa)	-	A0A2K5I3A9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCANG00000028883	XPO1	100	100.000	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.390	ENSAPOG00000004984	-	100	91.503	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCANG00000028883	XPO1	96	91.095	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	85.213	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	94.590	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.844	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	87.660	Amphilophus_citrinellus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.213	ENSACIG00000010818	-	100	91.170	Amphilophus_citrinellus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.489	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	87.395	Amphiprion_ocellaris
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.390	ENSAOCG00000010121	-	100	91.503	Amphiprion_ocellaris
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.390	ENSAPEG00000007038	-	100	91.503	Amphiprion_percula
ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.489	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	87.436	Amphiprion_percula
ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.667	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	87.115	Anabas_testudineus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.390	ENSATEG00000008816	-	100	91.503	Anabas_testudineus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.404	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	94.398	Anas_platyrhynchos
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.227	ENSACAG00000002501	XPO1	100	94.211	Anolis_carolinensis
ENSCANG00000028883	XPO1	100	100.000	ENSANAG00000020802	XPO1	100	95.705	Aotus_nancymaae
ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.844	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	87.766	Astatotilapia_calliptera
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.213	ENSACLG00000015192	-	100	91.317	Astatotilapia_calliptera
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.922	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	91.783	Astyanax_mexicanus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	94.326	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	88.559	Astyanax_mexicanus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	94.678	Bos_taurus
ENSCANG00000028883	XPO1	99	54.336	WBGene00002078	xpo-1	99	50.277	Caenorhabditis_elegans
ENSCANG00000028883	XPO1	100	100.000	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.705	Callithrix_jacchus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	94.678	Canis_familiaris
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	94.177	Canis_lupus_dingo
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	94.678	Capra_hircus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	94.678	Carlito_syrichta
ENSCANG00000028883	XPO1	100	93.972	ENSCAPG00000006454	-	100	93.972	Cavia_aperea
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	93.277	Cavia_porcellus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	83.734	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	83.734	Cebus_capucinus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	100.000	ENSCATG00000032674	XPO1	100	95.106	Cercocebus_atys
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	94.491	Chinchilla_lanigera
ENSCANG00000028883	XPO1	100	100.000	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.705	Chlorocebus_sabaeus
ENSCANG00000028883	XPO1	82	94.828	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	94.828	Choloepus_hoffmanni
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.227	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	94.304	Chrysemys_picta_bellii
ENSCANG00000028883	XPO1	100	83.688	ENSCING00000024562	-	100	78.378	Ciona_intestinalis
ENSCANG00000028883	XPO1	100	82.270	ENSCSAVG00000005965	-	99	77.477	Ciona_savignyi
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	93.838	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	93.838	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCANG00000028883	XPO1	100	93.972	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	90.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.567	ENSCVAG00000016788	-	100	91.410	Cyprinodon_variegatus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.844	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	86.928	Cyprinodon_variegatus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	96.454	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	92.157	Danio_rerio
ENSCANG00000028883	XPO1	100	92.021	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	88.515	Danio_rerio
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	94.585	Dasypus_novemcinctus
ENSCANG00000028883	XPO1	91	90.817	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	90.817	Dipodomys_ordii
ENSCANG00000028883	XPO1	99	73.179	FBgn0020497	emb	99	69.606	Drosophila_melanogaster
ENSCANG00000028883	XPO1	94	96.344	ENSETEG00000018045	XPO1	94	96.344	Echinops_telfairi
ENSCANG00000028883	XPO1	100	88.673	ENSEBUG00000012580	-	97	85.714	Eptatretus_burgeri
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSEASG00005007223	XPO1	100	94.678	Equus_asinus_asinus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSECAG00000024920	XPO1	100	94.678	Equus_caballus
ENSCANG00000028883	XPO1	92	91.667	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	Erinaceus_europaeus
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ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	94.678	Felis_catus
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ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	92.904	Fukomys_damarensis
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ENSCANG00000028883	XPO1	85	96.907	ENSFHEG00000018974	-	98	96.907	Fundulus_heteroclitus
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ENSCANG00000028883	XPO1	100	93.972	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	89.356	Ictalurus_punctatus
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ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.390	ENSKMAG00000016218	-	100	91.223	Kryptolebias_marmoratus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.213	ENSLBEG00000005740	-	100	91.503	Labrus_bergylta
ENSCANG00000028883	XPO1	100	90.669	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	84.958	Labrus_bergylta
ENSCANG00000028883	XPO1	100	72.946	ENSLACG00000018213	XPO1	100	72.946	Latimeria_chalumnae
ENSCANG00000028883	XPO1	100	96.099	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	92.157	Lepisosteus_oculatus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	97.872	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	94.304	Loxodonta_africana
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ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.489	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	87.395	Mastacembelus_armatus
ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.213	ENSMAMG00000010568	-	100	91.317	Mastacembelus_armatus
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ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.844	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	87.582	Maylandia_zebra
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ENSCANG00000028883	XPO1	100	96.631	ENSMODG00000002831	XPO1	100	93.371	Monodelphis_domestica
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