EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCANG00000029513 (Gene tree)
Gene ID: 105503735
Gene Symbol: IPO4
Alias: FLJ23338|Imp4
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Colobus_angolensis_palliatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9404 bases
Position: chrKN985855.1:3734597-3744000
Accession: 105503735
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCANP00000012494	IBN_N	PF03810.19	5.6e-10	1	1
ENSCANP00000012470	IBN_N	PF03810.19	1e-09	1	1
ENSCANP00000012484	IBN_N	PF03810.19	6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCANT00000035403	IPO4-203	297	-	ENSCANP00000012494	98 (aa)	-	A0A2K5I790
ENSCANT00000035393	IPO4-202	3264	XM_011930776	ENSCANP00000012484	1087 (aa)	XP_011786166	A0A2K5I779
ENSCANT00000035379	IPO4-201	4011	XM_011930775	ENSCANP00000012470	1081 (aa)	XP_011786165	A0A2K5I768

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCANG00000029513	IPO4	100	97.225	ENSG00000196497	IPO4	100	97.225	Homo_sapiens
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.245	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	45.294	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	84.288	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	83.826	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.321	ENSACIG00000004246	ipo4	98	45.116	Amphilophus_citrinellus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.904	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	44.856	Amphiprion_ocellaris
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.904	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	44.856	Amphiprion_percula
ENSCANG00000029513	IPO4	92	45.418	ENSATEG00000017082	ipo4	99	45.717	Anabas_testudineus
ENSCANG00000029513	IPO4	86	53.717	ENSACAG00000003973	-	98	54.584	Anolis_carolinensis
ENSCANG00000029513	IPO4	100	94.635	ENSANAG00000037973	IPO4	100	94.542	Aotus_nancymaae
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.424	ENSACLG00000019742	ipo4	99	44.424	Astatotilapia_calliptera
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.968	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.548	Astyanax_mexicanus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	90.287	ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.287	Bos_taurus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	94.898	ENSCJAG00000006937	IPO4	100	94.898	Callithrix_jacchus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	92.044	ENSCAFG00000012049	IPO4	100	91.674	Canis_familiaris
ENSCANG00000029513	IPO4	98	90.909	ENSCAFG00020002873	IPO4	100	88.720	Canis_lupus_dingo
ENSCANG00000029513	IPO4	99	90.648	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	90.648	Capra_hircus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	92.857	ENSTSYG00000002643	IPO4	100	92.857	Carlito_syrichta
ENSCANG00000029513	IPO4	100	88.714	ENSCPOG00000014783	IPO4	100	88.437	Cavia_porcellus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	96.939	ENSCCAG00000037929	IPO4	100	96.939	Cebus_capucinus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	98.980	ENSCATG00000040395	IPO4	100	98.980	Cercocebus_atys
ENSCANG00000029513	IPO4	100	89.917	ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.009	Chinchilla_lanigera
ENSCANG00000029513	IPO4	90	56.193	ENSCPBG00000025757	IPO4	94	55.992	Chrysemys_picta_bellii
ENSCANG00000029513	IPO4	92	37.241	ENSCING00000008639	-	96	36.538	Ciona_intestinalis
ENSCANG00000029513	IPO4	94	35.838	ENSCSAVG00000011482	-	100	35.203	Ciona_savignyi
ENSCANG00000029513	IPO4	100	83.626	ENSCGRG00001001217	Ipo4	100	83.626	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCANG00000029513	IPO4	100	83.626	ENSCGRG00000014404	Ipo4	100	83.626	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCANG00000029513	IPO4	99	43.606	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	43.454	Cynoglossus_semilaevis
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.516	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.240	Cyprinodon_variegatus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	46.895	ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.773	Danio_rerio
ENSCANG00000029513	IPO4	100	90.379	ENSDNOG00000000366	IPO4	100	90.379	Dasypus_novemcinctus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	89.824	ENSDORG00000009274	Ipo4	100	89.824	Dipodomys_ordii
ENSCANG00000029513	IPO4	100	87.996	ENSETEG00000018381	IPO4	100	87.996	Echinops_telfairi
ENSCANG00000029513	IPO4	99	87.629	ENSEASG00005011954	IPO4	96	91.743	Equus_asinus_asinus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	92.137	ENSECAG00000009909	IPO4	100	91.767	Equus_caballus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	47.107	ENSELUG00000020628	ipo4	99	47.081	Esox_lucius
ENSCANG00000029513	IPO4	100	92.322	ENSFCAG00000005587	IPO4	100	91.952	Felis_catus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	82.472	ENSFDAG00000000725	IPO4	100	81.777	Fukomys_damarensis
ENSCANG00000029513	IPO4	99	40.205	ENSFHEG00000009351	ipo4	94	47.107	Fundulus_heteroclitus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.998	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.953	Gadus_morhua
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.088	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.259	Gambusia_affinis
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.998	ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.860	Gasterosteus_aculeatus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	97.959	ENSGGOG00000016062	IPO4	100	97.959	Gorilla_gorilla
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.530	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	45.302	Haplochromis_burtoni
ENSCANG00000029513	IPO4	100	89.454	ENSHGLG00000002923	IPO4	100	89.454	Heterocephalus_glaber_female
ENSCANG00000029513	IPO4	100	89.084	ENSHGLG00100003725	IPO4	100	89.084	Heterocephalus_glaber_male
ENSCANG00000029513	IPO4	99	43.841	ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.956	Hippocampus_comes
ENSCANG00000029513	IPO4	99	46.869	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.698	Ictalurus_punctatus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	91.582	ENSSTOG00000002288	IPO4	100	91.489	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	87.431	ENSJJAG00000019002	Ipo4	100	87.338	Jaculus_jaculus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.241	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	44.341	Kryptolebias_marmoratus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	44.739	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.888	Labrus_bergylta
ENSCANG00000029513	IPO4	99	50.046	ENSLACG00000001428	IPO4	98	50.230	Latimeria_chalumnae
ENSCANG00000029513	IPO4	90	35.484	ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.090	Lepisosteus_oculatus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	87.697	ENSLAFG00000015852	IPO4	100	87.142	Loxodonta_africana
ENSCANG00000029513	IPO4	100	98.980	ENSMFAG00000000743	IPO4	100	98.980	Macaca_fascicularis
ENSCANG00000029513	IPO4	100	98.980	ENSMMUG00000012481	IPO4	100	98.980	Macaca_mulatta
ENSCANG00000029513	IPO4	100	98.980	ENSMNEG00000043531	IPO4	100	98.980	Macaca_nemestrina
ENSCANG00000029513	IPO4	100	98.980	ENSMLEG00000042067	IPO4	100	98.980	Mandrillus_leucophaeus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.018	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.065	Mastacembelus_armatus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.253	ENSMZEG00005017273	ipo4	99	45.302	Maylandia_zebra
ENSCANG00000029513	IPO4	100	82.070	ENSMAUG00000017565	Ipo4	100	82.440	Mesocricetus_auratus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	91.837	ENSMICG00000001719	IPO4	100	91.837	Microcebus_murinus
ENSCANG00000029513	IPO4	96	85.106	ENSMOCG00000020462	Ipo4	100	81.146	Microtus_ochrogaster
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.444	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	44.486	Mola_mola
ENSCANG00000029513	IPO4	99	73.679	ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.494	Monodelphis_domestica
ENSCANG00000029513	IPO4	99	43.802	ENSMALG00000001587	ipo4	99	43.547	Monopterus_albus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	85.714	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	85.714	Mus_caroli
ENSCANG00000029513	IPO4	100	83.673	ENSMUSG00000002319	Ipo4	100	83.673	Mus_musculus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	84.694	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	100	84.694	Mus_pahari
ENSCANG00000029513	IPO4	100	84.694	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	100	84.694	Mus_spretus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	91.582	ENSMPUG00000005916	IPO4	100	91.397	Mustela_putorius_furo
ENSCANG00000029513	IPO4	99	87.778	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	88.241	Myotis_lucifugus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	88.714	ENSNGAG00000019340	Ipo4	100	88.622	Nannospalax_galili
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.799	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.853	Neolamprologus_brichardi
ENSCANG00000029513	IPO4	100	96.939	ENSNLEG00000015326	IPO4	100	96.939	Nomascus_leucogenys
ENSCANG00000029513	IPO4	100	88.366	ENSOPRG00000016615	IPO4	100	88.181	Ochotona_princeps
ENSCANG00000029513	IPO4	100	88.714	ENSODEG00000002609	IPO4	100	88.437	Octodon_degus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.714	ENSONIG00000014574	ipo4	99	45.488	Oreochromis_niloticus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	88.458	ENSOCUG00000002881	IPO4	100	88.643	Oryctolagus_cuniculus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.802	ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.986	Oryzias_latipes
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.253	ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.744	Oryzias_latipes_hni
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.530	ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.080	Oryzias_latipes_hsok
ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.074	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	45.074	Oryzias_melastigma
ENSCANG00000029513	IPO4	99	91.103	ENSOGAG00000010642	IPO4	100	90.732	Otolemur_garnettii
ENSCANG00000029513	IPO4	100	88.632	ENSOARG00000019188	IPO4	100	88.632	Ovis_aries
ENSCANG00000029513	IPO4	100	96.939	ENSPPAG00000035476	IPO4	100	96.939	Pan_paniscus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	92.229	ENSPPRG00000023607	IPO4	100	91.859	Panthera_pardus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	92.322	ENSPTIG00000008720	IPO4	100	91.952	Panthera_tigris_altaica
ENSCANG00000029513	IPO4	100	97.132	ENSPTRG00000006200	IPO4	100	97.132	Pan_troglodytes
ENSCANG00000029513	IPO4	100	98.980	ENSPANG00000026278	IPO4	100	98.980	Papio_anubis
ENSCANG00000029513	IPO4	99	46.481	ENSPKIG00000007683	-	98	46.449	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCANG00000029513	IPO4	99	48.070	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	48.145	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCANG00000029513	IPO4	99	43.882	ENSPMGG00000020871	ipo4	95	44.706	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCANG00000029513	IPO4	96	86.170	ENSPEMG00000016160	Ipo4	100	82.255	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCANG00000029513	IPO4	96	76.596	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	76.326	Phascolarctos_cinereus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.771	ENSPFOG00000009255	ipo4	99	44.764	Poecilia_formosa
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.862	ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.856	Poecilia_latipinna
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.771	ENSPMEG00000013102	ipo4	99	44.764	Poecilia_mexicana
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.771	ENSPREG00000017605	ipo4	99	44.764	Poecilia_reticulata
ENSCANG00000029513	IPO4	100	97.502	ENSPPYG00000005688	IPO4	100	97.502	Pongo_abelii
ENSCANG00000029513	IPO4	99	88.344	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	88.159	Procavia_capensis
ENSCANG00000029513	IPO4	100	92.857	ENSPCOG00000015319	IPO4	100	92.857	Propithecus_coquereli
ENSCANG00000029513	IPO4	100	91.304	ENSPVAG00000010755	IPO4	100	91.212	Pteropus_vampyrus
ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.885	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	45.023	Pundamilia_nyererei
ENSCANG00000029513	IPO4	99	46.907	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	46.971	Pygocentrus_nattereri
ENSCANG00000029513	IPO4	100	82.717	ENSRNOG00000019553	Ipo4	100	82.717	Rattus_norvegicus
ENSCANG00000029513	IPO4	100	100.000	ENSRBIG00000027704	IPO4	100	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSCANG00000029513	IPO4	100	100.000	ENSRROG00000011492	IPO4	100	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSCANG00000029513	IPO4	100	96.939	ENSSBOG00000020162	IPO4	100	96.939	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCANG00000029513	IPO4	99	73.475	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.383	Sarcophilus_harrisii
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