EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCANG00000037322 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Colobus_angolensis_palliatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14212 bases
Position: chrKN982681.1:16106564-16120775
Accession: 105521413
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCANP00000027858	SYF2	PF08231.12	2.2e-38	1	2
ENSCANP00000027858	SYF2	PF08231.12	2.2e-38	2	2
ENSCANP00000027853	SYF2	PF08231.12	1.9e-36	1	2
ENSCANP00000027853	SYF2	PF08231.12	1.9e-36	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCANT00000050877	SYF2-202	507	-	ENSCANP00000027858	168 (aa)	-	A0A2K5JG25
ENSCANT00000050872	SYF2-201	633	XM_011955635	ENSCANP00000027853	210 (aa)	XP_011811025	A0A2K5JG20

Gene Model

Click here to download ENSCANG00000037322's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCANG00000037322's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCANG00000037322	SYF2	100	83.951	ENSG00000117614	SYF2	100	83.951	Homo_sapiens
ENSCANG00000037322	SYF2	89	73.059	ENSAPOG00000001174	syf2	99	70.339	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCANG00000037322	SYF2	98	79.253	ENSAMEG00000010115	-	99	79.253	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCANG00000037322	SYF2	77	81.026	ENSAMEG00000010134	-	100	81.026	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCANG00000037322	SYF2	89	71.233	ENSACIG00000023688	syf2	88	71.233	Amphilophus_citrinellus
ENSCANG00000037322	SYF2	86	68.493	ENSAOCG00000010912	syf2	68	68.493	Amphiprion_ocellaris
ENSCANG00000037322	SYF2	98	69.748	ENSAOCG00000022046	syf2	99	69.748	Amphiprion_ocellaris
ENSCANG00000037322	SYF2	94	70.763	ENSAPEG00000018858	syf2	91	70.763	Amphiprion_percula
ENSCANG00000037322	SYF2	88	72.350	ENSATEG00000007745	syf2	99	69.492	Anabas_testudineus
ENSCANG00000037322	SYF2	80	76.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	76.500	Anas_platyrhynchos
ENSCANG00000037322	SYF2	74	62.658	ENSACAG00000026777	-	95	62.658	Anolis_carolinensis
ENSCANG00000037322	SYF2	81	73.529	ENSACAG00000013653	-	100	73.529	Anolis_carolinensis
ENSCANG00000037322	SYF2	100	83.539	ENSANAG00000032473	SYF2	100	83.539	Aotus_nancymaae
ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	ENSACLG00000019916	syf2	100	67.227	Astatotilapia_calliptera
ENSCANG00000037322	SYF2	88	72.936	ENSAMXG00000004051	syf2	92	72.936	Astyanax_mexicanus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.776	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	80.085	Bos_taurus
ENSCANG00000037322	SYF2	83	45.714	WBGene00019402	syf-2	99	41.631	Caenorhabditis_elegans
ENSCANG00000037322	SYF2	100	83.951	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	83.951	Callithrix_jacchus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	69.136	ENSCAFG00000030331	-	100	69.136	Canis_familiaris
ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.508	ENSCAFG00000012895	-	99	79.508	Canis_familiaris
ENSCANG00000037322	SYF2	93	69.474	ENSCAFG00020021094	-	97	69.474	Canis_lupus_dingo
ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.508	ENSCAFG00020021091	-	99	79.508	Canis_lupus_dingo
ENSCANG00000037322	SYF2	100	77.778	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	79.498	Capra_hircus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.835	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	79.835	Carlito_syrichta
ENSCANG00000037322	SYF2	79	81.313	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.313	Cavia_aperea
ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.508	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	79.508	Cavia_porcellus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	83.951	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	83.951	Cebus_capucinus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.008	ENSCATG00000026917	SYF2	100	86.008	Cercocebus_atys
ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.738	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	80.738	Chinchilla_lanigera
ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.008	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	86.008	Chlorocebus_sabaeus
ENSCANG00000037322	SYF2	69	73.611	ENSCHOG00000005273	-	77	70.139	Choloepus_hoffmanni
ENSCANG00000037322	SYF2	91	79.018	ENSCPBG00000025073	SYF2	93	77.922	Chrysemys_picta_bellii
ENSCANG00000037322	SYF2	85	47.418	ENSCING00000003017	-	89	47.418	Ciona_intestinalis
ENSCANG00000037322	SYF2	95	39.175	ENSCSAVG00000006627	-	97	44.601	Ciona_savignyi
ENSCANG00000037322	SYF2	100	77.778	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.778	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCANG00000037322	SYF2	78	80.612	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.402	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCANG00000037322	SYF2	88	67.890	ENSCSEG00000000117	syf2	100	62.551	Cynoglossus_semilaevis
ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	ENSCVAG00000019543	syf2	99	67.932	Cyprinodon_variegatus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	69.167	ENSDARG00000004706	syf2	100	69.167	Danio_rerio
ENSCANG00000037322	SYF2	99	80.247	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	80.247	Dasypus_novemcinctus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	78.512	ENSDORG00000001274	Syf2	99	78.512	Dipodomys_ordii
ENSCANG00000037322	SYF2	88	51.364	FBgn0033556	CG12343	97	49.545	Drosophila_melanogaster
ENSCANG00000037322	SYF2	93	74.236	ENSETEG00000015729	SYF2	100	75.109	Echinops_telfairi
ENSCANG00000037322	SYF2	87	51.205	ENSEBUG00000015402	syf2	95	56.906	Eptatretus_burgeri
ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.083	ENSEASG00005004232	-	100	80.083	Equus_asinus_asinus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.098	ENSEASG00005004224	-	100	79.098	Equus_asinus_asinus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.367	ENSECAG00000012023	-	100	78.367	Equus_caballus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	80.083	ENSECAG00000010440	-	99	80.083	Equus_caballus
ENSCANG00000037322	SYF2	73	77.922	ENSEEUG00000015084	SYF2	84	77.922	Erinaceus_europaeus
ENSCANG00000037322	SYF2	96	69.328	ENSELUG00000003465	syf2	100	69.328	Esox_lucius
ENSCANG00000037322	SYF2	99	80.328	ENSFCAG00000043095	-	99	80.328	Felis_catus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.408	ENSFCAG00000010324	-	85	80.408	Felis_catus
ENSCANG00000037322	SYF2	81	73.529	ENSFALG00000000460	SYF2	93	71.552	Ficedula_albicollis
ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.247	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	80.247	Fukomys_damarensis
ENSCANG00000037322	SYF2	89	56.881	ENSFHEG00000007238	syf2	97	56.881	Fundulus_heteroclitus
ENSCANG00000037322	SYF2	88	72.477	ENSGMOG00000019138	syf2	96	73.488	Gadus_morhua
ENSCANG00000037322	SYF2	91	76.786	ENSGALG00000013639	SYF2	99	72.000	Gallus_gallus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	65.975	ENSGAFG00000019435	syf2	99	64.730	Gambusia_affinis
ENSCANG00000037322	SYF2	87	72.093	ENSGACG00000007305	syf2	90	72.093	Gasterosteus_aculeatus
ENSCANG00000037322	SYF2	91	78.571	ENSGAGG00000010670	SYF2	93	77.489	Gopherus_agassizii
ENSCANG00000037322	SYF2	100	84.362	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	84.362	Gorilla_gorilla
ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	ENSHBUG00000020477	syf2	100	67.227	Haplochromis_burtoni
ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.328	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	80.328	Heterocephalus_glaber_female
ENSCANG00000037322	SYF2	92	69.163	ENSHGLG00000004304	-	99	66.250	Heterocephalus_glaber_female
ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.328	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	80.328	Heterocephalus_glaber_male
ENSCANG00000037322	SYF2	97	67.220	ENSHCOG00000012904	syf2	79	67.220	Hippocampus_comes
ENSCANG00000037322	SYF2	90	72.851	ENSIPUG00000019859	syf2	93	72.851	Ictalurus_punctatus
ENSCANG00000037322	SYF2	54	96.491	ENSSTOG00000023984	SYF2	78	96.491	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCANG00000037322	SYF2	79	81.407	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.407	Jaculus_jaculus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	67.500	ENSKMAG00000013856	syf2	99	67.500	Kryptolebias_marmoratus
ENSCANG00000037322	SYF2	98	63.750	ENSLBEG00000014425	syf2	99	69.068	Labrus_bergylta
ENSCANG00000037322	SYF2	99	70.417	ENSLACG00000012064	SYF2	99	70.417	Latimeria_chalumnae
ENSCANG00000037322	SYF2	99	69.710	ENSLOCG00000002728	syf2	92	70.213	Lepisosteus_oculatus
ENSCANG00000037322	SYF2	71	55.978	ENSLAFG00000030814	-	100	55.978	Loxodonta_africana
ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.184	ENSLAFG00000023150	-	100	79.184	Loxodonta_africana
ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.420	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	86.420	Macaca_fascicularis
ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.008	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	86.008	Macaca_mulatta
ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.420	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	86.420	Macaca_nemestrina
ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.008	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	86.008	Mandrillus_leucophaeus
ENSCANG00000037322	SYF2	88	71.429	ENSMAMG00000010403	syf2	100	65.574	Mastacembelus_armatus
ENSCANG00000037322	SYF2	94	68.220	ENSMZEG00005006429	syf2	99	68.220	Maylandia_zebra
ENSCANG00000037322	SYF2	79	76.884	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	76.884	Meleagris_gallopavo
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.189	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.189	Mesocricetus_auratus
ENSCANG00000037322	SYF2	86	78.652	ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.407	Microcebus_murinus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.601	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	78.601	Microtus_ochrogaster
ENSCANG00000037322	SYF2	89	69.863	ENSMMOG00000002396	syf2	92	69.863	Mola_mola
ENSCANG00000037322	SYF2	92	76.316	ENSMODG00000013951	-	99	76.652	Monodelphis_domestica
ENSCANG00000037322	SYF2	94	68.354	ENSMALG00000010706	syf2	98	67.932	Monopterus_albus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.601	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	78.601	Mus_caroli
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.601	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	78.601	Mus_musculus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.601	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	78.601	Mus_pahari
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.601	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	78.601	Mus_spretus
ENSCANG00000037322	SYF2	98	80.000	ENSMPUG00000015801	-	98	80.000	Mustela_putorius_furo
ENSCANG00000037322	SYF2	99	80.328	ENSMPUG00000015802	-	99	80.328	Mustela_putorius_furo
ENSCANG00000037322	SYF2	98	79.583	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	79.583	Myotis_lucifugus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.862	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.862	Nannospalax_galili
ENSCANG00000037322	SYF2	96	67.727	ENSNBRG00000010720	syf2	100	67.727	Neolamprologus_brichardi
ENSCANG00000037322	SYF2	100	84.774	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	84.774	Nomascus_leucogenys
ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.835	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.835	Ochotona_princeps
ENSCANG00000037322	SYF2	95	78.924	ENSODEG00000014338	-	98	78.924	Octodon_degus
ENSCANG00000037322	SYF2	95	81.116	ENSODEG00000017664	-	98	81.116	Octodon_degus
ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	ENSONIG00000008213	syf2	100	67.227	Oreochromis_niloticus
ENSCANG00000037322	SYF2	80	77.228	ENSOANG00000009552	SYF2	100	77.228	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	81.967	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	81.967	Oryctolagus_cuniculus
ENSCANG00000037322	SYF2	89	71.689	ENSORLG00000028820	syf2	94	71.689	Oryzias_latipes
ENSCANG00000037322	SYF2	99	67.500	ENSORLG00020018333	syf2	100	67.500	Oryzias_latipes_hni
ENSCANG00000037322	SYF2	99	67.083	ENSORLG00015014665	syf2	100	67.083	Oryzias_latipes_hsok
ENSCANG00000037322	SYF2	96	68.908	ENSOMEG00000013911	syf2	100	68.908	Oryzias_melastigma
ENSCANG00000037322	SYF2	99	80.165	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	80.165	Otolemur_garnettii
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.947	ENSOARG00000006348	-	100	78.947	Ovis_aries
ENSCANG00000037322	SYF2	77	56.410	ENSOARG00000006269	-	100	55.385	Ovis_aries
ENSCANG00000037322	SYF2	100	84.362	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	84.362	Pan_paniscus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	80.328	ENSPPRG00000001651	-	99	80.328	Panthera_pardus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.081	ENSPPRG00000001638	-	100	80.081	Panthera_pardus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.918	ENSPTIG00000007036	-	99	79.918	Panthera_tigris_altaica
ENSCANG00000037322	SYF2	87	83.333	ENSPTIG00000005711	-	82	81.858	Panthera_tigris_altaica
ENSCANG00000037322	SYF2	100	84.362	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	84.362	Pan_troglodytes
ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.420	ENSPANG00000008139	SYF2	100	86.420	Papio_anubis
ENSCANG00000037322	SYF2	94	69.957	ENSPKIG00000008130	syf2	99	69.957	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCANG00000037322	SYF2	95	75.536	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	76.190	Pelodiscus_sinensis
ENSCANG00000037322	SYF2	96	67.797	ENSPMGG00000008755	syf2	92	67.797	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.189	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	78.189	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCANG00000037322	SYF2	91	79.111	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	78.603	Phascolarctos_cinereus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	65.021	ENSPFOG00000004116	syf2	95	67.083	Poecilia_formosa
ENSCANG00000037322	SYF2	99	67.083	ENSPLAG00000006691	syf2	99	67.083	Poecilia_latipinna
ENSCANG00000037322	SYF2	100	66.102	ENSPMEG00000011684	syf2	100	65.678	Poecilia_mexicana
ENSCANG00000037322	SYF2	87	70.833	ENSPREG00000003009	syf2	100	65.844	Poecilia_reticulata
ENSCANG00000037322	SYF2	100	84.774	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	84.774	Pongo_abelii
ENSCANG00000037322	SYF2	100	91.667	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	91.667	Propithecus_coquereli
ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.424	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	79.424	Pteropus_vampyrus
ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	ENSPNYG00000004979	syf2	100	67.227	Pundamilia_nyererei
ENSCANG00000037322	SYF2	100	69.959	ENSPNAG00000015570	syf2	100	69.959	Pygocentrus_nattereri
ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.601	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	78.601	Rattus_norvegicus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	83.539	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	83.128	Rhinopithecus_bieti
ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.420	ENSRROG00000001347	SYF2	100	86.420	Rhinopithecus_roxellana
ENSCANG00000037322	SYF2	100	82.716	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	82.716	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCANG00000037322	SYF2	79	79.397	ENSSHAG00000007152	-	97	79.397	Sarcophilus_harrisii
ENSCANG00000037322	SYF2	92	78.319	ENSSHAG00000015630	-	100	73.092	Sarcophilus_harrisii
ENSCANG00000037322	SYF2	91	71.556	ENSSFOG00015023647	syf2	95	71.556	Scleropages_formosus
ENSCANG00000037322	SYF2	94	68.220	ENSSMAG00000009867	syf2	99	68.220	Scophthalmus_maximus
ENSCANG00000037322	SYF2	97	68.067	ENSSDUG00000013072	syf2	98	68.354	Seriola_dumerili
ENSCANG00000037322	SYF2	88	72.018	ENSSLDG00000012677	syf2	98	68.354	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCANG00000037322	SYF2	100	61.475	ENSSARG00000012889	SYF2	100	61.475	Sorex_araneus
ENSCANG00000037322	SYF2	94	74.892	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	74.892	Sphenodon_punctatus
ENSCANG00000037322	SYF2	94	69.492	ENSSPAG00000009626	syf2	99	69.492	Stegastes_partitus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	77.778	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	77.778	Sus_scrofa
ENSCANG00000037322	SYF2	58	67.327	ENSTGUG00000001126	SYF2	70	58.741	Taeniopygia_guttata
ENSCANG00000037322	SYF2	100	64.609	ENSTRUG00000001499	syf2	92	67.811	Takifugu_rubripes
ENSCANG00000037322	SYF2	88	69.266	ENSTNIG00000016912	syf2	98	69.266	Tetraodon_nigroviridis
ENSCANG00000037322	SYF2	100	76.190	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	74.762	Tupaia_belangeri
ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.508	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	80.328	Tursiops_truncatus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.098	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	79.098	Ursus_americanus
ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.508	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	79.508	Ursus_maritimus
ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.098	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	79.098	Vicugna_pacos
ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.508	ENSVVUG00000027175	-	99	79.508	Vulpes_vulpes
ENSCANG00000037322	SYF2	82	80.488	ENSVVUG00000027181	-	100	76.210	Vulpes_vulpes
ENSCANG00000037322	SYF2	95	72.103	ENSXETG00000022797	syf2	94	72.103	Xenopus_tropicalis
ENSCANG00000037322	SYF2	87	71.163	ENSXMAG00000022698	syf2	100	65.844	Xiphophorus_maculatus