EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAPG00000010006 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_aperea
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4811 bases
Position: chrAVPZ01000178.1:10679436-10684246
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAPP00000008259	SYF2	PF08231.12	1.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAPT00000011961	SYF2-201	594	-	ENSCAPP00000008259	198 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSCAPG00000010006's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCAPG00000010006's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSG00000117614	SYF2	81	98.485	Homo_sapiens
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	ENSAPOG00000001174	syf2	83	84.343	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAPG00000010006	SYF2	98	95.876	ENSAMEG00000010134	-	99	95.876	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSAMEG00000010115	-	81	97.980	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	ENSACIG00000023688	syf2	79	81.818	Amphilophus_citrinellus
ENSCAPG00000010006	SYF2	92	82.967	ENSAOCG00000010912	syf2	57	82.967	Amphiprion_ocellaris
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	ENSAOCG00000022046	syf2	84	84.343	Amphiprion_ocellaris
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	ENSAPEG00000018858	syf2	76	84.343	Amphiprion_percula
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	ENSATEG00000007745	syf2	83	83.333	Anabas_testudineus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.889	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.889	Anas_platyrhynchos
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	86.364	ENSACAG00000013653	-	97	86.364	Anolis_carolinensis
ENSCAPG00000010006	SYF2	83	76.506	ENSACAG00000026777	-	93	76.923	Anolis_carolinensis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	ENSANAG00000032473	SYF2	81	98.990	Aotus_nancymaae
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	ENSACLG00000019916	syf2	83	81.818	Astatotilapia_calliptera
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	ENSAMXG00000004051	syf2	83	82.828	Astyanax_mexicanus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSBTAG00000001651	SYF2	84	97.980	Bos_taurus
ENSCAPG00000010006	SYF2	99	51.010	WBGene00019402	syf-2	85	51.010	Caenorhabditis_elegans
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	ENSCJAG00000046570	SYF2	81	98.990	Callithrix_jacchus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSCAFG00000012895	-	80	98.485	Canis_familiaris
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	92.929	ENSCAFG00000030331	-	87	92.929	Canis_familiaris
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSCAFG00020021091	-	80	98.485	Canis_lupus_dingo
ENSCAPG00000010006	SYF2	80	96.835	ENSCAFG00020021094	-	84	96.835	Canis_lupus_dingo
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSCHIG00000020874	SYF2	82	97.980	Capra_hircus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.970	ENSTSYG00000005114	SYF2	81	96.970	Carlito_syrichta
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	100.000	ENSCPOG00000005326	SYF2	81	100.000	Cavia_porcellus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	ENSCCAG00000022459	SYF2	81	98.990	Cebus_capucinus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSCATG00000026917	SYF2	81	97.980	Cercocebus_atys
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSCLAG00000008474	SYF2	81	98.485	Chinchilla_lanigera
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSCSAG00000000948	SYF2	81	97.980	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAPG00000010006	SYF2	65	90.698	ENSCHOG00000005273	-	79	90.698	Choloepus_hoffmanni
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.889	ENSCPBG00000025073	SYF2	80	88.889	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	54.500	ENSCING00000003017	-	83	54.000	Ciona_intestinalis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	52.000	ENSCSAVG00000006627	-	91	52.000	Ciona_savignyi
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.313	ENSCANG00000037322	SYF2	79	81.313	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.949	ENSCGRG00001020733	Syf2	82	94.949	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAPG00000010006	SYF2	98	95.385	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.949	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	77.778	ENSCSEG00000000117	syf2	83	77.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.313	ENSCVAG00000019543	syf2	83	81.313	Cyprinodon_variegatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	ENSDARG00000004706	syf2	83	82.828	Danio_rerio
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.970	ENSDNOG00000047605	SYF2	81	96.970	Dasypus_novemcinctus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSDORG00000001274	Syf2	81	97.980	Dipodomys_ordii
ENSCAPG00000010006	SYF2	99	59.799	FBgn0033556	CG12343	88	59.799	Drosophila_melanogaster
ENSCAPG00000010006	SYF2	93	78.378	ENSETEG00000015729	SYF2	81	78.378	Echinops_telfairi
ENSCAPG00000010006	SYF2	99	60.204	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.204	Eptatretus_burgeri
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.838	ENSEASG00005004232	-	82	83.838	Equus_asinus_asinus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	ENSEASG00005004224	-	81	97.475	Equus_asinus_asinus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	ENSECAG00000010440	-	83	97.475	Equus_caballus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSECAG00000012023	-	81	98.485	Equus_caballus
ENSCAPG00000010006	SYF2	70	84.783	ENSEEUG00000015084	SYF2	75	84.783	Erinaceus_europaeus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	85.859	ENSELUG00000003465	syf2	83	85.859	Esox_lucius
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSFCAG00000043095	-	80	97.980	Felis_catus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSFCAG00000010324	-	69	98.485	Felis_catus
ENSCAPG00000010006	SYF2	99	85.787	ENSFALG00000000460	SYF2	80	85.787	Ficedula_albicollis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	ENSFDAG00000008310	SYF2	81	97.475	Fukomys_damarensis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	65.829	ENSFHEG00000007238	syf2	88	65.829	Fundulus_heteroclitus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	ENSGMOG00000019138	syf2	88	83.333	Gadus_morhua
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.889	ENSGALG00000013639	SYF2	79	88.889	Gallus_gallus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	79.798	ENSGAFG00000019435	syf2	83	79.798	Gambusia_affinis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	ENSGACG00000007305	syf2	83	82.828	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	89.394	ENSGAGG00000010670	SYF2	80	89.394	Gopherus_agassizii
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	ENSGGOG00000012796	SYF2	81	98.990	Gorilla_gorilla
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	ENSHBUG00000020477	syf2	85	81.818	Haplochromis_burtoni
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.848	ENSHGLG00000004304	-	82	82.323	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSHGLG00000014393	SYF2	81	97.980	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSHGLG00100014722	SYF2	81	97.980	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	ENSHCOG00000012904	syf2	65	83.333	Hippocampus_comes
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.838	ENSIPUG00000019859	syf2	83	83.838	Ictalurus_punctatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	74	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.970	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.970	Jaculus_jaculus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	ENSKMAG00000013856	syf2	84	81.818	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	ENSLBEG00000014425	syf2	83	83.333	Labrus_bergylta
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.848	ENSLACG00000012064	SYF2	83	84.848	Latimeria_chalumnae
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.848	ENSLOCG00000002728	syf2	79	84.848	Lepisosteus_oculatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.970	ENSLAFG00000023150	-	81	96.970	Loxodonta_africana
ENSCAPG00000010006	SYF2	87	64.740	ENSLAFG00000030814	-	94	64.740	Loxodonta_africana
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSMFAG00000041831	SYF2	81	97.980	Macaca_fascicularis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSMMUG00000002968	SYF2	81	97.980	Macaca_mulatta
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSMNEG00000030180	SYF2	81	97.980	Macaca_nemestrina
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSMLEG00000030248	SYF2	81	97.980	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.808	ENSMAMG00000010403	syf2	82	80.808	Mastacembelus_armatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	ENSMZEG00005006429	syf2	83	81.818	Maylandia_zebra
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.889	ENSMGAG00000002019	SYF2	99	88.889	Meleagris_gallopavo
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.949	ENSMAUG00000018974	Syf2	82	94.949	Mesocricetus_auratus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	ENSMICG00000016191	SYF2	99	97.475	Microcebus_murinus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.960	ENSMOCG00000022938	Syf2	82	95.960	Microtus_ochrogaster
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	79.798	ENSMMOG00000002396	syf2	83	79.798	Mola_mola
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.500	ENSMODG00000013951	-	87	88.500	Monodelphis_domestica
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.407	ENSMALG00000010706	syf2	83	81.910	Monopterus_albus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.455	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	82	95.455	Mus_caroli
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.455	ENSMUSG00000028821	Syf2	82	95.455	Mus_musculus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.455	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	82	95.455	Mus_pahari
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.455	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	82	95.455	Mus_spretus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	ENSMPUG00000015801	-	80	97.475	Mustela_putorius_furo
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSMPUG00000015802	-	80	97.980	Mustela_putorius_furo
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSMLUG00000001885	SYF2	81	97.980	Myotis_lucifugus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSNGAG00000007912	Syf2	80	97.980	Nannospalax_galili
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	74.242	ENSNBRG00000010720	syf2	85	72.864	Neolamprologus_brichardi
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	ENSNLEG00000035185	SYF2	81	98.990	Nomascus_leucogenys
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.949	ENSOPRG00000012870	SYF2	81	94.949	Ochotona_princeps
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	ENSODEG00000017664	-	83	97.475	Octodon_degus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	ENSODEG00000014338	-	81	84.343	Octodon_degus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.313	ENSONIG00000008213	syf2	83	81.313	Oreochromis_niloticus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	90.404	ENSOANG00000009552	SYF2	98	90.404	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSOCUG00000013050	SYF2	81	97.980	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	ENSORLG00000028820	syf2	85	82.828	Oryzias_latipes
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	ENSORLG00020018333	syf2	84	82.828	Oryzias_latipes_hni
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	ENSORLG00015014665	syf2	83	82.828	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	ENSOMEG00000013911	syf2	83	83.333	Oryzias_melastigma
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSOGAG00000009962	SYF2	81	97.980	Otolemur_garnettii
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.000	ENSOARG00000006348	-	81	97.000	Ovis_aries
ENSCAPG00000010006	SYF2	98	67.010	ENSOARG00000006269	-	99	67.010	Ovis_aries
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	ENSPPAG00000036579	SYF2	81	98.990	Pan_paniscus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSPPRG00000001651	-	80	97.980	Panthera_pardus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSPPRG00000001638	-	80	98.485	Panthera_pardus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSPTIG00000005711	-	72	98.485	Panthera_tigris_altaica
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSPTIG00000007036	-	80	97.980	Panthera_tigris_altaica
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	ENSPTRG00000000352	SYF2	81	98.990	Pan_troglodytes
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSPANG00000008139	SYF2	81	97.980	Papio_anubis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.838	ENSPKIG00000008130	syf2	84	83.838	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.384	ENSPSIG00000011816	SYF2	77	88.384	Pelodiscus_sinensis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	ENSPMGG00000008755	syf2	77	81.818	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.455	ENSPEMG00000008283	Syf2	82	95.455	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.455	ENSPCIG00000014235	SYF2	79	95.455	Phascolarctos_cinereus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	ENSPFOG00000004116	syf2	82	80.303	Poecilia_formosa
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	ENSPLAG00000006691	syf2	85	80.303	Poecilia_latipinna
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	76.768	ENSPMEG00000011684	syf2	84	76.768	Poecilia_mexicana
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	ENSPREG00000003009	syf2	83	80.303	Poecilia_reticulata
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	ENSPPYG00000001713	SYF2	81	98.990	Pongo_abelii
ENSCAPG00000010006	SYF2	80	77.215	ENSPCOG00000027011	SYF2	73	77.419	Propithecus_coquereli
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.838	ENSPVAG00000005841	SYF2	81	83.838	Pteropus_vampyrus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	ENSPNYG00000004979	syf2	83	81.818	Pundamilia_nyererei
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.848	ENSPNAG00000015570	syf2	83	84.848	Pygocentrus_nattereri
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.455	ENSRNOG00000060597	Syf2	82	95.455	Rattus_norvegicus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.949	ENSRBIG00000042970	SYF2	81	94.949	Rhinopithecus_bieti
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSRROG00000001347	SYF2	81	97.980	Rhinopithecus_roxellana
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSSBOG00000020184	SYF2	81	98.485	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.444	ENSSHAG00000007152	-	96	94.444	Sarcophilus_harrisii
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	92.929	ENSSHAG00000015630	-	80	92.929	Sarcophilus_harrisii
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	ENSSFOG00015023647	syf2	84	84.343	Scleropages_formosus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.808	ENSSMAG00000009867	syf2	83	80.808	Scophthalmus_maximus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	ENSSDUG00000013072	syf2	83	83.333	Seriola_dumerili
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	ENSSLDG00000012677	syf2	83	83.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCAPG00000010006	SYF2	79	95.513	ENSSARG00000012889	SYF2	64	95.484	Sorex_araneus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	87.879	ENSSPUG00000005251	SYF2	78	87.879	Sphenodon_punctatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	ENSSPAG00000009626	syf2	83	82.828	Stegastes_partitus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	ENSSSCG00000037481	SYF2	81	97.980	Sus_scrofa
ENSCAPG00000010006	SYF2	53	77.885	ENSTGUG00000001126	SYF2	51	79.208	Taeniopygia_guttata
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	ENSTRUG00000001499	syf2	80	80.303	Takifugu_rubripes
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	79.293	ENSTNIG00000016912	syf2	89	79.293	Tetraodon_nigroviridis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	68.687	ENSTBEG00000017370	SYF2	78	68.182	Tupaia_belangeri
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.970	ENSTTRG00000003550	SYF2	81	96.970	Tursiops_truncatus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	ENSUAMG00000002897	SYF2	80	97.475	Ursus_americanus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	ENSUMAG00000013108	SYF2	80	97.475	Ursus_maritimus
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.465	ENSVPAG00000005705	SYF2	81	96.465	Vicugna_pacos
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	ENSVVUG00000027175	-	80	98.485	Vulpes_vulpes
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.465	ENSVVUG00000027181	-	80	96.465	Vulpes_vulpes
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	86.869	ENSXETG00000022797	syf2	80	86.869	Xenopus_tropicalis
ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	ENSXMAG00000022698	syf2	83	80.303	Xiphophorus_maculatus