EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAPG00000010228 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_aperea
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 31343 bases
Position: chrAVPZ01000178.1:1541113-1572455
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAPP00000008555	Piwi	PF02171.17	1.2e-92	1	1
ENSCAPP00000008559	Piwi	PF02171.17	1.3e-92	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAPT00000012262	AGO1-201	2094	-	ENSCAPP00000008555	697 (aa)	-	-
ENSCAPT00000012266	AGO1-202	2157	-	ENSCAPP00000008559	718 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAPG00000010228	AGO1	92	81.690	ENSCAPG00000009369	AGO4	87	81.690
ENSCAPG00000010228	AGO1	98	61.006	ENSCAPG00000013707	AGO2	98	60.848
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	90.323	ENSCAPG00000011589	AGO3	73	90.984

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSG00000092847	AGO1	89	93.983	Homo_sapiens
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSAPOG00000024299	ago1	89	92.531	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSAMEG00000000504	AGO1	89	93.983	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAPG00000010228	AGO1	86	91.915	ENSACIG00000005298	ago1	84	92.600	Amphilophus_citrinellus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSAOCG00000017727	ago1	89	92.531	Amphiprion_ocellaris
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSAPEG00000004458	ago1	90	92.531	Amphiprion_percula
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSATEG00000008523	ago1	89	92.531	Anabas_testudineus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSAPLG00000010440	AGO1	89	93.983	Anas_platyrhynchos
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	98.387	ENSACAG00000029174	AGO1	77	99.180	Anolis_carolinensis
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSANAG00000037711	AGO1	89	93.983	Aotus_nancymaae
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.649	ENSACLG00000000890	ago1	89	92.324	Astatotilapia_calliptera
ENSCAPG00000010228	AGO1	85	93.893	ENSAMXG00000001917	ago1	87	94.574	Astyanax_mexicanus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSBTAG00000012253	AGO1	89	93.983	Bos_taurus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCJAG00000032023	AGO1	89	93.983	Callithrix_jacchus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCAFG00000003443	AGO1	89	93.983	Canis_familiaris
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCAFG00020009251	AGO1	90	93.983	Canis_lupus_dingo
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCHIG00000011848	-	89	93.983	Capra_hircus
ENSCAPG00000010228	AGO1	98	74.419	ENSTSYG00000032426	-	87	74.419	Carlito_syrichta
ENSCAPG00000010228	AGO1	100	93.111	ENSTSYG00000009767	-	90	93.983	Carlito_syrichta
ENSCAPG00000010228	AGO1	100	93.111	ENSCPOG00000011568	AGO1	89	93.983	Cavia_porcellus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCCAG00000011823	AGO1	89	93.983	Cebus_capucinus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCATG00000031521	AGO1	89	93.983	Cercocebus_atys
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCLAG00000011507	AGO1	90	93.983	Chinchilla_lanigera
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCSAG00000001091	AGO1	89	93.983	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAPG00000010228	AGO1	81	97.170	ENSCHOG00000011591	AGO1	74	97.170	Choloepus_hoffmanni
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCPBG00000018594	AGO1	89	93.983	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCANG00000039798	AGO1	89	93.983	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCGRG00001022708	Ago1	89	93.983	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSCGRG00000010386	Ago1	90	93.983	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	88.866	ENSCSEG00000001051	ago1	90	89.537	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSCVAG00000018173	ago1	89	92.531	Cyprinodon_variegatus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSDARG00000092644	ago1	89	92.531	Danio_rerio
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	98.387	ENSDNOG00000008077	AGO1	77	99.180	Dasypus_novemcinctus
ENSCAPG00000010228	AGO1	90	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	88	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCAPG00000010228	AGO1	81	85.131	ENSETEG00000007626	AGO1	87	86.416	Echinops_telfairi
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSEASG00005012086	AGO1	89	93.983	Equus_asinus_asinus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSECAG00000024353	AGO1	89	93.983	Equus_caballus
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	94.080	ENSEEUG00000005349	AGO1	66	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	97.581	ENSELUG00000016803	ago1	77	98.361	Esox_lucius
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.404	ENSFCAG00000000746	AGO1	89	94.292	Felis_catus
ENSCAPG00000010228	AGO1	89	92.537	ENSFALG00000000790	AGO1	80	92.537	Ficedula_albicollis
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSFDAG00000017210	AGO1	89	93.983	Fukomys_damarensis
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSFHEG00000017927	ago1	90	92.531	Fundulus_heteroclitus
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	97.581	ENSGMOG00000019413	ago1	80	98.361	Gadus_morhua
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSGALG00000002249	AGO1	89	93.983	Gallus_gallus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSGAFG00000009775	ago1	89	92.531	Gambusia_affinis
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	97.581	ENSGACG00000012443	ago1	81	98.361	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	98.387	ENSGAGG00000012893	-	77	99.180	Gopherus_agassizii
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSGGOG00000003316	AGO1	89	93.983	Gorilla_gorilla
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.649	ENSHBUG00000010459	ago1	89	92.324	Haplochromis_burtoni
ENSCAPG00000010228	AGO1	100	93.111	ENSHGLG00000011540	AGO1	89	93.983	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAPG00000010228	AGO1	100	93.111	ENSHGLG00100005568	AGO1	89	93.983	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSHCOG00000005708	ago1	90	92.531	Hippocampus_comes
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.441	ENSIPUG00000023216	ago1	89	92.116	Ictalurus_punctatus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSSTOG00000010857	AGO1	89	93.983	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAPG00000010228	AGO1	100	93.111	ENSJJAG00000019449	Ago1	89	93.983	Jaculus_jaculus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSKMAG00000019464	ago1	89	92.531	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSLBEG00000007694	ago1	89	92.531	Labrus_bergylta
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	83.368	ENSLACG00000017009	AGO1	90	84.298	Latimeria_chalumnae
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	86.875	ENSLOCG00000000504	AGO1	89	87.785	Lepisosteus_oculatus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSLAFG00000010835	AGO1	90	93.983	Loxodonta_africana
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSMFAG00000002846	AGO1	89	93.983	Macaca_fascicularis
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	87.265	ENSMMUG00000006251	AGO1	90	88.174	Macaca_mulatta
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	87.056	ENSMNEG00000028881	AGO1	89	87.967	Macaca_nemestrina
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSMLEG00000038388	AGO1	89	93.983	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSMAMG00000008381	ago1	88	96.063	Mastacembelus_armatus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.649	ENSMZEG00005007996	ago1	89	92.324	Maylandia_zebra
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	84.774	ENSMGAG00000003822	AGO1	90	85.685	Meleagris_gallopavo
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSMAUG00000015189	Ago1	89	93.983	Mesocricetus_auratus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSMICG00000016147	AGO1	89	93.983	Microcebus_murinus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSMOCG00000000537	Ago1	89	93.983	Microtus_ochrogaster
ENSCAPG00000010228	AGO1	83	91.939	ENSMMOG00000018459	ago1	83	92.641	Mola_mola
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	92.902	ENSMODG00000023335	AGO1	89	93.776	Monodelphis_domestica
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.649	ENSMALG00000011057	ago1	90	92.324	Monopterus_albus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	89	93.983	Mus_caroli
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSMUSG00000041530	Ago1	89	93.983	Mus_musculus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	89	93.983	Mus_pahari
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	89	93.983	Mus_spretus
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	98.387	ENSMPUG00000014872	AGO1	84	99.180	Mustela_putorius_furo
ENSCAPG00000010228	AGO1	53	97.419	ENSMLUG00000009628	AGO1	84	97.419	Myotis_lucifugus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSNGAG00000017448	Ago1	89	93.983	Nannospalax_galili
ENSCAPG00000010228	AGO1	84	97.581	ENSNBRG00000010867	ago1	77	98.361	Neolamprologus_brichardi
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSNLEG00000011181	AGO1	89	93.983	Nomascus_leucogenys
ENSCAPG00000010228	AGO1	64	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	58	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCAPG00000010228	AGO1	83	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	70	100.000	Ochotona_princeps
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.983	ENSODEG00000005321	AGO1	90	93.983	Octodon_degus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.649	ENSONIG00000016345	ago1	90	92.324	Oreochromis_niloticus
ENSCAPG00000010228	AGO1	91	92.917	ENSOANG00000002080	AGO1	81	93.789	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSOCUG00000023116	AGO1	89	93.983	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSORLG00000014965	ago1	89	92.531	Oryzias_latipes
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSORLG00020018253	ago1	89	92.531	Oryzias_latipes_hni
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSORLG00015003287	ago1	89	92.531	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSOMEG00000020528	ago1	89	92.531	Oryzias_melastigma
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSOGAG00000010279	AGO1	90	93.983	Otolemur_garnettii
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSOARG00000019591	AGO1	89	93.983	Ovis_aries
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSPPAG00000034838	AGO1	89	93.983	Pan_paniscus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSPPRG00000006475	AGO1	89	93.983	Panthera_pardus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	92.693	ENSPTIG00000020991	AGO1	89	93.568	Panthera_tigris_altaica
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSPTRG00000000528	AGO1	89	93.983	Pan_troglodytes
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSPANG00000009060	AGO1	89	93.983	Papio_anubis
ENSCAPG00000010228	AGO1	98	91.684	ENSPSIG00000017482	AGO1	90	92.562	Pelodiscus_sinensis
ENSCAPG00000010228	AGO1	86	91.042	ENSPMGG00000024099	ago1	87	91.718	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSPEMG00000023313	Ago1	89	93.983	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	92.902	ENSPCIG00000000172	AGO1	89	93.776	Phascolarctos_cinereus
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSPFOG00000005867	ago1	89	92.531	Poecilia_formosa
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSPLAG00000002824	ago1	87	98.347	Poecilia_latipinna
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSPMEG00000001787	ago1	87	98.347	Poecilia_mexicana
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	ENSPREG00000006534	ago1	89	92.531	Poecilia_reticulata
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSPPYG00000001551	AGO1	89	93.983	Pongo_abelii
ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	ENSPCOG00000022061	AGO1	89	93.983	Propithecus_coquereli
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