EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCATG00000021613 (Gene tree)
Gene ID: 105583071
Gene Symbol: APOBEC1
Alias: APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cercocebus_atys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13029 bases
Position: chrKQ012686.1:7937694-7950722
Accession: 105583071
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCATP00000007163	APOBEC_N	PF08210.11	6.9e-28	1	1
ENSCATP00000007163	APOBEC_C	PF05240.14	2.4e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCATT00000024988	APOBEC1-201	3401	XM_012054443	ENSCATP00000007163	248 (aa)	XP_011909833	A0A2K5L2J6

Gene Model

Click here to download ENSCATG00000021613's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCATG00000021613's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCATG00000021613	APOBEC1	54	41.558	ENSCATG00000013527	-	57	41.558
ENSCATG00000021613	APOBEC1	52	31.298	ENSCATG00000030302	APOBEC3H	72	31.298
ENSCATG00000021613	APOBEC1	58	43.243	ENSCATG00000033502	-	61	43.243

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	94.068	ENSG00000111701	APOBEC1	100	94.068	Homo_sapiens
ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	80.952	ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.952	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCATG00000021613	APOBEC1	69	39.181	ENSACAG00000028578	-	93	39.181	Anolis_carolinensis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	100	91.129	ENSANAG00000027743	APOBEC1	100	91.129	Aotus_nancymaae
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	74.153	ENSBTAG00000014683	APOBEC1	100	74.153	Bos_taurus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	89	89.593	ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	89.593	Callithrix_jacchus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	80.085	ENSCAFG00000013901	APOBEC1	100	80.085	Canis_familiaris
ENSCATG00000021613	APOBEC1	91	79.646	ENSCAFG00020003511	APOBEC1	95	79.646	Canis_lupus_dingo
ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	75.325	ENSCHIG00000011898	APOBEC1	96	75.325	Capra_hircus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	57	83.688	ENSTSYG00000029141	APOBEC1	100	83.688	Carlito_syrichta
ENSCATG00000021613	APOBEC1	86	70.093	ENSCAPG00000015882	-	99	70.093	Cavia_aperea
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	68.511	ENSCPOG00000033068	APOBEC1	99	68.511	Cavia_porcellus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	92.797	ENSCCAG00000022258	APOBEC1	100	92.797	Cebus_capucinus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	71.179	ENSCLAG00000014645	APOBEC1	99	71.179	Chinchilla_lanigera
ENSCATG00000021613	APOBEC1	77	97.382	ENSCSAG00000009817	APOBEC1	100	97.382	Chlorocebus_sabaeus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	75	47.340	ENSCPBG00000014328	-	82	47.340	Chrysemys_picta_bellii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	79	50.000	ENSCPBG00000014329	-	54	50.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	90	37.719	ENSCPBG00000014327	-	87	37.719	Chrysemys_picta_bellii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	73	45.455	ENSCPBG00000017398	-	82	45.455	Chrysemys_picta_bellii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	89	42.222	ENSCPBG00000014331	-	90	42.222	Chrysemys_picta_bellii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	75	46.561	ENSCPBG00000014335	-	77	46.561	Chrysemys_picta_bellii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	97.826	ENSCANG00000038359	APOBEC1	100	97.826	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	71.179	ENSCGRG00001011130	Apobec1	100	71.179	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	71.179	ENSCGRG00000008644	Apobec1	100	71.179	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	80.932	ENSDNOG00000010926	APOBEC1	100	80.932	Dasypus_novemcinctus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	86	66.355	ENSDORG00000023717	Apobec1	100	66.355	Dipodomys_ordii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	94	79.149	ENSETEG00000004867	APOBEC1	99	79.149	Echinops_telfairi
ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	83.117	ENSEASG00005015951	APOBEC1	97	83.117	Equus_asinus_asinus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	77	83.770	ENSECAG00000017163	APOBEC1	100	83.770	Equus_caballus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	82	53.922	ENSEEUG00000007530	-	97	53.922	Erinaceus_europaeus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	89	65.611	ENSEEUG00000009112	-	98	65.611	Erinaceus_europaeus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	82.627	ENSFCAG00000009350	APOBEC1	100	82.627	Felis_catus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	57	47.183	ENSFALG00000007257	-	70	47.183	Ficedula_albicollis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	83	61.353	ENSFDAG00000018470	APOBEC1	99	61.353	Fukomys_damarensis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	75	47.368	ENSGAGG00000006624	-	66	47.368	Gopherus_agassizii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	75	44.385	ENSGAGG00000021744	-	73	44.385	Gopherus_agassizii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	76	42.051	ENSGAGG00000021745	-	69	42.051	Gopherus_agassizii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	65	51.852	ENSGAGG00000004947	-	76	56.557	Gopherus_agassizii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	88	46.119	ENSGAGG00000011837	-	88	52.500	Gopherus_agassizii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	66.809	ENSHGLG00000001495	APOBEC1	99	66.809	Heterocephalus_glaber_female
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	65.957	ENSHGLG00100002187	APOBEC1	99	65.957	Heterocephalus_glaber_male
ENSCATG00000021613	APOBEC1	87	64.651	ENSSTOG00000021971	APOBEC1	100	79.592	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	75.109	ENSJJAG00000022108	Apobec1	100	75.109	Jaculus_jaculus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	90	78.475	ENSLAFG00000030837	APOBEC1	100	78.475	Loxodonta_africana
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	99.153	ENSMFAG00000000277	APOBEC1	100	99.153	Macaca_fascicularis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	98.729	ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	98.729	Macaca_nemestrina
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	100.000	ENSMLEG00000036301	APOBEC1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	87	71.759	ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.759	Mesocricetus_auratus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	84.746	ENSMICG00000043645	APOBEC1	100	84.746	Microcebus_murinus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	67.797	ENSMODG00000018004	APOBEC1	100	67.797	Monodelphis_domestica
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	70.614	ENSMUSG00000040613	Apobec1	99	70.614	Mus_musculus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	69.298	MGP_PahariEiJ_G0022580	-	99	69.298	Mus_pahari
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	70.614	MGP_SPRETEiJ_G0029857	Apobec1	99	70.614	Mus_spretus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	78.390	ENSMPUG00000017532	APOBEC1	100	78.390	Mustela_putorius_furo
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	72.052	ENSNGAG00000022607	Apobec1	100	72.052	Nannospalax_galili
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	95.763	ENSNLEG00000005342	APOBEC1	100	95.763	Nomascus_leucogenys
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	66.102	ENSMEUG00000013406	APOBEC1	100	66.102	Notamacropus_eugenii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	73	65.193	ENSOPRG00000009508	-	100	65.193	Ochotona_princeps
ENSCATG00000021613	APOBEC1	96	77.311	ENSOCUG00000025736	APOBEC1	89	77.311	Oryctolagus_cuniculus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	81.818	ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.818	Otolemur_garnettii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	73.729	ENSOARG00000002072	APOBEC1	99	73.729	Ovis_aries
ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	87.013	ENSPPAG00000027657	APOBEC1	98	87.013	Pan_paniscus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	82.203	ENSPPRG00000012182	APOBEC1	100	82.203	Panthera_pardus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	82.203	ENSPTIG00000020280	APOBEC1	100	82.203	Panthera_tigris_altaica
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	94.492	ENSPTRG00000004614	APOBEC1	100	94.492	Pan_troglodytes
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	99.153	ENSPANG00000021027	APOBEC1	100	99.153	Papio_anubis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	56	49.541	ENSPSIG00000012791	-	76	49.541	Pelodiscus_sinensis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	94	43.220	ENSPSIG00000012568	-	99	43.220	Pelodiscus_sinensis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	69.432	ENSPEMG00000023841	Apobec1	100	69.432	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	69.068	ENSPCIG00000023973	APOBEC1	100	69.068	Phascolarctos_cinereus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	100	94.355	ENSPPYG00000004228	APOBEC1	100	94.355	Pongo_abelii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	75	81.283	ENSPCAG00000008733	APOBEC1	100	81.283	Procavia_capensis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	90	85.586	ENSPCOG00000013957	APOBEC1	98	85.586	Propithecus_coquereli
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	65.254	ENSPVAG00000010709	APOBEC1	100	65.254	Pteropus_vampyrus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	68.860	ENSRNOG00000015411	Apobec1	99	68.860	Rattus_norvegicus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	97.034	ENSRBIG00000031161	APOBEC1	100	97.034	Rhinopithecus_bieti
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	96.610	ENSRROG00000033576	APOBEC1	100	96.610	Rhinopithecus_roxellana
ENSCATG00000021613	APOBEC1	70	92.486	ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	92.486	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCATG00000021613	APOBEC1	92	70.044	ENSSHAG00000008925	APOBEC1	99	70.044	Sarcophilus_harrisii
ENSCATG00000021613	APOBEC1	69	68.023	ENSSARG00000000032	-	100	68.023	Sorex_araneus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	53	72.519	ENSSARG00000011972	-	99	72.519	Sorex_araneus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	82	41.546	ENSSPUG00000009044	-	79	41.546	Sphenodon_punctatus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	78.814	ENSSSCG00000000668	APOBEC1	100	78.814	Sus_scrofa
ENSCATG00000021613	APOBEC1	58	50.694	ENSTGUG00000013118	-	99	50.694	Taeniopygia_guttata
ENSCATG00000021613	APOBEC1	89	77.376	ENSTBEG00000010043	APOBEC1	94	77.376	Tupaia_belangeri
ENSCATG00000021613	APOBEC1	75	76.471	ENSTTRG00000014015	APOBEC1	100	76.471	Tursiops_truncatus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	98	77.273	ENSUAMG00000011636	APOBEC1	99	77.273	Ursus_americanus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	80.519	ENSUMAG00000016552	APOBEC1	95	80.519	Ursus_maritimus
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	75.847	ENSVPAG00000001343	APOBEC1	100	75.847	Vicugna_pacos
ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	80.932	ENSVVUG00000010522	APOBEC1	100	80.932	Vulpes_vulpes