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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCATG00000030019 (Gene tree)
Gene ID: 105590936
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cercocebus_atys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 27680 bases
Position: chrKQ010045.1:8552258-8579937
Accession: 105590936
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCATP00000011621	RRM_1	PF00076.22	8e-34	1	2
ENSCATP00000011621	RRM_1	PF00076.22	8e-34	2	2
ENSCATP00000011613	RRM_1	PF00076.22	8.7e-34	1	2
ENSCATP00000011613	RRM_1	PF00076.22	8.7e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCATT00000035747	MSI1-202	1059	XM_012071120	ENSCATP00000011621	352 (aa)	XP_011926510	A0A2K5LF84
ENSCATT00000035739	MSI1-201	2970	XM_012071118	ENSCATP00000011613	362 (aa)	XP_011926508	A0A2K5LF81

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCATG00000030019	MSI1	51	46.667	ENSCATG00000032328	HNRNPAB	75	39.608
ENSCATG00000030019	MSI1	50	43.750	ENSCATG00000033325	HNRNPA2B1	76	42.614
ENSCATG00000030019	MSI1	54	41.772	ENSCATG00000029559	DAZAP1	55	41.346
ENSCATG00000030019	MSI1	53	43.590	ENSCATG00000039829	HNRNPD	72	40.161
ENSCATG00000030019	MSI1	53	40.686	ENSCATG00000032162	HNRNPA3	70	38.258
ENSCATG00000030019	MSI1	51	39.011	ENSCATG00000001588	-	81	36.515
ENSCATG00000030019	MSI1	51	39.011	ENSCATG00000045141	-	59	40.000
ENSCATG00000030019	MSI1	51	42.308	ENSCATG00000043560	-	76	41.584
ENSCATG00000030019	MSI1	51	36.111	ENSCATG00000041727	-	75	34.783
ENSCATG00000030019	MSI1	54	34.328	ENSCATG00000038569	-	61	34.052
ENSCATG00000030019	MSI1	80	36.842	ENSCATG00000032133	RBM38	63	42.373
ENSCATG00000030019	MSI1	51	47.222	ENSCATG00000030349	-	82	46.032
ENSCATG00000030019	MSI1	51	41.758	ENSCATG00000041877	-	79	38.174
ENSCATG00000030019	MSI1	51	35.519	ENSCATG00000040418	-	81	33.610
ENSCATG00000030019	MSI1	53	38.974	ENSCATG00000005303	-	53	39.901
ENSCATG00000030019	MSI1	96	71.681	ENSCATG00000040879	MSI2	91	80.531
ENSCATG00000030019	MSI1	56	37.179	ENSCATG00000040153	TRA2B	69	37.179
ENSCATG00000030019	MSI1	54	32.877	ENSCATG00000031367	TARDBP	66	31.973

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSG00000135097	MSI1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCATG00000030019	MSI1	100	84.254	ENSAPOG00000023458	-	100	84.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.791	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	83.288	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	83.288	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCATG00000030019	MSI1	94	84.953	ENSACIG00000017754	-	78	84.953	Amphilophus_citrinellus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	79.217	ENSAOCG00000009031	-	95	80.120	Amphiprion_ocellaris
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.791	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	83.791	Amphiprion_ocellaris
ENSCATG00000030019	MSI1	100	84.254	ENSAPEG00000006857	-	84	84.254	Amphiprion_percula
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.791	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	83.791	Amphiprion_percula
ENSCATG00000030019	MSI1	100	78.747	ENSATEG00000023779	-	100	78.747	Anabas_testudineus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	80.435	ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	Anabas_testudineus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	96.419	ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	Anolis_carolinensis
ENSCATG00000030019	MSI1	82	96.309	ENSANAG00000027901	-	92	96.309	Aotus_nancymaae
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.978	ENSACLG00000000117	-	100	85.337	Astatotilapia_calliptera
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.242	ENSACLG00000011230	MSI1	100	83.242	Astatotilapia_calliptera
ENSCATG00000030019	MSI1	94	83.735	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.735	Astyanax_mexicanus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	99.724	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	99.724	Canis_familiaris
ENSCATG00000030019	MSI1	94	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCATG00000030019	MSI1	100	94.580	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	94.580	Capra_hircus
ENSCATG00000030019	MSI1	94	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSCATG00000030019	MSI1	94	93.407	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSCATG00000030019	MSI1	98	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCATG00000030019	MSI1	75	96.390	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	Chlorocebus_sabaeus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	95.856	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	95.856	Chrysemys_picta_bellii
ENSCATG00000030019	MSI1	98	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCATG00000030019	MSI1	94	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.149	ENSCSEG00000008352	-	100	83.149	Cynoglossus_semilaevis
ENSCATG00000030019	MSI1	98	80.363	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	80.363	Cynoglossus_semilaevis
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.516	ENSCSEG00000005834	-	100	83.516	Cynoglossus_semilaevis
ENSCATG00000030019	MSI1	100	84.254	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	84.254	Cyprinodon_variegatus
ENSCATG00000030019	MSI1	64	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSCATG00000030019	MSI1	50	61.194	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	61.194	Cyprinodon_variegatus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	83.648	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSCATG00000030019	MSI1	80	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSCATG00000030019	MSI1	98	89.970	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.970	Dasypus_novemcinctus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	Dipodomys_ordii
ENSCATG00000030019	MSI1	98	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	100	100.000	Equus_caballus
ENSCATG00000030019	MSI1	94	81.791	ENSELUG00000023280	-	100	81.493	Esox_lucius
ENSCATG00000030019	MSI1	98	77.901	ENSELUG00000023219	MSI1	92	80.387	Esox_lucius
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	Felis_catus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSCATG00000030019	MSI1	98	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.791	ENSFHEG00000003560	-	100	83.791	Fundulus_heteroclitus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	84.530	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	84.530	Fundulus_heteroclitus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	82.597	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	Gadus_morhua
ENSCATG00000030019	MSI1	100	76.584	ENSGMOG00000017838	-	100	76.584	Gadus_morhua
ENSCATG00000030019	MSI1	94	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	98	86.957	Gallus_gallus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	85.380	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	85.380	Gambusia_affinis
ENSCATG00000030019	MSI1	100	66.761	ENSGAFG00000005860	-	100	66.761	Gambusia_affinis
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.425	ENSGACG00000012679	MSI1	100	83.425	Gasterosteus_aculeatus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	80.663	ENSGACG00000008674	-	100	80.663	Gasterosteus_aculeatus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	95.580	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	95.580	Gopherus_agassizii
ENSCATG00000030019	MSI1	94	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.978	ENSHBUG00000011841	-	100	83.978	Haplochromis_burtoni
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.242	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	83.242	Haplochromis_burtoni
ENSCATG00000030019	MSI1	100	99.724	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	99.724	Heterocephalus_glaber_female
ENSCATG00000030019	MSI1	98	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSCATG00000030019	MSI1	100	78.689	ENSHCOG00000012067	-	100	78.689	Hippocampus_comes
ENSCATG00000030019	MSI1	98	83.082	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	83.082	Hippocampus_comes
ENSCATG00000030019	MSI1	100	82.320	ENSIPUG00000001976	msi1	100	82.320	Ictalurus_punctatus
ENSCATG00000030019	MSI1	94	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	84.659	ENSJJAG00000010643	-	100	84.659	Jaculus_jaculus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	85.801	ENSKMAG00000019877	-	100	85.801	Kryptolebias_marmoratus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.702	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	83.702	Kryptolebias_marmoratus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	84.254	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	84.254	Labrus_bergylta
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.242	ENSLBEG00000001375	-	100	83.242	Labrus_bergylta
ENSCATG00000030019	MSI1	98	87.427	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.427	Latimeria_chalumnae
ENSCATG00000030019	MSI1	51	70.000	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	70.000	Lepisosteus_oculatus
ENSCATG00000030019	MSI1	91	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSCATG00000030019	MSI1	98	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCATG00000030019	MSI1	97	98.291	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	98.291	Macaca_mulatta
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCATG00000030019	MSI1	98	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCATG00000030019	MSI1	98	84.940	ENSMAMG00000018426	-	100	83.791	Mastacembelus_armatus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.425	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	Mastacembelus_armatus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.242	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	Maylandia_zebra
ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.978	ENSMZEG00005000340	-	100	83.978	Maylandia_zebra
ENSCATG00000030019	MSI1	66	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSCATG00000030019	MSI1	71	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCATG00000030019	MSI1	100	99.724	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	Microtus_ochrogaster
ENSCATG00000030019	MSI1	98	83.801	ENSMMOG00000012265	-	97	83.801	Mola_mola
ENSCATG00000030019	MSI1	98	78.614	ENSMMOG00000010492	MSI1	94	78.614	Mola_mola
ENSCATG00000030019	MSI1	91	68.373	ENSMODG00000003189	-	100	68.373	Monodelphis_domestica
ENSCATG00000030019	MSI1	98	85.044	ENSMALG00000001426	-	100	85.044	Monopterus_albus
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