EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCATG00000035809 (Gene tree)
Gene ID: 105585392
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Cercocebus_atys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 43477 bases
Position: chrKQ009614.1:1560772-1604248
Accession: 105585392
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCATP00000024618	GTP_EFTU	PF00009.27	4.9e-45	1	1
ENSCATP00000024625	GTP_EFTU	PF00009.27	1.8e-33	1	1
ENSCATP00000024625	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.8e-12	1	1
ENSCATP00000024618	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.8e-12	1	1
ENSCATP00000024625	EFG_IV	PF03764.18	3.7e-23	1	1
ENSCATP00000024618	EFG_IV	PF03764.18	3.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCATT00000048852	EFTUD2-202	2880	-	ENSCATP00000024625	959 (aa)	-	A0A2K5MHD8
ENSCATT00000048844	EFTUD2-201	3685	XM_012059035	ENSCATP00000024618	972 (aa)	XP_011914425	A0A2K5MHD2

Gene Model

Click here to download ENSCATG00000035809's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCATG00000035809's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCATG00000035809	EFTUD2	87	36.686	ENSCATG00000005903	-	98	37.024
ENSCATG00000035809	EFTUD2	87	39.061	ENSCATG00000039972	-	99	46.364
ENSCATG00000035809	EFTUD2	81	30.220	ENSCATG00000031678	-	84	30.220

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	88.786	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	97.737	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	Anolis_carolinensis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.794	Canis_familiaris
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	Canis_lupus_dingo
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.588	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	Carlito_syrichta
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.971	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.971	Cavia_aperea
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.971	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	Cavia_porcellus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.868	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.663	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.383	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.383	Dasypus_novemcinctus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.383	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	Dipodomys_ordii
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSCATG00000035809	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSCATG00000035809	EFTUD2	75	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.794	Equus_asinus_asinus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.691	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.691	Equus_caballus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.691	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	Felis_catus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.177	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	Fukomys_damarensis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.045	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_female
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	Loxodonta_africana
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.695	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.049	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.588	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSCATG00000035809	EFTUD2	92	81.798	ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	Microtus_ochrogaster
ENSCATG00000035809	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.588	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	Monodelphis_domestica
ENSCATG00000035809	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.280	Mus_caroli
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.280	Mus_musculus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	Mus_pahari
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.280	Mus_spretus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	97	99.576	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.576	Mustela_putorius_furo
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.794	Myotis_lucifugus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	Nannospalax_galili
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSCATG00000035809	EFTUD2	97	98.193	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	Nomascus_leucogenys
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	95.988	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	Notamacropus_eugenii
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.461	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	Ochotona_princeps
ENSCATG00000035809	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.560	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	Oryctolagus_cuniculus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.872	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	97.737	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.737	Otolemur_garnettii
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.897	Pan_paniscus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.794	Panthera_pardus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.794	Panthera_tigris_altaica
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	Pan_troglodytes
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	100.000	Papio_anubis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	84.568	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.691	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.691	Phascolarctos_cinereus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.560	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	Pongo_abelii
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	95.679	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	Procavia_capensis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	Propithecus_coquereli
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	94.856	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	Pteropus_vampyrus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	Rattus_norvegicus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_bieti
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSCATG00000035809	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.893	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	97	99.680	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	Sarcophilus_harrisii
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.667	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.152	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	Sorex_araneus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	97.634	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	Sphenodon_punctatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.588	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	Sus_scrofa
ENSCATG00000035809	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	86.988	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	Tetraodon_nigroviridis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	94.342	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	Tupaia_belangeri
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.665	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	Ursus_americanus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.794	Ursus_maritimus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.794	Vulpes_vulpes
ENSCATG00000035809	EFTUD2	97	94.883	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSCATG00000035809	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus