EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCCAG00000001397 (Gene tree)
Gene ID: 108284373
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Cebus_capucinus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 48387 bases
Position: chrKV389703.1:2315042-2363428
Accession: 108284373
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCCAP00000000541	PAZ	PF02170.22	1e-27	1	1
ENSCCAP00000000522	PAZ	PF02170.22	1e-27	1	1
ENSCCAP00000000541	Piwi	PF02171.17	4.6e-105	1	1
ENSCCAP00000000522	Piwi	PF02171.17	4.6e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCCAT00000003337	AGO4-201	7499	XM_017501087	ENSCCAP00000000522	861 (aa)	XP_017356576	A0A2K5PA53
ENSCCAT00000003425	AGO4-202	2580	-	ENSCCAP00000000541	859 (aa)	-	A0A2K5PA85

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	79.034	ENSCCAG00000035031	AGO2	100	78.125
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	83.489	ENSCCAG00000011823	AGO1	98	83.489
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	81.062	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	85.737

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSG00000134698	AGO4	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCCAG00000001397	AGO4	96	96.301	ENSAPOG00000023867	ago4	99	96.301	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	100.000	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	99.534	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	97.733	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	93.073	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.528	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	99.528	Anas_platyrhynchos
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	98.481	ENSACAG00000017275	AGO4	99	98.481	Anolis_carolinensis
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.884	ENSANAG00000031428	AGO4	100	99.884	Aotus_nancymaae
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	ENSACLG00000005181	ago4	100	96.224	Astatotilapia_calliptera
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.453	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	98.947	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.947	Bos_taurus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	100.000	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.884	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	99.884	Capra_hircus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.883	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	99.883	Carlito_syrichta
ENSCCAG00000001397	AGO4	94	96.197	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	96.197	Cavia_aperea
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	97.897	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	97.897	Cavia_porcellus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.649	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	99.649	Chinchilla_lanigera
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCCAG00000001397	AGO4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.532	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	Chrysemys_picta_bellii
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	100.000	ENSCANG00000016914	AGO4	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.419	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	99.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.415	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	99.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	91.709	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	97.683	ENSDARG00000100854	ago4	100	97.683	Danio_rerio
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.768	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	99.768	Dasypus_novemcinctus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.884	ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	Dipodomys_ordii
ENSCCAG00000001397	AGO4	60	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSEASG00005012079	AGO4	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSECAG00000024686	AGO4	100	100.000	Equus_caballus
ENSCCAG00000001397	AGO4	79	97.173	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	97.173	Erinaceus_europaeus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	95.786	ENSELUG00000023873	ago4	100	95.786	Esox_lucius
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.884	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	99.884	Felis_catus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.883	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	99.883	Fukomys_damarensis
ENSCCAG00000001397	AGO4	97	88.756	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.756	Fundulus_heteroclitus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	97.206	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.206	Gadus_morhua
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.535	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.535	Gallus_gallus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	Gambusia_affinis
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	97.666	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.666	Gasterosteus_aculeatus
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	99.496	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	Gopherus_agassizii
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	96.592	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.592	Gorilla_gorilla
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	Haplochromis_burtoni
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.884	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	99.884	Heterocephalus_glaber_female
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	100.000	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.110	ENSHCOG00000003725	ago4	100	96.110	Hippocampus_comes
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSIPUG00000015600	ago4	100	96.339	Ictalurus_punctatus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.884	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSKMAG00000018602	ago4	100	96.339	Kryptolebias_marmoratus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	95.682	ENSLBEG00000010670	ago4	100	95.682	Labrus_bergylta
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	98.490	ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	Latimeria_chalumnae
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.334	ENSLOCG00000000584	ago4	100	96.334	Lepisosteus_oculatus
ENSCCAG00000001397	AGO4	93	99.251	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	99.251	Loxodonta_africana
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.883	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	100.000	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.224	Mastacembelus_armatus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	ENSMZEG00005026346	ago4	100	96.224	Maylandia_zebra
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.181	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.181	Meleagris_gallopavo
ENSCCAG00000001397	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	98.723	Mesocricetus_auratus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.766	ENSMICG00000033507	AGO4	100	99.766	Microcebus_murinus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.535	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	99.535	Microtus_ochrogaster
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	96.725	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.725	Mola_mola
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.652	ENSMODG00000017888	AGO4	100	99.652	Monodelphis_domestica
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	95.688	ENSMALG00000011797	ago4	100	95.688	Monopterus_albus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.071	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	Mus_caroli
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	98.839	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	Mus_musculus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	98.490	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	Mus_pahari
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	98.606	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	98.606	Mus_spretus
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	100.000	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	98.598	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	98.598	Myotis_lucifugus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.883	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	99.883	Nannospalax_galili
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	ENSNBRG00000013492	ago4	100	96.224	Neolamprologus_brichardi
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	100.000	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSCCAG00000001397	AGO4	90	98.462	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	98.462	Notamacropus_eugenii
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	92.389	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	92.389	Ochotona_princeps
ENSCCAG00000001397	AGO4	93	99.875	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	Octodon_degus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.864	ENSONIG00000013603	ago4	100	96.224	Oreochromis_niloticus
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	99.622	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.622	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.768	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	99.768	Oryctolagus_cuniculus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSORLG00000009865	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSORLG00020016978	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes_hni
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSORLG00015008800	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes_hsok
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSOMEG00000006399	ago4	100	96.339	Oryzias_melastigma
ENSCCAG00000001397	AGO4	93	98.498	ENSOGAG00000004233	-	100	98.498	Otolemur_garnettii
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	90.825	ENSOGAG00000027107	-	100	90.825	Otolemur_garnettii
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.415	ENSOARG00000019568	AGO4	98	99.415	Ovis_aries
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	100.000	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.884	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	99.884	Panthera_pardus
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.883	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	99.883	Panthera_tigris_altaica
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	100.000	ENSPANG00000007232	AGO4	100	100.000	Papio_anubis
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	ENSPKIG00000022598	ago4	100	96.224	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.532	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	99.532	Pelodiscus_sinensis
ENSCCAG00000001397	AGO4	92	97.607	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	88.760	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.652	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	Phascolarctos_cinereus
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSPFOG00000001935	ago4	100	96.339	Poecilia_formosa
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	97.567	ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	Poecilia_latipinna
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSPMEG00000005049	ago4	100	96.339	Poecilia_mexicana
ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.339	ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	Poecilia_reticulata
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	100.000	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	100.000	Pongo_abelii
ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.649	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	99.649	Propithecus_coquereli
ENSCCAG00000001397	AGO4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
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