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Description

Ensembl ID: ENSCCAG00000021869 (Gene tree)
Gene ID: 108299701
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Cebus_capucinus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 37594 bases
Position: chrKV389449.1:8461434-8499027
Accession: 108299701
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCCAP00000008311	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-05	1	1
ENSCCAP00000008277	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCCAT00000025687	RAB1A-205	615	-	ENSCCAP00000008311	204 (aa)	-	A0A2K5PXH0
ENSCCAT00000025653	RAB1A-201	2731	XM_017522134	ENSCCAP00000008277	205 (aa)	XP_017377623	A0A2K5PXG0
ENSCCAT00000025676	RAB1A-203	426	-	ENSCCAP00000008300	141 (aa)	-	A0A2K5PXC2
ENSCCAT00000025679	RAB1A-204	390	-	ENSCCAP00000008303	129 (aa)	-	A0A2K5PXA4
ENSCCAT00000025674	RAB1A-202	522	-	ENSCCAP00000008298	173 (aa)	-	A0A2K5PX99

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCCAG00000021869	RAB1A	86	43.820	ENSCCAG00000030469	RAB39B	84	43.820
ENSCCAG00000021869	RAB1A	79	31.677	ENSCCAG00000026041	-	82	31.677
ENSCCAG00000021869	RAB1A	85	52.299	ENSCCAG00000021286	RAB11A	81	52.299
ENSCCAG00000021869	RAB1A	96	33.333	ENSCCAG00000028830	RAB36	63	33.333
ENSCCAG00000021869	RAB1A	84	35.028	ENSCCAG00000031453	HRAS	93	35.028
ENSCCAG00000021869	RAB1A	95	39.086	ENSCCAG00000030930	RAB22A	97	39.086
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	53.960	ENSCCAG00000031720	RAB35	100	53.960
ENSCCAG00000021869	RAB1A	82	32.544	ENSCCAG00000030751	RHEB	91	32.544
ENSCCAG00000021869	RAB1A	57	34.746	ENSCCAG00000007022	ARL8A	61	34.746
ENSCCAG00000021869	RAB1A	88	32.609	ENSCCAG00000026139	RERG	90	32.609
ENSCCAG00000021869	RAB1A	76	40.252	ENSCCAG00000017812	RAB9B	79	40.252
ENSCCAG00000021869	RAB1A	95	43.590	ENSCCAG00000025940	RAB5C	89	43.590
ENSCCAG00000021869	RAB1A	75	36.538	ENSCCAG00000025944	-	65	36.538
ENSCCAG00000021869	RAB1A	90	48.108	ENSCCAG00000025945	RAB2A	99	45.238
ENSCCAG00000021869	RAB1A	76	39.623	ENSCCAG00000017991	RAB9A	79	39.623
ENSCCAG00000021869	RAB1A	57	32.203	ENSCCAG00000028492	ARL8B	61	32.203
ENSCCAG00000021869	RAB1A	81	35.928	ENSCCAG00000035799	-	80	35.928
ENSCCAG00000021869	RAB1A	62	53.543	ENSCCAG00000028745	RAB2B	71	53.543
ENSCCAG00000021869	RAB1A	95	43.814	ENSCCAG00000022405	RAB5A	90	43.814
ENSCCAG00000021869	RAB1A	57	31.092	ENSCCAG00000024558	ARL4C	59	31.092
ENSCCAG00000021869	RAB1A	77	39.752	ENSCCAG00000034632	RAB34	62	39.752
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	45.581	ENSCCAG00000031042	RAB11B	93	51.786
ENSCCAG00000021869	RAB1A	57	31.092	ENSCCAG00000037394	-	61	31.092
ENSCCAG00000021869	RAB1A	80	38.415	ENSCCAG00000030765	-	86	38.415
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	44.554	ENSCCAG00000020267	RAB14	93	44.554
ENSCCAG00000021869	RAB1A	80	47.619	ENSCCAG00000035680	RAB33A	71	47.619
ENSCCAG00000021869	RAB1A	81	50.602	ENSCCAG00000026824	RAB30	82	50.602
ENSCCAG00000021869	RAB1A	80	50.909	ENSCCAG00000033681	RAB15	90	57.944
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	93.069	ENSCCAG00000021540	RAB1B	100	93.069
ENSCCAG00000021869	RAB1A	80	37.805	ENSCCAG00000031963	KRAS	95	35.912
ENSCCAG00000021869	RAB1A	84	32.948	ENSCCAG00000020364	RAB23	73	32.948
ENSCCAG00000021869	RAB1A	82	50.296	ENSCCAG00000022862	RAB12	69	50.296
ENSCCAG00000021869	RAB1A	81	38.235	ENSCCAG00000036322	RAB7A	89	38.235
ENSCCAG00000021869	RAB1A	83	44.000	ENSCCAG00000019859	RAB33B	76	44.000
ENSCCAG00000021869	RAB1A	96	51.269	ENSCCAG00000028502	-	97	51.269
ENSCCAG00000021869	RAB1A	95	36.410	ENSCCAG00000035269	RAB6B	94	36.410
ENSCCAG00000021869	RAB1A	89	46.703	ENSCCAG00000006762	RAB18	93	45.876
ENSCCAG00000021869	RAB1A	95	42.268	ENSCCAG00000019480	RAB5B	90	42.268

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	99	97.537	Capra_hircus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	98.039	ENSHGLG00100007994	RAB1A	100	98.039	Heterocephalus_glaber_male
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSCCAG00000021869	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
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ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSCCAG00000021869	RAB1A	94	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	93.627	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	99.020	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
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