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Description

Ensembl ID: ENSCCAG00000026472 (Gene tree)
Gene ID: 108303690
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cebus_capucinus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 99522 bases
Position: chrKV389476.1:2469779-2569300
Accession: 108303690
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCCAP00000017353	IBN_N	PF03810.19	8.2e-16	1	1
ENSCCAP00000017332	IBN_N	PF03810.19	8.2e-16	1	1
ENSCCAP00000017308	IBN_N	PF03810.19	8.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCCAT00000034770	TNPO1-201	8545	XM_017527614	ENSCCAP00000017308	898 (aa)	XP_017383103	A0A2K5QN44
ENSCCAT00000034815	TNPO1-204	2673	-	ENSCCAP00000017353	890 (aa)	-	A0A2K5QN90
ENSCCAT00000034794	TNPO1-203	8978	XM_017527615	ENSCCAP00000017332	890 (aa)	XP_017383104	A0A2K5QN53
ENSCCAT00000034777	TNPO1-202	2547	-	ENSCCAP00000017315	848 (aa)	-	A0A2K5QNA8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	85.231	ENSCCAG00000024574	TNPO2	99	85.231

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.555	Homo_sapiens
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.371	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.371	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	98.664	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.664	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	92.377	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.377	Amphilophus_citrinellus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.483	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.483	Amphiprion_ocellaris
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.483	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.483	Amphiprion_percula
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.034	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.034	Anabas_testudineus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	92.221	ENSAPLG00000009619	-	97	93.218	Anas_platyrhynchos
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.292	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.292	Anolis_carolinensis
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.777	ENSANAG00000022453	-	100	99.777	Aotus_nancymaae
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	88.876	ENSANAG00000025351	-	100	88.641	Aotus_nancymaae
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	64.080	ENSANAG00000027118	-	99	63.867	Aotus_nancymaae
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.124	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.124	Astatotilapia_calliptera
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.265	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.928	Astyanax_mexicanus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.332	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.332	Bos_taurus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.889	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.889	Callithrix_jacchus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	99.300	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.300	Canis_familiaris
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.404	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.404	Canis_lupus_dingo
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.220	Capra_hircus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	95.254	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.778	Carlito_syrichta
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.555	Cercocebus_atys
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.109	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.109	Chinchilla_lanigera
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.443	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.443	Chlorocebus_sabaeus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	94	86.659	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.659	Choloepus_hoffmanni
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	97.303	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.306	Chrysemys_picta_bellii
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	75.084	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.084	Ciona_savignyi
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.555	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.220	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	99.181	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.181	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.798	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.798	Cynoglossus_semilaevis
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.809	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.809	Cyprinodon_variegatus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.144	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.807	Danio_rerio
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.281	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.304	Dasypus_novemcinctus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	93	99.277	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.276	Dipodomys_ordii
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	57.675	FBgn0035693	CG8219	99	57.223	Drosophila_melanogaster
ENSCCAG00000026472	TNPO1	86	98.502	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.502	Echinops_telfairi
ENSCCAG00000026472	TNPO1	94	84.643	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.762	Eptatretus_burgeri
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.555	Equus_asinus_asinus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.332	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.332	Equus_caballus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	86.009	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.575	Esox_lucius
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.555	Felis_catus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.966	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.966	Ficedula_albicollis
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.220	Fukomys_damarensis
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.154	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.154	Fundulus_heteroclitus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	89.698	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.698	Gadus_morhua
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.292	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.292	Gallus_gallus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.928	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.928	Gambusia_affinis
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.697	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.697	Gasterosteus_aculeatus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	97.079	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.079	Gopherus_agassizii
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	82.735	ENSGGOG00000022535	-	99	82.793	Gorilla_gorilla
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.555	Gorilla_gorilla
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.697	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.697	Haplochromis_burtoni
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	98.886	ENSHGLG00000000970	-	100	98.886	Heterocephalus_glaber_female
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	75.056	ENSHGLG00100000963	-	99	76.744	Heterocephalus_glaber_male
ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	98.715	ENSHGLG00100017090	-	99	98.715	Heterocephalus_glaber_male
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.326	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.326	Jaculus_jaculus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.146	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.146	Kryptolebias_marmoratus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	91	89.642	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.642	Labrus_bergylta
ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	88.721	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.721	Latimeria_chalumnae
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	94.944	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	94.855	Lepisosteus_oculatus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	97	98.730	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	Loxodonta_africana
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.555	Macaca_fascicularis
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.443	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.443	Macaca_mulatta
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.555	Macaca_nemestrina
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.555	Mandrillus_leucophaeus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.034	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.034	Mastacembelus_armatus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.472	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.472	Maylandia_zebra
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.213	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	95.955	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.955	Microcebus_murinus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.213	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.213	Microtus_ochrogaster
ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	92.139	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.139	Mola_mola
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	97.021	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.021	Monodelphis_domestica
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.022	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.022	Monopterus_albus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	98.998	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.109	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	98.998	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.443	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.443	Mustela_putorius_furo
ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	98.836	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.836	Myotis_lucifugus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.220	Nannospalax_galili
ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	92.248	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.248	Neolamprologus_brichardi
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.555	Nomascus_leucogenys
ENSCCAG00000026472	TNPO1	91	93.272	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	Ochotona_princeps
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	98.886	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.886	Octodon_degus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.964	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.964	Oreochromis_niloticus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	92	97.439	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.439	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	92.757	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.757	Oryctolagus_cuniculus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	92.218	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.218	Oryzias_latipes
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	92.559	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.559	Oryzias_latipes_hni
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	92.672	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.672	Oryzias_latipes_hsok
ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	92.559	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.559	Oryzias_melastigma
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.443	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.443	Otolemur_garnettii
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.332	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.332	Ovis_aries
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.555	Pan_paniscus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.555	Panthera_pardus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.555	Panthera_tigris_altaica
ENSCCAG00000026472	TNPO1	94	86.602	ENSPTRG00000047731	-	100	86.602	Pan_troglodytes
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.555	Pan_troglodytes
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.555	Papio_anubis
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	90.337	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.337	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.966	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.548	Pelodiscus_sinensis
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	90.123	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	99.181	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.181	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	97.865	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.865	Phascolarctos_cinereus
ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.721	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.721	Poecilia_formosa
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