EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCCAG00000026893 (Gene tree)
Gene ID: 108315603
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Cebus_capucinus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 42473 bases
Position: chrKV389601.1:3454149-3496621
Accession: 108315603
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCCAP00000018437	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	1	2
ENSCCAP00000018437	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	2	2
ENSCCAP00000018433	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	1	2
ENSCCAP00000018433	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	2	2
ENSCCAP00000018424	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-27	1	2
ENSCCAP00000018424	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCCAT00000035912	PAPOLG-203	2145	-	ENSCCAP00000018437	714 (aa)	-	A0A2K5QRB8
ENSCCAT00000035908	PAPOLG-202	2202	-	ENSCCAP00000018433	733 (aa)	-	A0A2K5QRA5
ENSCCAT00000035899	PAPOLG-201	2816	XM_017544983	ENSCCAP00000018424	736 (aa)	XP_017400472	A0A2K5QRA8

Gene Model

Click here to download ENSCCAG00000026893's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCCAG00000026893's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	98	62.088	ENSCCAG00000025120	PAPOLA	92	76.634

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.505	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.594	ENSAPOG00000004798	papolg	99	72.423	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	94.851	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.851	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	71.608	ENSACIG00000010546	papolg	99	71.788	Amphilophus_citrinellus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.460	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.727	Amphiprion_ocellaris
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.594	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.861	Amphiprion_percula
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.959	ENSATEG00000009007	papolg	99	70.238	Anabas_testudineus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	98	74.359	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.279	Anas_platyrhynchos
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	80	64.909	ENSACAG00000015048	-	100	64.909	Anolis_carolinensis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	99.321	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	99.321	Aotus_nancymaae
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	69.401	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.143	Astatotilapia_calliptera
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.848	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.848	Astyanax_mexicanus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.872	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	94.872	Bos_taurus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	99.592	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	99.592	Callithrix_jacchus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.142	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.506	Canis_familiaris
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.715	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.715	Canis_lupus_dingo
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.737	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.737	Capra_hircus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	96.761	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	96.761	Carlito_syrichta
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	53	91.601	ENSCAPG00000014901	-	100	91.601	Cavia_aperea
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.816	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	Cavia_porcellus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	90	99.134	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	99.134	Cercocebus_atys
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.142	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	Chinchilla_lanigera
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.641	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	98.641	Chlorocebus_sabaeus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	89	93.778	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.778	Choloepus_hoffmanni
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	70	64.752	ENSCING00000024664	-	94	64.752	Ciona_intestinalis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	68	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.880	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	98.880	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	93.588	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	93.588	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	93.588	ENSCGRG00000005552	-	100	93.588	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.109	ENSCSEG00000000771	papolg	99	71.370	Cynoglossus_semilaevis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	92	79.685	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	Cyprinodon_variegatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	73.677	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.677	Danio_rerio
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.062	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	94.062	Dasypus_novemcinctus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	60	99.068	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	Dipodomys_ordii
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	74.255	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	74.189	Echinops_telfairi
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	67	56.695	ENSEBUG00000005042	-	82	56.695	Eptatretus_burgeri
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	62	71.762	ENSEBUG00000004020	papolg	91	71.762	Eptatretus_burgeri
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.682	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	95.682	Equus_asinus_asinus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.547	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	95.122	Equus_caballus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	84.211	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.211	Erinaceus_europaeus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	74.260	ENSELUG00000014497	papolg	99	64.671	Esox_lucius
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.872	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	94.872	Felis_catus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	64.894	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	64.894	Ficedula_albicollis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.412	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	95.412	Fukomys_damarensis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	66	62.282	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.458	Fundulus_heteroclitus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	87	83.912	ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.912	Gadus_morhua
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.840	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	72.565	Gallus_gallus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	69.251	ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.000	Gambusia_affinis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	71.904	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.074	Gasterosteus_aculeatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.913	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	98.913	Gorilla_gorilla
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	69.401	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.274	Haplochromis_burtoni
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	94.986	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.986	Heterocephalus_glaber_female
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.412	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.989	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.390	Hippocampus_comes
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.665	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.861	Ictalurus_punctatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	96.221	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.221	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	60	98.834	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	98.834	Jaculus_jaculus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	71.238	ENSKMAG00000016439	papolg	97	70.816	Kryptolebias_marmoratus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	68.374	ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.246	Labrus_bergylta
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	70.761	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.761	Latimeria_chalumnae
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.906	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.906	Lepisosteus_oculatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.347	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.641	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	98.641	Macaca_fascicularis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.641	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	98.641	Macaca_mulatta
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	89.879	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	89.879	Macaca_nemestrina
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.599	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	98.599	Mandrillus_leucophaeus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.460	ENSMAMG00000010667	papolg	99	71.784	Mastacembelus_armatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	98	72.688	ENSMZEG00005018140	papolg	99	73.202	Maylandia_zebra
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.912	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.643	Meleagris_gallopavo
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	93.452	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.452	Mesocricetus_auratus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	96.332	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	96.332	Microcebus_murinus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	93.919	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.919	Microtus_ochrogaster
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	71.733	ENSMMOG00000008020	papolg	99	72.267	Mola_mola
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	87.265	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.265	Monodelphis_domestica
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.594	ENSMALG00000007012	papolg	89	72.594	Monopterus_albus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.332	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.299	Mus_caroli
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.332	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	Mus_musculus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.197	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.197	Mus_pahari
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.197	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	Mus_spretus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.872	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	94.872	Mustela_putorius_furo
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	94.134	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	94.134	Myotis_lucifugus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.816	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.816	Nannospalax_galili
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	63.347	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.878	Neolamprologus_brichardi
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	60	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	81	78.767	ENSMEUG00000013605	-	87	78.767	Notamacropus_eugenii
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.007	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	95.007	Ochotona_princeps
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	60	94.131	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	Octodon_degus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	65.772	ENSONIG00000002985	papolg	100	66.260	Oreochromis_niloticus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	85.523	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.523	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	96.491	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	96.491	Oryctolagus_cuniculus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.252	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.439	Oryzias_latipes
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.761	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.761	Oryzias_latipes_hni
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.252	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.439	Oryzias_latipes_hsok
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.093	ENSOMEG00000001406	papolg	99	70.306	Oryzias_melastigma
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	56	94.118	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	94.118	Otolemur_garnettii
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.602	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	94.602	Ovis_aries
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.505	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	98.505	Pan_paniscus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.872	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	94.872	Panthera_pardus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.737	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.737	Panthera_tigris_altaica
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.505	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	98.505	Pan_troglodytes
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.444	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	94.444	Papio_anubis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	74.345	ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.345	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	93	72.741	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.480	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	78.841	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.841	Pelodiscus_sinensis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	93.315	ENSPEMG00000008960	-	100	93.315	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	98	53.610	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.397	Petromyzon_marinus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	68	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	87.316	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	Phascolarctos_cinereus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	68.766	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.404	Poecilia_formosa
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	68.857	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.617	Poecilia_latipinna
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	68.807	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.433	Poecilia_mexicana
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	68.497	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.170	Poecilia_reticulata
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.641	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.641	Pongo_abelii
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	81.905	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	Procavia_capensis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	87.622	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	87.622	Propithecus_coquereli
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	89	94.812	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.812	Pteropus_vampyrus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	73.147	ENSPNYG00000006729	papolg	99	73.147	Pundamilia_nyererei
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	73.262	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.262	Pygocentrus_nattereri
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	93.792	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	93.792	Rattus_norvegicus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	92.527	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	92.527	Rhinopithecus_bieti
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	98.599	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	98.599	Rhinopithecus_roxellana
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	99.457	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	99.457	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	94	87.801	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	Sarcophilus_harrisii
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.932	ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.932	Scleropages_formosus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	64.787	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.787	Scleropages_formosus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	74.444	ENSSDUG00000000912	papolg	99	72.587	Seriola_dumerili
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.326	ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.460	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	81.284	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	81.284	Sphenodon_punctatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.028	ENSSPAG00000009004	papolg	99	72.448	Stegastes_partitus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.951	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.951	Sus_scrofa
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	75	77.068	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	77.068	Taeniopygia_guttata
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.276	ENSTRUG00000006410	papolg	99	72.276	Takifugu_rubripes
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	66.667	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.667	Tetraodon_nigroviridis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	88.027	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	88.027	Tupaia_belangeri
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	90.553	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	90.553	Tursiops_truncatus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.967	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.967	Ursus_americanus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	95.089	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	95.089	Ursus_maritimus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	91.565	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.565	Vicugna_pacos
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.142	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	Vulpes_vulpes
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	74.801	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.801	Xenopus_tropicalis
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	69	85.685	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.859	Xiphophorus_couchianus
ENSCCAG00000026893	PAPOLG	82	83.099	ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	Xiphophorus_maculatus