EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCCAG00000037445 (Gene tree)
Gene ID: 108315593
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cebus_capucinus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 56825 bases
Position: chrKV389601.1:4178799-4235623
Accession: 108315593
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCCAP00000039249	CRM1_C	PF08767.11	1e-89	1	1
ENSCCAP00000039249	Xpo1	PF08389.12	1.2e-40	1	1
ENSCCAP00000039249	IBN_N	PF03810.19	3.5e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCCAT00000057056	XPO1-201	2787	XM_017544963	ENSCCAP00000039249	928 (aa)	XP_017400452	A0A2K5SFU2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.705	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	70.433	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	70.222	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSAPOG00000004984	-	100	77.273	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.889	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	79.703	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	75.290	ENSACIG00000010818	-	100	75.079	Amphilophus_citrinellus
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.862	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	72.650	Amphilophus_citrinellus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSAOCG00000010121	-	100	77.273	Amphiprion_ocellaris
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.397	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	74.212	Amphiprion_ocellaris
ENSCCAG00000037445	XPO1	89	73.108	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	72.904	Amphiprion_percula
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSAPEG00000007038	-	100	77.273	Amphiprion_percula
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.026	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	73.840	Anabas_testudineus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSATEG00000008816	-	100	77.273	Anabas_testudineus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	79.499	Anas_platyrhynchos
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.592	ENSACAG00000002501	XPO1	100	79.406	Anolis_carolinensis
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.798	ENSANAG00000020802	XPO1	100	80.612	Aotus_nancymaae
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.967	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	72.756	Astatotilapia_calliptera
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSACLG00000015192	-	100	77.273	Astatotilapia_calliptera
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	77.273	Astyanax_mexicanus
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.976	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	72.766	Astyanax_mexicanus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	79.777	Bos_taurus
ENSCCAG00000037445	XPO1	91	51.920	WBGene00002078	xpo-1	88	43.246	Caenorhabditis_elegans
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.705	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	80.519	Callithrix_jacchus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	79.777	Canis_familiaris
ENSCCAG00000037445	XPO1	92	78.365	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	78.166	Canis_lupus_dingo
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	79.777	Capra_hircus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	79.777	Carlito_syrichta
ENSCCAG00000037445	XPO1	50	74.595	ENSCAPG00000006454	-	100	74.595	Cavia_aperea
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.571	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	78.479	Cavia_porcellus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	81.911	ENSCATG00000032674	XPO1	100	81.725	Cercocebus_atys
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.777	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	79.592	Chinchilla_lanigera
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.705	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	80.519	Chlorocebus_sabaeus
ENSCCAG00000037445	XPO1	76	90.323	ENSCHOG00000012088	XPO1	75	90.323	Choloepus_hoffmanni
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	79.499	Chrysemys_picta_bellii
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	66.235	ENSCING00000024562	-	100	66.235	Ciona_intestinalis
ENSCCAG00000037445	XPO1	90	79.791	ENSCSAVG00000005965	-	86	79.791	Ciona_savignyi
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	83.734	ENSCANG00000028883	XPO1	100	83.734	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.128	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	78.942	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.128	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	78.942	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	74.023	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	73.812	Cynoglossus_semilaevis
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.273	ENSCVAG00000016788	-	100	77.087	Cyprinodon_variegatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	73.748	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	73.562	Cyprinodon_variegatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.644	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	77.458	Danio_rerio
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.954	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	83.155	Danio_rerio
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.870	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	79.685	Dasypus_novemcinctus
ENSCCAG00000037445	XPO1	91	91.667	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	91.667	Dipodomys_ordii
ENSCCAG00000037445	XPO1	99	59.104	FBgn0020497	emb	99	59.104	Drosophila_melanogaster
ENSCCAG00000037445	XPO1	93	84.153	ENSETEG00000018045	XPO1	94	83.971	Echinops_telfairi
ENSCCAG00000037445	XPO1	88	64.354	ENSEBUG00000012580	-	94	69.577	Eptatretus_burgeri
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSEASG00005007223	XPO1	100	79.777	Equus_asinus_asinus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSECAG00000024920	XPO1	100	79.902	Equus_caballus
ENSCCAG00000037445	XPO1	91	98.795	ENSEEUG00000009479	XPO1	83	98.795	Erinaceus_europaeus
ENSCCAG00000037445	XPO1	85	71.626	ENSELUG00000014306	-	99	71.413	Esox_lucius
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	74.524	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	74.313	Esox_lucius
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	79.777	Felis_catus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.499	ENSFALG00000010989	XPO1	100	79.314	Ficedula_albicollis
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.200	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	78.015	Fukomys_damarensis
ENSCCAG00000037445	XPO1	50	72.031	ENSFHEG00000018974	-	100	72.031	Fundulus_heteroclitus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.026	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	73.840	Fundulus_heteroclitus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	71.707	ENSGMOG00000019063	-	100	71.521	Gadus_morhua
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	75.023	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	74.838	Gadus_morhua
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	ENSGALG00000029476	XPO1	100	79.499	Gallus_gallus
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.545	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	72.334	Gambusia_affinis
ENSCCAG00000037445	XPO1	89	75.562	ENSGAFG00000003355	-	98	75.358	Gambusia_affinis
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	73.748	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	73.562	Gasterosteus_aculeatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.273	ENSGACG00000002743	-	100	77.087	Gasterosteus_aculeatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	79.499	Gopherus_agassizii
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	82.004	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	81.818	Gorilla_gorilla
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSHBUG00000020037	-	100	77.273	Haplochromis_burtoni
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.583	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	74.397	Haplochromis_burtoni
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	79.499	Heterocephalus_glaber_female
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	79.499	Heterocephalus_glaber_male
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	74.974	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	74.868	Hippocampus_comes
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	75.696	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	75.510	Ictalurus_punctatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.644	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	77.458	Ictalurus_punctatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	79.777	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.777	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	79.592	Jaculus_jaculus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	73.933	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	73.748	Kryptolebias_marmoratus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.087	ENSKMAG00000016218	-	100	76.994	Kryptolebias_marmoratus
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	70.242	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	70.032	Labrus_bergylta
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSLBEG00000005740	-	100	77.273	Labrus_bergylta
ENSCCAG00000037445	XPO1	94	73.746	ENSLACG00000018213	XPO1	91	73.746	Latimeria_chalumnae
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.015	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	77.829	Lepisosteus_oculatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.777	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	79.592	Loxodonta_africana
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.705	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	80.519	Macaca_fascicularis
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.705	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	80.519	Macaca_mulatta
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.705	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	80.519	Macaca_nemestrina
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	81.818	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	81.633	Mandrillus_leucophaeus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.365	ENSMAMG00000010568	-	100	77.180	Mastacembelus_armatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.490	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	74.304	Mastacembelus_armatus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.583	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	74.397	Maylandia_zebra
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	ENSMZEG00005018158	-	97	77.273	Maylandia_zebra
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ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	ENSMICG00000027770	XPO1	100	79.777	Microcebus_murinus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.314	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	79.128	Microtus_ochrogaster
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ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.650	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	72.439	Mola_mola
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.664	ENSMODG00000002831	XPO1	100	78.479	Monodelphis_domestica
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.180	ENSMALG00000007085	-	100	76.994	Monopterus_albus
ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.257	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	72.257	Monopterus_albus
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.499	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	79.314	Mus_caroli
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ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.406	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	79.221	Mus_pahari
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.499	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	79.314	Mus_spretus
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ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.870	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	79.685	Nannospalax_galili
ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.583	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	74.397	Neolamprologus_brichardi
ENSCCAG00000037445	XPO1	91	82.540	ENSNBRG00000012229	-	100	75.185	Neolamprologus_brichardi
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