EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCGRG00000002191 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Msi1
Alias: Msi1|Msi1h|Musahi1|m-Msi-1
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_crigri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 53153 bases
Position: chrJH001389.1:83084-136236
Accession: 100764296
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00000002993	RRM_1	PF00076.22	6.4e-29	1	2
ENSCGRP00000002993	RRM_1	PF00076.22	6.4e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00000003057	-	3134	XM_007651374	ENSCGRP00000002993	457 (aa)	XP_007649564	UPI000454C111

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	68.182	ENSCGRG00000003141	Msi2	100	70.149

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSG00000135097	MSI1	94	100.000	Homo_sapiens
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSAPOG00000023458	-	94	85.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00000002191	Msi1	69	81.962	ENSACIG00000017754	-	78	81.962	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	85.410	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	76.596	ENSAOCG00000009031	-	95	76.900	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	85.410	Amphiprion_percula
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSAPEG00000006857	-	79	85.410	Amphiprion_percula
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.106	ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.106	Anabas_testudineus
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	81.982	ENSATEG00000023779	-	91	81.982	Anabas_testudineus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	96.960	ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.960	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	94	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00000002191	Msi1	58	96.226	ENSANAG00000027901	-	86	96.226	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSACLG00000000117	-	100	84.802	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSACLG00000011230	MSI1	94	84.802	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	83.891	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.891	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	94	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.696	ENSCAFG00000010283	MSI1	94	99.696	Canis_familiaris
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	94.048	ENSCHIG00000024304	MSI1	95	94.048	Capra_hircus
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	100.000	Cavia_aperea
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	94	100.000	Cebus_capucinus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	94	100.000	Cercocebus_atys
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00000002191	Msi1	52	95.902	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.902	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	96.049	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	96.049	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	94	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	77.508	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.508	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	83.891	ENSCSEG00000008352	-	94	83.891	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.106	ENSCSEG00000005834	-	94	85.106	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00000002191	Msi1	51	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	85.410	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSCGRG00000002191	Msi1	63	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSCGRG00000002191	Msi1	77	87.143	ENSDNOG00000005713	MSI1	94	89.086	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	95	99.102	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	94	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	94	100.000	Equus_caballus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	80.547	ENSELUG00000023280	-	100	80.243	Esox_lucius
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	79.656	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.656	Esox_lucius
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	Felis_catus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.714	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	85.714	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSFHEG00000003560	-	94	85.410	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	76.900	ENSGMOG00000017838	-	90	76.900	Gadus_morhua
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	82.979	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.675	Gadus_morhua
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	90	88.473	Gallus_gallus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	68.373	ENSGAFG00000005860	-	90	68.373	Gambusia_affinis
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.802	Gambusia_affinis
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	81.155	ENSGACG00000008674	-	94	81.155	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.195	ENSGACG00000012679	MSI1	94	84.195	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	96.049	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	96.049	Gopherus_agassizii
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	84.802	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSHBUG00000011841	-	94	84.802	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.696	ENSHGLG00000012782	MSI1	94	99.696	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	83.384	ENSHCOG00000012067	-	90	83.384	Hippocampus_comes
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	80.243	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.243	Hippocampus_comes
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	83.283	ENSIPUG00000001976	msi1	99	79.394	Ictalurus_punctatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	94	100.000	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	82.979	ENSJJAG00000010643	-	94	82.675	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.498	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	84.498	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	82.979	ENSKMAG00000019877	-	100	82.979	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSLBEG00000001375	-	94	84.802	Labrus_bergylta
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	84.802	Labrus_bergylta
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	86.930	ENSLACG00000018287	MSI1	100	86.930	Latimeria_chalumnae
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	100.000	Macaca_mulatta
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	94	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.195	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.195	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSMAMG00000018426	-	94	85.410	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.802	Maylandia_zebra
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSMZEG00005000340	-	94	84.802	Maylandia_zebra
ENSCGRG00000002191	Msi1	50	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	94	100.000	Microcebus_murinus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.696	ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.696	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	75.380	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	75.380	Mola_mola
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	81.818	ENSMMOG00000012265	-	96	81.818	Mola_mola
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.802	Monopterus_albus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.498	ENSMALG00000001426	-	100	84.498	Monopterus_albus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.392	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	94	99.392	Mus_caroli
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.392	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	96.049	Mus_musculus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.088	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	94	99.088	Mus_pahari
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.392	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	94	99.392	Mus_spretus
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	90.179	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	90.179	Myotis_lucifugus
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	Nannospalax_galili
ENSCGRG00000002191	Msi1	70	77.432	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSNBRG00000000841	-	94	84.802	Neolamprologus_brichardi
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	89.634	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	Nomascus_leucogenys
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	77.744	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	77.744	Notamacropus_eugenii
ENSCGRG00000002191	Msi1	69	92.063	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	Ochotona_princeps
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	ENSODEG00000006328	MSI1	100	100.000	Octodon_degus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.802	Oreochromis_niloticus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.106	ENSONIG00000019452	-	94	85.106	Oreochromis_niloticus
ENSCGRG00000002191	Msi1	73	99.678	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	99.678	Oryctolagus_cuniculus
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSORLG00000019978	-	94	85.410	Oryzias_latipes
ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	ENSORLG00000029593	MSI1	94	85.410	Oryzias_latipes
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