EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCGRG00000004570 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_crigri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1874 bases
Position: chrJH000306.1:832089-833962
Accession: 100750681
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00000006246	eRF1_2	PF03464.15	1.7e-37	1	1
ENSCGRP00000006246	eRF1_3	PF03465.15	9e-26	1	1
ENSCGRP00000006246	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00000006350	-	1599	XM_003502237	ENSCGRP00000006246	385 (aa)	XP_003502285	G3HDZ6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	ENSG00000152684	PELO	100	96.623	Homo_sapiens
ENSCGRG00000004570	Pelo	64	80.162	ENSAPOG00000023700	-	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00000004570	Pelo	64	80.162	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.519	ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.965	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.364	ENSAMEG00000007734	PELO	100	96.364	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00000004570	Pelo	97	77.480	ENSACIG00000014386	pelo	97	82.544	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	ENSAOCG00000023717	pelo	97	81.233	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	ENSAPEG00000011235	pelo	97	81.233	Amphiprion_percula
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.597	ENSATEG00000019550	pelo	97	82.842	Anabas_testudineus
ENSCGRG00000004570	Pelo	77	84.564	ENSAPLG00000013265	PELO	96	84.965	Anas_platyrhynchos
ENSCGRG00000004570	Pelo	98	90.160	ENSACAG00000004352	PELO	97	90.080	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSANAG00000014096	PELO	100	97.143	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	ENSACLG00000010305	pelo	97	80.697	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00000004570	Pelo	97	81.769	ENSAMXG00000020299	pelo	97	81.769	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.883	ENSBTAG00000003268	PELO	99	96.883	Bos_taurus
ENSCGRG00000004570	Pelo	99	59.318	WBGene00011280	pelo-1	98	60.054	Caenorhabditis_elegans
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.403	ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.403	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	ENSCAFG00020023234	PELO	100	96.623	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	ENSCHIG00000016410	PELO	99	96.623	Capra_hircus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.883	ENSTSYG00000005203	PELO	100	96.883	Carlito_syrichta
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.403	ENSCPOG00000027406	PELO	100	97.403	Cavia_porcellus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.403	ENSCCAG00000035600	PELO	100	97.403	Cebus_capucinus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSCATG00000011829	PELO	100	97.143	Cercocebus_atys
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.883	ENSCLAG00000005043	PELO	100	96.883	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.143	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSCHOG00000000523	PELO	100	97.143	Choloepus_hoffmanni
ENSCGRG00000004570	Pelo	98	93.085	ENSCPBG00000007544	PELO	97	93.029	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00000004570	Pelo	97	70.241	ENSCING00000001979	-	97	70.241	Ciona_intestinalis
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	70.130	ENSCSAVG00000006158	-	97	70.509	Ciona_savignyi
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSCANG00000023382	PELO	100	97.143	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	98.701	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	98.701	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.039	ENSCSEG00000008807	pelo	97	81.501	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.597	ENSCVAG00000016082	pelo	97	82.574	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.597	ENSDARG00000055477	pelo	97	83.110	Danio_rerio
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	93.523	ENSDNOG00000036721	PELO	97	93.583	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.143	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00000004570	Pelo	96	68.194	FBgn0011207	pelo	94	68.365	Drosophila_melanogaster
ENSCGRG00000004570	Pelo	71	82.456	ENSEBUG00000004955	pelo	95	82.456	Eptatretus_burgeri
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.364	ENSEASG00005013348	PELO	100	96.364	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.299	ENSELUG00000023229	pelo	98	81.972	Esox_lucius
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	ENSFCAG00000032341	PELO	100	96.623	Felis_catus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	94.286	ENSFALG00000004559	PELO	97	94.638	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00000004570	Pelo	74	97.535	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.535	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.697	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00000004570	Pelo	98	81.167	ENSGMOG00000005849	pelo	97	81.501	Gadus_morhua
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.338	ENSGAFG00000019350	pelo	97	82.574	Gambusia_affinis
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.039	ENSGACG00000007245	pelo	97	82.967	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00000004570	Pelo	98	93.351	ENSGAGG00000004018	PELO	97	93.298	Gopherus_agassizii
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSGGOG00000012635	PELO	100	97.143	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	ENSHBUG00000005866	pelo	97	80.697	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.403	ENSHGLG00000005932	PELO	100	97.403	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	95.325	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.325	Heterocephalus_glaber_male
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ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.338	ENSLBEG00000022399	pelo	97	82.574	Labrus_bergylta
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ENSCGRG00000004570	Pelo	100	98.182	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	98.182	Mus_spretus
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ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.818	ENSORLG00020016456	pelo	97	81.769	Oryzias_latipes_hni
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.078	ENSORLG00015014447	pelo	97	82.184	Oryzias_latipes_hsok
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.857	ENSOMEG00000021567	pelo	97	83.110	Oryzias_melastigma
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	ENSOGAG00000027940	PELO	100	96.623	Otolemur_garnettii
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.883	ENSOARG00000008324	PELO	99	96.883	Ovis_aries
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ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.883	ENSPTRG00000034409	PELO	100	96.883	Pan_troglodytes
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSPANG00000010902	PELO	100	97.143	Papio_anubis
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	83.377	ENSPKIG00000015190	pelo	97	83.646	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCGRG00000004570	Pelo	98	92.819	ENSPSIG00000004971	PELO	97	92.761	Pelodiscus_sinensis
ENSCGRG00000004570	Pelo	67	78.295	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.295	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	98.442	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	98.442	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	95.844	ENSPCIG00000004880	PELO	97	96.783	Phascolarctos_cinereus
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.857	ENSPFOG00000007277	pelo	97	82.842	Poecilia_formosa
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	83.117	ENSPLAG00000020787	pelo	97	83.110	Poecilia_latipinna
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.857	ENSPMEG00000016964	pelo	97	82.842	Poecilia_mexicana
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ENSCGRG00000004570	Pelo	99	34.872	YNL001W	-	98	34.726	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	ENSSBOG00000036140	PELO	100	97.143	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCGRG00000004570	Pelo	63	93.852	ENSSHAG00000010770	PELO	95	94.828	Sarcophilus_harrisii
ENSCGRG00000004570	Pelo	98	83.820	ENSSFOG00015013399	pelo	97	84.182	Scleropages_formosus
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