EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCGRG00000005095 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Syf2
Alias: 1110018L13Rik|Cbpin|D4Bwg1551e|Gcipip|Ntc31|mp29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_crigri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9662 bases
Position: chrJH002296.1:44759-54420
Accession: 100753464
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00000007005	SYF2	PF08231.12	6.7e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00000007119	-	3665	XM_007653650	ENSCGRP00000007005	207 (aa)	XP_007651840	UPI00022F67D7

Gene Model

Click here to download ENSCGRG00000005095's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCGRG00000005095's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSG00000117614	SYF2	81	95.918	Homo_sapiens
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.925	ENSAPOG00000001174	syf2	82	85.204	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.472	ENSAMEG00000010115	-	81	94.898	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00000005095	Syf2	94	94.872	ENSAMEG00000010134	-	100	94.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.412	ENSACIG00000023688	syf2	78	82.653	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.859	ENSAOCG00000022046	syf2	83	85.714	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00000005095	Syf2	87	84.530	ENSAOCG00000010912	syf2	56	84.358	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.859	ENSAPEG00000018858	syf2	76	85.714	Amphiprion_percula
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.920	ENSATEG00000007745	syf2	82	84.184	Anabas_testudineus
ENSCGRG00000005095	Syf2	97	86.567	ENSAPLG00000016435	SYF2	98	87.755	Anas_platyrhynchos
ENSCGRG00000005095	Syf2	97	84.500	ENSACAG00000013653	-	96	85.204	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00000005095	Syf2	80	74.850	ENSACAG00000026777	-	94	75.159	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSANAG00000032473	SYF2	82	95.980	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.828	ENSACLG00000019916	syf2	82	82.653	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.417	ENSAMXG00000004051	syf2	82	83.673	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSBTAG00000001651	SYF2	84	95.980	Bos_taurus
ENSCGRG00000005095	Syf2	95	50.754	WBGene00019402	syf-2	85	50.505	Caenorhabditis_elegans
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSCJAG00000046570	SYF2	82	95.980	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.472	ENSCAFG00000012895	-	80	94.898	Canis_familiaris
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	89.950	ENSCAFG00000030331	-	86	90.306	Canis_familiaris
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.472	ENSCAFG00020021091	-	80	94.898	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00000005095	Syf2	100	77.404	ENSCAFG00020021094	-	83	92.949	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSCHIG00000020874	SYF2	83	95.980	Capra_hircus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.949	ENSTSYG00000005114	SYF2	81	94.898	Carlito_syrichta
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.949	ENSCAPG00000010006	SYF2	98	95.385	Cavia_aperea
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSCPOG00000005326	SYF2	80	95.408	Cavia_porcellus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSCCAG00000022459	SYF2	82	95.980	Cebus_capucinus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSCATG00000026917	SYF2	81	95.408	Cercocebus_atys
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.482	ENSCLAG00000008474	SYF2	82	96.482	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSCSAG00000000948	SYF2	81	95.408	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00000005095	Syf2	62	86.822	ENSCHOG00000005273	-	79	86.822	Choloepus_hoffmanni
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	87.437	ENSCPBG00000025073	SYF2	79	87.755	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	55.224	ENSCING00000003017	-	83	55.556	Ciona_intestinalis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	51.244	ENSCSAVG00000006627	-	90	51.515	Ciona_savignyi
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.402	ENSCANG00000037322	SYF2	78	80.612	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	100.000	ENSCGRG00001020733	Syf2	82	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	78.788	ENSCSEG00000000117	syf2	82	78.571	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.910	ENSCVAG00000019543	syf2	82	82.143	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.417	ENSDARG00000004706	syf2	82	83.673	Danio_rerio
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	93.970	ENSDNOG00000047605	SYF2	80	94.388	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.482	ENSDORG00000001274	Syf2	82	96.482	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	59.000	FBgn0033556	CG12343	86	58.974	Drosophila_melanogaster
ENSCGRG00000005095	Syf2	89	77.838	ENSETEG00000015729	SYF2	79	78.022	Echinops_telfairi
ENSCGRG00000005095	Syf2	97	58.706	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.184	Eptatretus_burgeri
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.417	ENSEASG00005004232	-	81	83.673	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSEASG00005004224	-	80	95.918	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSECAG00000010440	-	82	95.918	Equus_caballus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSECAG00000012023	-	81	95.980	Equus_caballus
ENSCGRG00000005095	Syf2	66	81.752	ENSEEUG00000015084	SYF2	74	81.481	Erinaceus_europaeus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.930	ENSELUG00000003465	syf2	82	86.224	Esox_lucius
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSFCAG00000043095	-	80	95.918	Felis_catus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSFCAG00000010324	-	68	95.918	Felis_catus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.354	ENSFALG00000000460	SYF2	79	85.641	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.975	ENSFDAG00000008310	SYF2	81	95.408	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00000005095	Syf2	77	79.375	ENSFHEG00000007238	syf2	70	80.128	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.925	ENSGMOG00000019138	syf2	88	85.204	Gadus_morhua
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	87.437	ENSGALG00000013639	SYF2	78	87.755	Gallus_gallus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.808	ENSGAFG00000019435	syf2	82	80.612	Gambusia_affinis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.920	ENSGACG00000007305	syf2	82	84.184	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	87.940	ENSGAGG00000010670	SYF2	79	88.265	Gopherus_agassizii
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSGGOG00000012796	SYF2	82	95.980	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.828	ENSHBUG00000020477	syf2	84	82.653	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.905	ENSHGLG00000004304	-	80	78.974	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.975	ENSHGLG00000014393	SYF2	80	95.408	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.975	ENSHGLG00100014722	SYF2	80	95.408	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.838	ENSHCOG00000012904	syf2	64	83.673	Hippocampus_comes
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.422	ENSIPUG00000019859	syf2	82	84.694	Ictalurus_punctatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	70	93.793	ENSSTOG00000023984	SYF2	98	93.706	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.482	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.323	ENSKMAG00000013856	syf2	83	82.143	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00000005095	Syf2	97	83.500	ENSLBEG00000014425	syf2	82	84.184	Labrus_bergylta
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.422	ENSLACG00000012064	SYF2	82	84.694	Latimeria_chalumnae
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.859	ENSLOCG00000002728	syf2	78	85.714	Lepisosteus_oculatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.949	ENSLAFG00000023150	-	80	94.898	Loxodonta_africana
ENSCGRG00000005095	Syf2	83	62.791	ENSLAFG00000030814	-	92	62.722	Loxodonta_africana
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSMFAG00000041831	SYF2	81	95.408	Macaca_fascicularis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.975	ENSMMUG00000002968	SYF2	81	95.408	Macaca_mulatta
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSMNEG00000030180	SYF2	81	95.408	Macaca_nemestrina
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSMLEG00000030248	SYF2	81	95.408	Mandrillus_leucophaeus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.323	ENSMAMG00000010403	syf2	81	82.143	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.828	ENSMZEG00005006429	syf2	82	82.653	Maylandia_zebra
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	87.437	ENSMGAG00000002019	SYF2	98	87.755	Meleagris_gallopavo
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	97.990	ENSMAUG00000018974	Syf2	82	97.990	Mesocricetus_auratus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	Microcebus_murinus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.995	ENSMOCG00000022938	Syf2	82	98.995	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.402	ENSMMOG00000002396	syf2	82	80.612	Mola_mola
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	87.065	ENSMODG00000013951	-	86	87.374	Monodelphis_domestica
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.915	ENSMALG00000010706	syf2	81	83.163	Monopterus_albus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.492	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	82	98.492	Mus_caroli
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.492	ENSMUSG00000028821	Syf2	82	98.492	Mus_musculus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.492	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	82	98.492	Mus_pahari
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.492	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	82	98.492	Mus_spretus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.472	ENSMPUG00000015802	-	80	94.898	Mustela_putorius_furo
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.472	ENSMPUG00000015801	-	80	94.898	Mustela_putorius_furo
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSMLUG00000001885	SYF2	82	95.980	Myotis_lucifugus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.985	ENSNGAG00000007912	Syf2	81	96.985	Nannospalax_galili
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	74.242	ENSNBRG00000010720	syf2	83	73.980	Neolamprologus_brichardi
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSNLEG00000035185	SYF2	82	95.980	Nomascus_leucogenys
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSOPRG00000012870	SYF2	82	95.980	Ochotona_princeps
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.412	ENSODEG00000014338	-	81	82.412	Octodon_degus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSODEG00000017664	-	82	95.897	Octodon_degus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.323	ENSONIG00000008213	syf2	82	82.143	Oreochromis_niloticus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	89.950	ENSOANG00000009552	SYF2	97	90.306	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSOCUG00000013050	SYF2	82	95.980	Oryctolagus_cuniculus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.915	ENSORLG00000028820	syf2	84	83.163	Oryzias_latipes
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.333	ENSORLG00020018333	syf2	83	83.163	Oryzias_latipes_hni
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.915	ENSORLG00015014665	syf2	82	83.163	Oryzias_latipes_hsok
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.838	ENSOMEG00000013911	syf2	82	83.673	Oryzias_melastigma
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.482	ENSOGAG00000009962	SYF2	82	96.482	Otolemur_garnettii
ENSCGRG00000005095	Syf2	94	65.128	ENSOARG00000006269	-	100	65.128	Ovis_aries
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.025	ENSOARG00000006348	-	81	95.025	Ovis_aries
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSPPAG00000036579	SYF2	82	95.980	Pan_paniscus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSPPRG00000001651	-	80	95.918	Panthera_pardus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSPPRG00000001638	-	80	95.918	Panthera_pardus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSPTIG00000005711	-	72	95.918	Panthera_tigris_altaica
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSPTIG00000007036	-	80	95.918	Panthera_tigris_altaica
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSPTRG00000000352	SYF2	82	95.980	Pan_troglodytes
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSPANG00000008139	SYF2	81	95.408	Papio_anubis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.422	ENSPKIG00000008130	syf2	83	84.694	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	86.935	ENSPSIG00000011816	SYF2	76	87.245	Pelodiscus_sinensis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.323	ENSPMGG00000008755	syf2	77	82.143	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.492	ENSPEMG00000008283	Syf2	82	98.492	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	92.462	ENSPCIG00000014235	SYF2	78	92.857	Phascolarctos_cinereus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.407	ENSPFOG00000004116	syf2	81	81.633	Poecilia_formosa
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.818	ENSPLAG00000006691	syf2	84	81.633	Poecilia_latipinna
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	78.283	ENSPMEG00000011684	syf2	84	78.061	Poecilia_mexicana
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.407	ENSPREG00000003009	syf2	82	81.633	Poecilia_reticulata
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	ENSPPYG00000001713	SYF2	82	95.980	Pongo_abelii
ENSCGRG00000005095	Syf2	77	77.358	ENSPCOG00000027011	SYF2	73	77.564	Propithecus_coquereli
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.412	ENSPVAG00000005841	SYF2	80	82.653	Pteropus_vampyrus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.828	ENSPNYG00000004979	syf2	82	82.653	Pundamilia_nyererei
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.427	ENSPNAG00000015570	syf2	82	85.714	Pygocentrus_nattereri
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.492	ENSRNOG00000060597	Syf2	82	98.492	Rattus_norvegicus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	92.462	ENSRBIG00000042970	SYF2	81	92.857	Rhinopithecus_bieti
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	ENSRROG00000001347	SYF2	81	95.408	Rhinopithecus_roxellana
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSSBOG00000020184	SYF2	81	95.918	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	90.955	ENSSHAG00000015630	-	79	91.327	Sarcophilus_harrisii
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	91.960	ENSSHAG00000007152	-	95	92.347	Sarcophilus_harrisii
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.422	ENSSFOG00015023647	syf2	83	84.694	Scleropages_formosus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.313	ENSSMAG00000009867	syf2	82	81.122	Scophthalmus_maximus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.838	ENSSDUG00000013072	syf2	82	83.673	Seriola_dumerili
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.417	ENSSLDG00000012677	syf2	82	83.673	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCGRG00000005095	Syf2	76	92.994	ENSSARG00000012889	SYF2	64	92.949	Sorex_araneus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	86.935	ENSSPUG00000005251	SYF2	77	87.245	Sphenodon_punctatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.333	ENSSPAG00000009626	syf2	82	83.163	Stegastes_partitus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	ENSSSCG00000037481	SYF2	81	95.477	Sus_scrofa
ENSCGRG00000005095	Syf2	50	75.000	ENSTGUG00000001126	SYF2	51	76.238	Taeniopygia_guttata
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.818	ENSTRUG00000001499	syf2	79	81.633	Takifugu_rubripes
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	79.899	ENSTNIG00000016912	syf2	88	80.102	Tetraodon_nigroviridis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	67.839	ENSTBEG00000017370	SYF2	77	67.347	Tupaia_belangeri
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.472	ENSTTRG00000003550	SYF2	80	94.898	Tursiops_truncatus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	93.970	ENSUAMG00000002897	SYF2	80	94.388	Ursus_americanus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	93.970	ENSUMAG00000013108	SYF2	80	94.388	Ursus_maritimus
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	93.970	ENSVPAG00000005705	SYF2	80	94.388	Vicugna_pacos
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	93.467	ENSVVUG00000027181	-	79	93.878	Vulpes_vulpes
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.472	ENSVVUG00000027175	-	80	94.898	Vulpes_vulpes
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.427	ENSXETG00000022797	syf2	79	85.714	Xenopus_tropicalis
ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.905	ENSXMAG00000022698	syf2	82	81.122	Xiphophorus_maculatus