EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCGRG00001000263 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Xpo1
Alias: Crm1
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_chok1gshd
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35351 bases
Position: chrscaffold_21:15697354-15732704
Accession: 100770879
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00001000305	CRM1_C	PF08767.11	5.5e-135	1	1
ENSCGRP00001000305	Xpo1	PF08389.12	1.3e-40	1	1
ENSCGRP00001000305	IBN_N	PF03810.19	7.7e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00001000329	-	6109	-	ENSCGRP00001000305	1071 (aa)	XP_003513669	UPI00022F6B3B

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.331	ENSAPOG00000004984	-	100	95.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	89.574	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	89.574	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.601	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	98.601	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	91.915	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	95.638	ENSACIG00000010818	-	100	95.638	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.331	ENSAOCG00000010121	-	100	95.331	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	91.317	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.317	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.331	ENSAPEG00000007038	-	100	95.331	Amphiprion_percula
ENSCGRG00001000263	Xpo1	91	91.770	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	91.770	Amphiprion_percula
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.943	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	90.943	Anabas_testudineus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.331	ENSATEG00000008816	-	100	95.331	Anabas_testudineus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.413	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.413	Anas_platyrhynchos
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.226	ENSACAG00000002501	XPO1	100	98.226	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	ENSANAG00000020802	XPO1	100	97.666	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.145	ENSACLG00000015192	-	100	95.145	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	92.234	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.234	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	92.903	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	92.903	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.705	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.705	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	98.693	Bos_taurus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	99	51.479	WBGene00002078	xpo-1	99	51.479	Caenorhabditis_elegans
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.666	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	98.693	Canis_familiaris
ENSCGRG00001000263	Xpo1	93	98.494	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	98.494	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	98.693	Capra_hircus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	98.693	Carlito_syrichta
ENSCGRG00001000263	Xpo1	53	95.213	ENSCAPG00000006454	-	100	95.213	Cavia_aperea
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.479	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.479	Cavia_porcellus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	78.942	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.128	Cebus_capucinus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.729	ENSCATG00000032674	XPO1	100	97.553	Cercocebus_atys
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.693	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.666	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	83	98.314	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.314	Choloepus_hoffmanni
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.319	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.319	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	80.912	ENSCING00000024562	-	100	80.912	Ciona_intestinalis
ENSCGRG00001000263	Xpo1	99	79.925	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.925	Ciona_savignyi
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	93.838	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	100.000	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	94.468	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.663	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	90.663	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.238	ENSCVAG00000016788	-	100	95.238	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	92.250	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	93.653	Danio_rerio
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	96.172	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.172	Danio_rerio
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.599	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.599	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	92	94.961	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.961	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00001000263	Xpo1	99	70.853	FBgn0020497	emb	99	70.853	Drosophila_melanogaster
ENSCGRG00001000263	Xpo1	94	97.634	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.634	Echinops_telfairi
ENSCGRG00001000263	Xpo1	90	78.942	ENSEBUG00000012580	-	100	87.371	Eptatretus_burgeri
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSEASG00005007223	XPO1	100	98.693	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.693	Equus_caballus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	94.255	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.255	Esox_lucius
ENSCGRG00001000263	Xpo1	87	92.184	ENSELUG00000014306	-	99	92.184	Esox_lucius
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	98.693	Felis_catus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.133	ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.133	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.106	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.106	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.943	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.943	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	89.356	ENSGMOG00000019063	-	100	89.356	Gadus_morhua
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	92.250	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.250	Gadus_morhua
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.413	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.413	Gallus_gallus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	91	95.366	ENSGAFG00000003355	-	98	95.366	Gambusia_affinis
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	91.809	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.809	Gambusia_affinis
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	94.958	ENSGACG00000002743	-	100	94.958	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.663	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.663	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.226	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.226	Gopherus_agassizii
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	97.666	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	91.503	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	91.503	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.238	ENSHBUG00000020037	-	100	95.238	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.599	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	98.599	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.599	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.599	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	94.468	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	94.468	Hippocampus_comes
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	93.277	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.277	Ictalurus_punctatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.705	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	95.705	Ictalurus_punctatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.506	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.506	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.599	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	98.599	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.756	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.756	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	94.678	ENSKMAG00000016218	-	100	94.678	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	89.195	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	89.195	Labrus_bergylta
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.145	ENSLBEG00000005740	-	100	95.145	Labrus_bergylta
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	76.916	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.916	Latimeria_chalumnae
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	96.078	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.078	Lepisosteus_oculatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.319	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.319	Loxodonta_africana
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	97.666	Macaca_fascicularis
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	97.666	Macaca_mulatta
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	97.666	Macaca_nemestrina
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	96.000	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.238	ENSMAMG00000010568	-	100	95.238	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	91.317	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.317	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	91.503	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	91.503	Maylandia_zebra
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.145	ENSMZEG00005018158	-	98	95.366	Maylandia_zebra
ENSCGRG00001000263	Xpo1	68	98.621	ENSMGAG00000001496	-	99	98.621	Meleagris_gallopavo
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	100.000	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	ENSMICG00000027770	XPO1	100	98.693	Microcebus_murinus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	99.533	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	99.533	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00001000263	Xpo1	87	95.197	ENSMMOG00000008001	-	99	95.197	Mola_mola
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	91.702	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	91.702	Mola_mola
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.386	ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.386	Monodelphis_domestica
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	94.865	ENSMALG00000007085	-	100	94.865	Monopterus_albus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	91.180	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.180	Monopterus_albus
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	99.440	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.440	Mus_caroli
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ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.880	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	98.880	Nannospalax_galili
ENSCGRG00001000263	Xpo1	96	94.579	ENSNBRG00000012229	-	100	95.745	Neolamprologus_brichardi
ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	91.503	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	91.503	Neolamprologus_brichardi
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