EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCGRG00001009904 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Eftud2
Alias: 116kDa|Snrp116|U5-116kD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_chok1gshd
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 43929 bases
Position: chrscaffold_12:35987732-36031660
Accession: 100757897
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00001007506	GTP_EFTU	PF00009.27	3e-45	1	1
ENSCGRP00001007506	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.1e-12	1	1
ENSCGRP00001007506	EFG_IV	PF03764.18	2.3e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00001011551	-	3351	XM_003504507	ENSCGRP00001007506	972 (aa)	XP_003504555	G3HLL4

Gene Model

Click here to download ENSCGRG00001009904's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCGRG00001009904's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCGRG00001009904	Eftud2	83	33.803	ENSCGRG00001010826	Efl1	83	33.803
ENSCGRG00001009904	Eftud2	87	39.061	ENSCGRG00001021031	Eef2	99	39.061
ENSCGRG00001009904	Eftud2	51	30.769	ENSCGRG00001022095	GFM1	59	30.769

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.588	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.872	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.770	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.486	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	88.374	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.272	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.872	Amphiprion_percula
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.284	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.181	Anabas_testudineus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	99	93.924	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	93.924	Anas_platyrhynchos
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.325	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.872	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.770	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.383	Bos_taurus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.835	Caenorhabditis_elegans
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.486	Canis_familiaris
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.486	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	Capra_hircus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.280	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	Carlito_syrichta
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.868	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.868	Cavia_aperea
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.868	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	Cavia_porcellus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.486	Cebus_capucinus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	Cercocebus_atys
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.765	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.148	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	77.439	ENSCING00000009372	-	100	77.641	Ciona_intestinalis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	99	77.947	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.486	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	100.000	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.461	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.078	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	90.956	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	Danio_rerio
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.868	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.868	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	75.385	FBgn0039566	CG4849	100	74.769	Drosophila_melanogaster
ENSCGRG00001009904	Eftud2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSCGRG00001009904	Eftud2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.486	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.383	Equus_caballus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.152	Esox_lucius
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.383	Felis_catus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.737	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.737	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.181	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.387	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.049	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.872	Gadus_morhua
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.634	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	Gallus_gallus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.181	Gambusia_affinis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.358	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.486	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.770	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.667	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.074	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	99.074	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.074	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	90.741	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.741	Hippocampus_comes
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.770	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.770	Ictalurus_punctatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	93.621	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	96	99.786	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.786	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.358	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.461	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	95	91.370	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	93.930	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	Latimeria_chalumnae
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	Loxodonta_africana
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.486	Macaca_fascicularis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.486	Macaca_nemestrina
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.486	Mandrillus_leucophaeus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.284	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.181	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.872	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.770	Maylandia_zebra
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.639	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.639	Meleagris_gallopavo
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.794	Mesocricetus_auratus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.486	Microcebus_murinus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	92	82.022	ENSMOCG00000017653	-	90	82.022	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.897	ENSMOCG00000009039	-	100	99.897	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00001009904	Eftud2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.177	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	Monodelphis_domestica
ENSCGRG00001009904	Eftud2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.794	Mus_caroli
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.794	Mus_musculus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.794	Mus_pahari
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.794	Mus_spretus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	97	99.470	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.470	Mustela_putorius_furo
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.486	Myotis_lucifugus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.794	Nannospalax_galili
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.770	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.667	Neolamprologus_brichardi
ENSCGRG00001009904	Eftud2	97	97.662	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	Nomascus_leucogenys
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	95.473	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	Notamacropus_eugenii
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.152	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	Ochotona_princeps
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.765	ENSODEG00000018041	-	100	98.765	Octodon_degus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.872	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.770	Oreochromis_niloticus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.691	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	Oryctolagus_cuniculus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.564	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.461	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes_hni
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.461	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.222	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.222	Otolemur_garnettii
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.383	Ovis_aries
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.588	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.588	Pan_paniscus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.486	Panthera_pardus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.486	Panthera_tigris_altaica
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.588	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	Pan_troglodytes
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.486	Papio_anubis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	93	96.803	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	Pelodiscus_sinensis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	84.156	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.794	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.177	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.177	Phascolarctos_cinereus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.181	Poecilia_formosa
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.181	Poecilia_latipinna
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.181	Poecilia_mexicana
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.045	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	Pongo_abelii
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	95.165	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	Procavia_capensis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	Propithecus_coquereli
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	94.547	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	Pteropus_vampyrus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.770	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.667	Pundamilia_nyererei
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.181	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.284	Pygocentrus_nattereri
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.588	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.588	Rattus_norvegicus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.383	Rhinopithecus_bieti
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	Rhinopithecus_roxellana
ENSCGRG00001009904	Eftud2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	97	99.147	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	Sarcophilus_harrisii
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.461	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	Scleropages_formosus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.667	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.564	Scophthalmus_maximus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	Seriola_dumerili
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.078	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.975	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.049	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	Sorex_araneus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.222	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	Sphenodon_punctatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.078	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.975	Stegastes_partitus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.280	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.280	Sus_scrofa
ENSCGRG00001009904	Eftud2	84	97.080	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.080	Taeniopygia_guttata
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.049	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	Takifugu_rubripes
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	86.578	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.475	Tetraodon_nigroviridis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	93.827	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	Tupaia_belangeri
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.357	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.357	Ursus_americanus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.486	Ursus_maritimus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.486	Vulpes_vulpes
ENSCGRG00001009904	Eftud2	97	94.456	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSCGRG00001009904	Eftud2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	Xiphophorus_maculatus