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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCGRG00001016580 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Tnpo1
Alias: D13Ertd688e|Kpnb2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_chok1gshd
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 71899 bases
Position: chrscaffold_0:81134947-81206845
Accession: 2681523
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00001016175	IBN_N	PF03810.19	5.7e-16	1	1
ENSCGRP00001016183	IBN_N	PF03810.19	2.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00001020419	-	3342	-	ENSCGRP00001016175	898 (aa)	-	A0A061ILI4
ENSCGRT00001020427	-	2682	-	ENSCGRP00001016183	893 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	84.615	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	99	84.615

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.708	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	98.670	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	93.023	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.820	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.820	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_percula
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.371	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	Anabas_testudineus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	98	92.446	ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	Anas_platyrhynchos
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	96.629	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	88.196	ENSANAG00000025351	-	100	88.196	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	64.088	ENSANAG00000027118	-	99	63.978	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.220	ENSANAG00000022453	-	100	99.220	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	91.685	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.601	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.443	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.443	Bos_taurus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.332	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	99.417	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	Canis_familiaris
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	96.517	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.332	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	Capra_hircus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	95.367	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.625	Carlito_syrichta
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.220	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	Cebus_capucinus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.666	Cercocebus_atys
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.220	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.555	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.555	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	94	86.777	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	Choloepus_hoffmanni
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.643	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	75.758	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.666	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	100.000	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.247	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.146	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.705	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	Danio_rerio
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.415	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.415	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	93	99.397	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	57.775	FBgn0035693	CG8219	99	57.435	Drosophila_melanogaster
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	99.251	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	Echinops_telfairi
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	94	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.666	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.443	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.443	Equus_caballus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	86.710	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	Esox_lucius
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.666	Felis_catus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.303	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.332	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.490	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	89.967	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.967	Gadus_morhua
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	96.214	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.265	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	Gambusia_affinis
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.841	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.841	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.416	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	Gopherus_agassizii
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.666	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	82.905	ENSGGOG00000022535	-	99	82.905	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.258	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	98.998	ENSHGLG00000000970	-	100	98.998	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	75.167	ENSHGLG00100000963	-	100	74.610	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	98.832	ENSHGLG00100017090	-	99	98.832	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	99.553	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.553	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.483	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	90	90.136	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	Labrus_bergylta
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	89.419	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	Latimeria_chalumnae
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	95.190	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.190	Lepisosteus_oculatus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	96	98.845	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	Loxodonta_africana
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.666	Macaca_fascicularis
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.555	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	Macaca_mulatta
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.666	Macaca_nemestrina
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.666	Mandrillus_leucophaeus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.371	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.034	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	Maylandia_zebra
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	99.888	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	95.521	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	Microcebus_murinus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	99.888	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.888	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	92.526	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.660	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	Monodelphis_domestica
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.247	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	Monopterus_albus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.777	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	100.000	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.889	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.777	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.555	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.555	Mustela_putorius_furo
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	98.952	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	Myotis_lucifugus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.777	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.777	Nannospalax_galili
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	92.894	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	Neolamprologus_brichardi
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.666	Nomascus_leucogenys
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	91	92.966	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	98.998	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.998	Octodon_degus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.333	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.333	Oreochromis_niloticus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	91	97.805	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	92.874	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	Oryctolagus_cuniculus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	92.607	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	Oryzias_latipes
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.897	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hni
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.010	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hsok
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.897	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	Oryzias_melastigma
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.555	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.555	Otolemur_garnettii
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.443	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	Ovis_aries
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.666	Pan_paniscus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.666	Panthera_pardus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.666	Panthera_tigris_altaica
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	93	86.602	ENSPTRG00000047731	-	100	86.602	Pan_troglodytes
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.666	Pan_troglodytes
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.666	Papio_anubis
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	96.882	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	Pelodiscus_sinensis
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	90.348	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	100.000	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.978	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	Phascolarctos_cinereus
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.057	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.057	Poecilia_formosa
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.057	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	Poecilia_latipinna
ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.258	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	Poecilia_mexicana
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