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Description

Ensembl ID: ENSCGRG00001018883 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Msi1
Alias: Msi1|Msi1h|Musahi1|m-Msi-1
Full Name: musashi RNA-binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_chok1gshd
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20273 bases
Position: chrscaffold_22:13972511-13992783
Accession: 107376
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00001019471	RRM_1	PF00076.22	5.4e-34	1	2
ENSCGRP00001019471	RRM_1	PF00076.22	5.4e-34	2	2
ENSCGRP00001019463	RRM_1	PF00076.22	5.5e-34	1	2
ENSCGRP00001019463	RRM_1	PF00076.22	5.5e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00001023707	-	1104	-	ENSCGRP00001019463	367 (aa)	-	-
ENSCGRT00001023715	-	1089	-	ENSCGRP00001019471	362 (aa)	-	UPI0000073DD8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCGRG00001018883	Msi1	50	46.111	ENSCGRG00001005044	Hnrnpab	75	39.764
ENSCGRG00001018883	Msi1	51	44.324	ENSCGRG00001014634	Hnrnpd	75	39.453
ENSCGRG00001018883	Msi1	52	31.053	ENSCGRG00001010070	-	60	31.217
ENSCGRG00001018883	Msi1	52	41.063	ENSCGRG00001021763	Cirbp	51	41.063
ENSCGRG00001018883	Msi1	52	40.201	ENSCGRG00001018034	-	68	39.914
ENSCGRG00001018883	Msi1	50	37.912	ENSCGRG00001015633	-	73	33.969
ENSCGRG00001018883	Msi1	96	69.143	ENSCGRG00001013330	Msi2	96	70.571
ENSCGRG00001018883	Msi1	51	40.686	ENSCGRG00001008592	Hnrnpa3	67	41.509
ENSCGRG00001018883	Msi1	50	42.308	ENSCGRG00001013129	-	75	39.004
ENSCGRG00001018883	Msi1	50	47.222	ENSCGRG00001010960	Hnrnpdl	75	40.249
ENSCGRG00001018883	Msi1	62	51.064	ENSCGRG00001012928	Rbm38	62	38.158
ENSCGRG00001018883	Msi1	53	32.536	ENSCGRG00001000756	-	64	32.536

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSG00000135097	MSI1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.791	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	84.254	ENSAPOG00000023458	-	100	84.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00001018883	Msi1	95	81.138	ENSACIG00000017754	-	78	82.675	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	77.485	ENSAOCG00000009031	-	95	77.778	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.791	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	83.791	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.791	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	83.791	Amphiprion_percula
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	84.254	ENSAPEG00000006857	-	84	84.254	Amphiprion_percula
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	80.435	ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	Anabas_testudineus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	78.415	ENSATEG00000023779	-	100	78.415	Anabas_testudineus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	96.419	ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00001018883	Msi1	82	96.309	ENSANAG00000027901	-	92	96.309	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.978	ENSACLG00000000117	-	100	85.337	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.242	ENSACLG00000011230	MSI1	100	83.242	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	83.735	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.735	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	99.724	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	99.724	Canis_familiaris
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	95.109	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	95.109	Capra_hircus
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSCGRG00001018883	Msi1	95	92.473	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00001018883	Msi1	75	96.390	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	95.856	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	95.856	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.516	ENSCSEG00000005834	-	100	83.516	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.149	ENSCSEG00000008352	-	100	83.149	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	78.299	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	78.299	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00001018883	Msi1	64	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	84.254	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	84.254	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	80	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	89.970	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.970	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	100	100.000	Equus_caballus
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	80.387	ENSELUG00000023219	MSI1	92	80.387	Esox_lucius
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	81.232	ENSELUG00000023280	-	100	80.938	Esox_lucius
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	Felis_catus
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	84.530	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	84.530	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.791	ENSFHEG00000003560	-	100	83.791	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	82.597	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	Gadus_morhua
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	76.584	ENSGMOG00000017838	-	100	76.584	Gadus_morhua
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	98	86.957	Gallus_gallus
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	85.380	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	85.380	Gambusia_affinis
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	65.205	ENSGAFG00000005860	-	100	65.205	Gambusia_affinis
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	80.663	ENSGACG00000008674	-	100	80.663	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.425	ENSGACG00000012679	MSI1	100	83.425	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	95.580	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	95.580	Gopherus_agassizii
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.978	ENSHBUG00000011841	-	100	83.978	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.242	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	83.242	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	99.724	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	99.724	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	78.689	ENSHCOG00000012067	-	100	78.689	Hippocampus_comes
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	80.938	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.938	Hippocampus_comes
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	82.320	ENSIPUG00000001976	msi1	100	82.320	Ictalurus_punctatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	94	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	84.530	ENSJJAG00000010643	-	100	84.254	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.702	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	83.702	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	83.578	ENSKMAG00000019877	-	100	83.578	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.242	ENSLBEG00000001375	-	100	83.242	Labrus_bergylta
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	84.254	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	84.254	Labrus_bergylta
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	87.427	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.427	Latimeria_chalumnae
ENSCGRG00001018883	Msi1	50	70.000	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	70.000	Lepisosteus_oculatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	91	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCGRG00001018883	Msi1	97	98.291	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	98.291	Macaca_mulatta
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.425	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	96	85.960	ENSMAMG00000018426	-	100	83.791	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.978	ENSMZEG00005000340	-	100	83.978	Maylandia_zebra
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.242	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	Maylandia_zebra
ENSCGRG00001018883	Msi1	64	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSCGRG00001018883	Msi1	71	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	99.724	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	76.316	ENSMMOG00000010492	MSI1	94	76.316	Mola_mola
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	81.571	ENSMMOG00000012265	-	99	80.415	Mola_mola
ENSCGRG00001018883	Msi1	91	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.978	ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	Monopterus_albus
ENSCGRG00001018883	Msi1	98	85.044	ENSMALG00000001426	-	100	85.044	Monopterus_albus
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	99.448	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	99.448	Mus_caroli
ENSCGRG00001018883	Msi1	100	99.448	ENSMUSG00000054256	Msi1	100	99.448	Mus_musculus
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