EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCGRG00001020733 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Syf2
Alias: 1110018L13Rik|Cbpin|D4Bwg1551e|Gcipip|Ntc31|mp29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_chok1gshd
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7764 bases
Position: chrscaffold_2:18477574-18485337
Accession: 100753464
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00001022078	SYF2	PF08231.12	1.1e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00001026323	-	1667	-	ENSCGRP00001022078	242 (aa)	XP_007651840	UPI0004549771

Gene Model

Click here to download ENSCGRG00001020733's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCGRG00001020733's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.123	ENSG00000117614	SYF2	100	90.123	Homo_sapiens
ENSCGRG00001020733	Syf2	92	84.234	ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.753	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001020733	Syf2	81	94.872	ENSAMEG00000010134	-	100	94.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00001020733	Syf2	99	89.256	ENSAMEG00000010115	-	99	89.256	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00001020733	Syf2	96	79.399	ENSACIG00000023688	syf2	92	79.399	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	79.556	ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.556	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	80.992	ENSAOCG00000022046	syf2	97	82.609	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	80.992	ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.992	Amphiprion_percula
ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	99	79.079	Anabas_testudineus
ENSCGRG00001020733	Syf2	82	87.437	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.000	Anas_platyrhynchos
ENSCGRG00001020733	Syf2	84	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00001020733	Syf2	69	74.850	ENSACAG00000026777	-	94	75.159	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	ENSANAG00000032473	SYF2	100	90.535	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001020733	Syf2	92	81.081	ENSACLG00000019916	syf2	99	78.243	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.686	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.686	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.837	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	Bos_taurus
ENSCGRG00001020733	Syf2	86	50.476	WBGene00019402	syf-2	99	46.473	Caenorhabditis_elegans
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	90.535	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00001020733	Syf2	98	82.627	ENSCAFG00000030331	-	97	82.627	Canis_familiaris
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.431	ENSCAFG00000012895	-	100	89.431	Canis_familiaris
ENSCGRG00001020733	Syf2	75	85.165	ENSCAFG00020021094	-	100	68.182	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.431	ENSCAFG00020021091	-	100	89.431	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.358	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.857	Capra_hircus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.947	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	90.947	Carlito_syrichta
ENSCGRG00001020733	Syf2	82	94.949	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.949	Cavia_aperea
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.754	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	89.754	Cavia_porcellus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.947	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	90.947	Cebus_capucinus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.300	ENSCATG00000026917	SYF2	100	89.300	Cercocebus_atys
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.803	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.803	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00001020733	Syf2	99	90.456	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	90.456	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00001020733	Syf2	74	72.928	ENSCHOG00000005273	-	100	72.928	Choloepus_hoffmanni
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	81.928	ENSCPBG00000025073	SYF2	100	82.329	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00001020733	Syf2	87	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.991	Ciona_intestinalis
ENSCGRG00001020733	Syf2	87	50.235	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.235	Ciona_savignyi
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.778	ENSCANG00000037322	SYF2	100	77.778	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	82	100.000	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCGRG00001020733	Syf2	90	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.477	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00001020733	Syf2	91	81.900	ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.099	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	78.099	ENSDARG00000004706	syf2	100	78.099	Danio_rerio
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.612	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	90.612	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.984	ENSDORG00000001274	Syf2	100	90.984	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00001020733	Syf2	90	57.273	FBgn0033556	CG12343	97	57.273	Drosophila_melanogaster
ENSCGRG00001020733	Syf2	94	77.729	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.729	Echinops_telfairi
ENSCGRG00001020733	Syf2	81	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	80.579	ENSEASG00005004232	-	100	80.579	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	92.245	ENSEASG00005004224	-	100	92.245	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00001020733	Syf2	98	92.437	ENSECAG00000010440	-	98	93.191	Equus_caballus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.837	ENSECAG00000012023	-	100	91.837	Equus_caballus
ENSCGRG00001020733	Syf2	75	78.689	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	Erinaceus_europaeus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	79.752	ENSELUG00000003465	syf2	99	79.752	Esox_lucius
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.020	ENSFCAG00000010324	-	85	91.020	Felis_catus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.057	ENSFCAG00000043095	-	100	91.057	Felis_catus
ENSCGRG00001020733	Syf2	84	84.804	ENSFALG00000000460	SYF2	96	79.832	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.947	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	90.947	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00001020733	Syf2	92	67.411	ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.945	ENSGMOG00000019138	syf2	96	85.116	Gadus_morhua
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	87.556	ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.746	Gallus_gallus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	75.620	ENSGAFG00000019435	syf2	100	75.620	Gambusia_affinis
ENSCGRG00001020733	Syf2	89	84.186	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.824	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	99	82.591	ENSGAGG00000010670	SYF2	99	82.996	Gopherus_agassizii
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	90.535	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00001020733	Syf2	96	79.399	ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.399	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	81.250	ENSHGLG00000004304	-	100	75.620	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.164	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.164	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.164	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.164	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.686	ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.686	Hippocampus_comes
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	78.926	ENSIPUG00000019859	syf2	100	78.926	Ictalurus_punctatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	60	93.151	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.151	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	82	96.482	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	Jaculus_jaculus
ENSCGRG00001020733	Syf2	96	77.966	ENSKMAG00000013856	syf2	99	77.966	Kryptolebias_marmoratus
ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.512	Labrus_bergylta
ENSCGRG00001020733	Syf2	94	81.938	ENSLACG00000012064	SYF2	95	81.938	Latimeria_chalumnae
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	79.752	ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.752	Lepisosteus_oculatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	76	62.500	ENSLAFG00000030814	-	100	62.500	Loxodonta_africana
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.204	ENSLAFG00000023150	-	100	90.204	Loxodonta_africana
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.712	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	89.712	Macaca_fascicularis
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.123	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.123	Macaca_mulatta
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.712	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	89.712	Macaca_nemestrina
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.300	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	89.300	Mandrillus_leucophaeus
ENSCGRG00001020733	Syf2	90	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	98	77.273	Mastacembelus_armatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.686	ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.686	Maylandia_zebra
ENSCGRG00001020733	Syf2	82	87.437	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.437	Meleagris_gallopavo
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	96.281	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	96.281	Mesocricetus_auratus
ENSCGRG00001020733	Syf2	82	95.980	ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	Microcebus_murinus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	97.521	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.521	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00001020733	Syf2	96	77.253	ENSMMOG00000002396	syf2	97	77.253	Mola_mola
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	86.900	ENSMODG00000013951	-	100	86.900	Monodelphis_domestica
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.366	ENSMALG00000010706	syf2	100	77.366	Monopterus_albus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	95.868	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	95.868	Mus_caroli
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	95.868	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	95.868	Mus_musculus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	95.868	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	95.868	Mus_pahari
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	95.868	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	95.868	Mus_spretus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.244	ENSMPUG00000015802	-	100	90.244	Mustela_putorius_furo
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.244	ENSMPUG00000015801	-	100	90.244	Mustela_putorius_furo
ENSCGRG00001020733	Syf2	94	94.323	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.323	Myotis_lucifugus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	93.089	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.089	Nannospalax_galili
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	68.548	ENSNBRG00000010720	syf2	96	72.414	Neolamprologus_brichardi
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	90.535	Nomascus_leucogenys
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	92.181	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.181	Ochotona_princeps
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	94.196	ENSODEG00000017664	-	94	94.196	Octodon_degus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	79.508	ENSODEG00000014338	-	99	80.591	Octodon_degus
ENSCGRG00001020733	Syf2	92	81.081	ENSONIG00000008213	syf2	99	78.243	Oreochromis_niloticus
ENSCGRG00001020733	Syf2	83	89.604	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.803	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	91.803	Oryctolagus_cuniculus
ENSCGRG00001020733	Syf2	92	81.532	ENSORLG00000028820	syf2	95	81.532	Oryzias_latipes
ENSCGRG00001020733	Syf2	99	77.083	ENSORLG00020018333	syf2	99	77.083	Oryzias_latipes_hni
ENSCGRG00001020733	Syf2	99	77.917	ENSORLG00015014665	syf2	99	77.917	Oryzias_latipes_hsok
ENSCGRG00001020733	Syf2	92	82.432	ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.432	Oryzias_melastigma
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	92.623	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.623	Otolemur_garnettii
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.498	ENSOARG00000006348	-	100	91.498	Ovis_aries
ENSCGRG00001020733	Syf2	81	65.128	ENSOARG00000006269	-	100	65.128	Ovis_aries
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	90.535	Pan_paniscus
ENSCGRG00001020733	Syf2	99	90.164	ENSPPRG00000001638	-	99	90.164	Panthera_pardus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.057	ENSPPRG00000001651	-	100	91.057	Panthera_pardus
ENSCGRG00001020733	Syf2	98	90.717	ENSPTIG00000005711	-	86	90.717	Panthera_tigris_altaica
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.057	ENSPTIG00000007036	-	100	91.057	Panthera_tigris_altaica
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	90.535	Pan_troglodytes
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.712	ENSPANG00000008139	SYF2	100	89.712	Papio_anubis
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	78.926	ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.926	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCGRG00001020733	Syf2	99	81.301	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	82.988	Pelodiscus_sinensis
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	80.804	ENSPMGG00000008755	syf2	88	80.804	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	97.521	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.521	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	91.071	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	85.200	Phascolarctos_cinereus
ENSCGRG00001020733	Syf2	96	77.682	ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.682	Poecilia_formosa
ENSCGRG00001020733	Syf2	97	77.447	ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.447	Poecilia_latipinna
ENSCGRG00001020733	Syf2	99	74.059	ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.325	Poecilia_mexicana
ENSCGRG00001020733	Syf2	89	81.944	ENSPREG00000003009	syf2	100	76.033	Poecilia_reticulata
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	90.535	Pongo_abelii
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	64.198	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	64.198	Propithecus_coquereli
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	79.592	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	79.592	Pteropus_vampyrus
ENSCGRG00001020733	Syf2	92	81.081	ENSPNYG00000004979	syf2	99	78.243	Pundamilia_nyererei
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	80.579	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.579	Pygocentrus_nattereri
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	95.868	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	95.868	Rattus_norvegicus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	87.654	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	87.654	Rhinopithecus_bieti
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.712	ENSRROG00000001347	SYF2	100	89.712	Rhinopithecus_roxellana
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	90.535	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCGRG00001020733	Syf2	85	90.777	ENSSHAG00000007152	-	100	90.777	Sarcophilus_harrisii
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	89.868	ENSSHAG00000015630	-	92	89.474	Sarcophilus_harrisii
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	79.339	ENSSFOG00015023647	syf2	100	79.339	Scleropages_formosus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	76.033	ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.033	Scophthalmus_maximus
ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	99	78.243	Seriola_dumerili
ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	99	78.243	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	72.541	ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.541	Sorex_araneus
ENSCGRG00001020733	Syf2	93	87.054	ENSSPUG00000005251	SYF2	89	87.054	Sphenodon_punctatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	78.099	ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.099	Stegastes_partitus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.020	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.020	Sus_scrofa
ENSCGRG00001020733	Syf2	62	58.278	ENSTGUG00000001126	SYF2	85	58.235	Taeniopygia_guttata
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	76.446	ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.569	Takifugu_rubripes
ENSCGRG00001020733	Syf2	92	79.372	ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	Tetraodon_nigroviridis
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	70.370	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	Tupaia_belangeri
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.803	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.803	Tursiops_truncatus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.431	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	89.431	Ursus_americanus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.024	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	89.837	Ursus_maritimus
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.984	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.984	Vicugna_pacos
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.431	ENSVVUG00000027175	-	100	89.431	Vulpes_vulpes
ENSCGRG00001020733	Syf2	100	87.500	ENSVVUG00000027181	-	100	87.500	Vulpes_vulpes
ENSCGRG00001020733	Syf2	95	83.843	ENSXETG00000022797	syf2	93	82.759	Xenopus_tropicalis
ENSCGRG00001020733	Syf2	89	81.395	ENSXMAG00000022698	syf2	100	75.207	Xiphophorus_maculatus