EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCGRG00001024665 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cricetulus_griseus_chok1gshd
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1433 bases
Position: chrscaffold_0:96335159-96336591
Accession: 2145154
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCGRP00001027739	eRF1_2	PF03464.15	2.1e-32	1	1
ENSCGRP00001027739	eRF1_3	PF03465.15	1e-25	1	1
ENSCGRP00001027739	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCGRT00001031987	-	1143	-	ENSCGRP00001027739	380 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.325	ENSG00000152684	PELO	100	95.325	Homo_sapiens
ENSCGRG00001024665	Pelo	64	78.947	ENSAPOG00000000616	pelo	90	78.947	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	79.740	ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.161	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001024665	Pelo	64	78.947	ENSAPOG00000023700	-	90	78.947	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.065	ENSAMEG00000007734	PELO	100	95.065	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCGRG00001024665	Pelo	97	76.676	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	Amphilophus_citrinellus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	ENSAOCG00000023717	pelo	97	80.429	Amphiprion_ocellaris
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	ENSAPEG00000011235	pelo	97	80.429	Amphiprion_percula
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.818	ENSATEG00000019550	pelo	97	82.038	Anabas_testudineus
ENSCGRG00001024665	Pelo	77	82.886	ENSAPLG00000013265	PELO	96	83.217	Anas_platyrhynchos
ENSCGRG00001024665	Pelo	98	89.096	ENSACAG00000004352	PELO	97	89.008	Anolis_carolinensis
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSANAG00000014096	PELO	100	95.844	Aotus_nancymaae
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	ENSACLG00000010305	pelo	97	79.893	Astatotilapia_calliptera
ENSCGRG00001024665	Pelo	97	81.233	ENSAMXG00000020299	pelo	97	81.233	Astyanax_mexicanus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSBTAG00000003268	PELO	99	95.584	Bos_taurus
ENSCGRG00001024665	Pelo	99	59.055	WBGene00011280	pelo-1	98	59.786	Caenorhabditis_elegans
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.104	ENSCJAG00000035190	PELO	100	96.104	Callithrix_jacchus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.325	ENSCAFG00020023234	PELO	100	95.325	Canis_lupus_dingo
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.325	ENSCHIG00000016410	PELO	99	95.325	Capra_hircus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSTSYG00000005203	PELO	100	95.584	Carlito_syrichta
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.104	ENSCPOG00000027406	PELO	100	96.104	Cavia_porcellus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.104	ENSCCAG00000035600	PELO	100	96.104	Cebus_capucinus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSCATG00000011829	PELO	100	95.844	Cercocebus_atys
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSCLAG00000005043	PELO	100	95.584	Chinchilla_lanigera
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSCSAG00000016692	PELO	100	95.844	Chlorocebus_sabaeus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSCHOG00000000523	PELO	100	95.844	Choloepus_hoffmanni
ENSCGRG00001024665	Pelo	98	91.755	ENSCPBG00000007544	PELO	97	91.689	Chrysemys_picta_bellii
ENSCGRG00001024665	Pelo	97	69.437	ENSCING00000001979	-	97	69.437	Ciona_intestinalis
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	69.351	ENSCSAVG00000006158	-	97	69.705	Ciona_savignyi
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSCANG00000023382	PELO	100	95.844	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	98.701	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	98.701	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.260	ENSCSEG00000008807	pelo	97	80.697	Cynoglossus_semilaevis
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.818	ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.769	Cyprinodon_variegatus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.078	ENSDARG00000055477	pelo	97	82.574	Danio_rerio
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	92.228	ENSDNOG00000036721	PELO	97	92.246	Dasypus_novemcinctus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSDORG00000016689	Pelo	100	95.844	Dipodomys_ordii
ENSCGRG00001024665	Pelo	96	67.655	FBgn0011207	pelo	94	67.828	Drosophila_melanogaster
ENSCGRG00001024665	Pelo	71	82.143	ENSEBUG00000004955	pelo	95	82.143	Eptatretus_burgeri
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.065	ENSEASG00005013348	PELO	100	95.065	Equus_asinus_asinus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.519	ENSELUG00000023229	pelo	98	81.127	Esox_lucius
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSFCAG00000032341	PELO	100	95.584	Felis_catus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	92.987	ENSFALG00000004559	PELO	97	93.298	Ficedula_albicollis
ENSCGRG00001024665	Pelo	73	95.775	ENSFDAG00000002076	PELO	88	95.775	Fukomys_damarensis
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	ENSFHEG00000009769	pelo	97	79.893	Fundulus_heteroclitus
ENSCGRG00001024665	Pelo	98	80.371	ENSGMOG00000005849	pelo	97	80.697	Gadus_morhua
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.558	ENSGAFG00000019350	pelo	97	81.769	Gambusia_affinis
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.260	ENSGACG00000007245	pelo	97	81.319	Gasterosteus_aculeatus
ENSCGRG00001024665	Pelo	98	92.021	ENSGAGG00000004018	PELO	97	91.957	Gopherus_agassizii
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSGGOG00000012635	PELO	100	95.844	Gorilla_gorilla
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	ENSHBUG00000005866	pelo	97	79.893	Haplochromis_burtoni
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.104	ENSHGLG00000005932	PELO	100	96.104	Heterocephalus_glaber_female
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	94.737	ENSHGLG00100017627	PELO	100	94.737	Heterocephalus_glaber_male
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	78.182	ENSHCOG00000016782	pelo	97	78.552	Hippocampus_comes
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.260	ENSIPUG00000020627	pelo	97	80.429	Ictalurus_punctatus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.104	ENSSTOG00000027378	PELO	100	96.104	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	93.766	ENSJJAG00000015032	Pelo	97	93.834	Jaculus_jaculus
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ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.558	ENSLBEG00000022399	pelo	97	81.769	Labrus_bergylta
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.325	ENSLAFG00000020551	PELO	100	95.325	Loxodonta_africana
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSMFAG00000000651	PELO	100	95.844	Macaca_fascicularis
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ENSCGRG00001024665	Pelo	100	97.143	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.143	Microtus_ochrogaster
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	79.221	ENSMMOG00000001324	pelo	97	79.893	Mola_mola
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ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.883	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	96.883	Mus_spretus
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ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.364	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	96.364	Nannospalax_galili
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	ENSNBRG00000011799	pelo	97	79.893	Neolamprologus_brichardi
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ENSCGRG00001024665	Pelo	96	80.000	ENSONIG00000011511	pelo	97	79.625	Oreochromis_niloticus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.065	ENSOCUG00000023902	PELO	100	95.065	Oryctolagus_cuniculus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.779	ENSORLG00000005827	pelo	97	80.697	Oryzias_latipes
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.039	ENSORLG00020016456	pelo	97	80.965	Oryzias_latipes_hni
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	97	81.322	Oryzias_latipes_hsok
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.078	ENSOMEG00000021567	pelo	97	82.306	Oryzias_melastigma
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.325	ENSOGAG00000027940	PELO	100	95.325	Otolemur_garnettii
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSOARG00000008324	PELO	99	95.584	Ovis_aries
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSPPAG00000038951	PELO	100	95.844	Pan_paniscus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSPPRG00000018800	PELO	100	95.584	Panthera_pardus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSPTIG00000019988	PELO	100	95.584	Panthera_tigris_altaica
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSPTRG00000034409	PELO	100	95.584	Pan_troglodytes
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSPANG00000010902	PELO	100	95.844	Papio_anubis
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.857	ENSPKIG00000015190	pelo	97	83.110	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCGRG00001024665	Pelo	98	91.489	ENSPSIG00000004971	PELO	97	91.421	Pelodiscus_sinensis
ENSCGRG00001024665	Pelo	67	77.132	ENSPMGG00000014561	pelo	95	77.132	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	97.143	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	94.545	ENSPCIG00000004880	PELO	97	95.442	Phascolarctos_cinereus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.078	ENSPFOG00000007277	pelo	97	82.038	Poecilia_formosa
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.338	ENSPLAG00000020787	pelo	97	82.306	Poecilia_latipinna
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.078	ENSPMEG00000016964	pelo	97	82.038	Poecilia_mexicana
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.338	ENSPREG00000023071	pelo	97	82.306	Poecilia_reticulata
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSPPYG00000015451	PELO	96	95.584	Pongo_abelii
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	ENSPCOG00000021178	PELO	100	95.584	Propithecus_coquereli
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	ENSPNYG00000017325	pelo	97	79.893	Pundamilia_nyererei
ENSCGRG00001024665	Pelo	97	82.038	ENSPNAG00000012458	pelo	97	82.038	Pygocentrus_nattereri
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.623	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	96.623	Rattus_norvegicus
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSRBIG00000007299	PELO	100	95.844	Rhinopithecus_bieti
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ENSCGRG00001024665	Pelo	99	34.615	YNL001W	-	98	34.465	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	ENSSBOG00000036140	PELO	100	95.844	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCGRG00001024665	Pelo	63	91.803	ENSSHAG00000010770	PELO	95	92.672	Sarcophilus_harrisii
ENSCGRG00001024665	Pelo	98	83.289	ENSSFOG00015013399	pelo	97	83.646	Scleropages_formosus
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