EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCHIG00000010156 (Gene tree)
Gene ID: 102179215
Gene Symbol: AGO2
Alias: CASC7|EIF2C2|LINC00980|Q10|hAGO2
Full Name: argonaute 2%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Capra_hircus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 80005 bases
Position: chr14:78995168-79075172
Accession: 102179215
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHIP00000006586	PAZ	PF02170.22	1.1e-26	1	1
ENSCHIP00000006589	PAZ	PF02170.22	1.1e-26	1	1
ENSCHIP00000006557	PAZ	PF02170.22	1.1e-26	1	1
ENSCHIP00000006629	PAZ	PF02170.22	1.1e-26	1	1
ENSCHIP00000006586	Piwi	PF02171.17	2.7e-115	1	1
ENSCHIP00000006589	Piwi	PF02171.17	2.7e-115	1	1
ENSCHIP00000006557	Piwi	PF02171.17	2.8e-115	1	1
ENSCHIP00000006629	Piwi	PF02171.17	4.6e-95	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHIT00000014313	AGO2-202	2559	-	ENSCHIP00000006586	852 (aa)	-	UPI000D192488
ENSCHIT00000014358	AGO2-204	2571	-	ENSCHIP00000006629	856 (aa)	-	UPI000D195E08
ENSCHIT00000014317	AGO2-203	2562	-	ENSCHIP00000006589	853 (aa)	-	UPI000D1949F9
ENSCHIT00000014284	AGO2-201	2916	XM_018058614	ENSCHIP00000006557	860 (aa)	XP_017914103	UPI0001640EFD

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	83.412	ENSCHIG00000011848	-	98	83.037
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	81.753	ENSCHIG00000011536	AGO3	99	80.657
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	77.945	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	79.034

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.884	ENSG00000123908	AGO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.445	ENSAPOG00000017586	ago2	98	91.841	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.417	ENSAMEG00000005019	AGO2	100	99.417	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHIG00000010156	AGO2	82	93.669	ENSACIG00000001179	ago2	96	93.669	Amphilophus_citrinellus
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.921	ENSAOCG00000015307	ago2	98	92.308	Amphiprion_ocellaris
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.921	ENSAPEG00000018425	ago2	98	92.308	Amphiprion_percula
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	93.152	ENSATEG00000000529	ago2	96	93.921	Anabas_testudineus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	98.946	ENSAPLG00000010465	AGO2	99	98.946	Anas_platyrhynchos
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	98.485	ENSACAG00000000167	AGO2	99	98.485	Anolis_carolinensis
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.884	ENSANAG00000027399	AGO2	100	99.884	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000010156	AGO2	81	94.606	ENSACLG00000024684	ago2	98	94.606	Astatotilapia_calliptera
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	92.164	ENSAMXG00000014587	ago2	98	93.564	Astyanax_mexicanus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	100.000	ENSBTAG00000001579	AGO2	100	100.000	Bos_taurus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	66.783	WBGene00000106	alg-2	97	66.168	Caenorhabditis_elegans
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	67.431	WBGene00000105	alg-1	88	66.855	Caenorhabditis_elegans
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	100.000	ENSCJAG00000004132	AGO2	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCHIG00000010156	AGO2	95	99.877	ENSCAFG00000001196	AGO2	100	99.877	Canis_familiaris
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.415	ENSCAFG00020014198	AGO2	99	99.883	Canis_lupus_dingo
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.766	ENSTSYG00000007281	AGO2	99	99.766	Carlito_syrichta
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	84.423	ENSCAPG00000013707	AGO2	98	84.460	Cavia_aperea
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	100.000	ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	Cavia_porcellus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.649	ENSCCAG00000035031	AGO2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	96.516	ENSCATG00000038820	AGO2	100	96.516	Cercocebus_atys
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.765	ENSCLAG00000001381	AGO2	100	99.534	Chinchilla_lanigera
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.883	ENSCSAG00000009574	AGO2	95	99.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHIG00000010156	AGO2	83	84.633	ENSCHOG00000008938	-	84	84.633	Choloepus_hoffmanni
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.182	ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.182	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	72.353	ENSCING00000007310	-	98	72.353	Ciona_intestinalis
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	73.113	ENSCSAVG00000005282	-	99	79.104	Ciona_savignyi
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	96.131	ENSCANG00000030899	AGO2	99	96.131	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.070	ENSCGRG00001013557	Ago2	100	99.070	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.178	ENSCGRG00000002120	Ago2	100	99.178	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.445	ENSCSEG00000012273	ago2	98	92.047	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	92.968	ENSCVAG00000008763	ago2	100	92.539	Cyprinodon_variegatus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	92.371	ENSDARG00000061268	ago2	98	91.920	Danio_rerio
ENSCHIG00000010156	AGO2	92	97.595	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	97.595	Dasypus_novemcinctus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.296	ENSDORG00000011242	Ago2	99	99.296	Dipodomys_ordii
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	73.563	FBgn0262739	AGO1	90	74.443	Drosophila_melanogaster
ENSCHIG00000010156	AGO2	81	86.192	ENSEBUG00000006807	-	100	86.192	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000010156	AGO2	81	88.905	ENSEBUG00000014654	ago2	100	88.905	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000010156	AGO2	93	57.263	ENSEBUG00000014681	ago2	99	57.263	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000010156	AGO2	95	86.510	ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000010156	AGO2	81	86.172	ENSEBUG00000008202	-	99	86.172	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000010156	AGO2	95	100.000	ENSEASG00005021922	AGO2	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.767	ENSECAG00000006078	AGO2	100	99.767	Equus_caballus
ENSCHIG00000010156	AGO2	74	99.301	ENSEEUG00000008564	-	74	99.301	Erinaceus_europaeus
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	92.857	ENSELUG00000019378	ago2	98	91.355	Esox_lucius
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.767	ENSFCAG00000002782	AGO2	100	99.767	Felis_catus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	98.945	ENSFALG00000002838	AGO2	99	98.945	Ficedula_albicollis
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	100.000	ENSFDAG00000004759	AGO2	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSCHIG00000010156	AGO2	94	93.432	ENSFHEG00000016080	ago2	98	92.224	Fundulus_heteroclitus
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	92.729	ENSGMOG00000013651	ago2	98	92.518	Gadus_morhua
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	98.264	ENSGALG00000040957	AGO2	100	98.264	Gallus_gallus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	93.026	ENSGAFG00000018026	ago2	97	93.683	Gambusia_affinis
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	92.281	ENSGACG00000006796	ago2	98	93.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.171	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	Gopherus_agassizii
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	100.000	ENSGGOG00000011412	AGO2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	92.558	ENSHBUG00000018515	ago2	98	94.606	Haplochromis_burtoni
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	100.000	ENSHGLG00000005548	AGO2	99	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	88.953	ENSHGLG00100000694	-	98	89.074	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.765	ENSHGLG00100015994	-	99	99.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.921	ENSHCOG00000006200	ago2	99	93.365	Hippocampus_comes
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	91.930	ENSIPUG00000001018	ago2	98	93.103	Ictalurus_punctatus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.648	ENSSTOG00000008113	AGO2	100	99.648	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	98.958	ENSJJAG00000018712	Ago2	100	98.958	Jaculus_jaculus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	91.977	ENSKMAG00000019999	ago2	98	93.445	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.445	ENSLBEG00000005112	ago2	98	92.155	Labrus_bergylta
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	88.249	ENSLACG00000001277	-	99	87.691	Latimeria_chalumnae
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.325	ENSLOCG00000007766	ago2	97	93.325	Lepisosteus_oculatus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.648	ENSLAFG00000012905	AGO2	99	99.648	Loxodonta_africana
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	100.000	ENSMFAG00000015384	AGO2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.767	ENSMMUG00000008045	AGO2	99	99.767	Macaca_mulatta
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.883	ENSMNEG00000019904	AGO2	99	99.883	Macaca_nemestrina
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.883	ENSMLEG00000038874	AGO2	99	99.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	93.246	ENSMAMG00000008662	ago2	99	91.548	Mastacembelus_armatus
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.921	ENSMZEG00005008998	ago2	98	94.606	Maylandia_zebra
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	98.944	ENSMGAG00000012942	AGO2	99	98.944	Meleagris_gallopavo
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	91.080	ENSMAUG00000007785	Ago2	99	91.080	Mesocricetus_auratus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.767	ENSMICG00000004427	AGO2	100	99.767	Microcebus_murinus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.531	ENSMOCG00000000300	Ago2	100	99.531	Microtus_ochrogaster
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	90.584	ENSMMOG00000020165	ago2	100	90.822	Mola_mola
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	98.492	ENSMODG00000000748	AGO2	100	98.492	Monodelphis_domestica
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	92.164	ENSMALG00000020610	ago2	98	93.683	Monopterus_albus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.186	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	100	99.186	Mus_caroli
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.186	ENSMUSG00000036698	Ago2	100	99.186	Mus_musculus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	98.953	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	100	98.953	Mus_pahari
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.177	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	100	99.177	Mus_spretus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.765	ENSMPUG00000001930	AGO2	99	99.765	Mustela_putorius_furo
ENSCHIG00000010156	AGO2	66	87.456	ENSMLUG00000004552	-	100	87.346	Myotis_lucifugus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.412	ENSNGAG00000014556	Ago2	99	99.412	Nannospalax_galili
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.921	ENSNBRG00000006100	ago2	98	92.632	Neolamprologus_brichardi
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	94.743	ENSNLEG00000001461	AGO2	98	94.743	Nomascus_leucogenys
ENSCHIG00000010156	AGO2	88	88.889	ENSMEUG00000001395	AGO2	86	98.039	Notamacropus_eugenii
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	87.089	ENSOPRG00000008795	-	100	87.089	Ochotona_princeps
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	100.000	ENSODEG00000014145	AGO2	100	100.000	Octodon_degus
ENSCHIG00000010156	AGO2	98	93.921	ENSONIG00000010747	ago2	98	92.623	Oreochromis_niloticus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.297	ENSOANG00000007125	AGO2	99	99.297	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	97.658	ENSOCUG00000006066	AGO2	100	97.658	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	91.930	ENSORLG00000004615	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	91.930	ENSORLG00020003449	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes_hni
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	91.930	ENSORLG00015015319	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHIG00000010156	AGO2	100	92.047	ENSOMEG00000017751	ago2	98	93.445	Oryzias_melastigma
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.766	ENSOGAG00000007933	AGO2	100	99.766	Otolemur_garnettii
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	98.363	ENSOARG00000003763	AGO2	100	98.363	Ovis_aries
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.883	ENSPPAG00000037787	AGO2	100	99.883	Pan_paniscus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.766	ENSPPRG00000002594	AGO2	99	99.766	Panthera_pardus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	98.592	ENSPTIG00000007438	AGO2	99	98.592	Panthera_tigris_altaica
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ENSCHIG00000010156	AGO2	100	95.423	ENSXETG00000023755	ago2	100	95.423	Xenopus_tropicalis
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	93.009	ENSXCOG00000000634	ago2	96	93.445	Xiphophorus_couchianus
ENSCHIG00000010156	AGO2	99	92.790	ENSXMAG00000000787	ago2	97	93.445	Xiphophorus_maculatus