EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCHIG00000011603 (Gene tree)
Gene ID: 102186515
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Capra_hircus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 39420 bases
Position: chr19:44199603-44239022
Accession: 102186515
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHIP00000008416	GTP_EFTU	PF00009.27	3.6e-45	1	1
ENSCHIP00000008416	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.2e-12	1	1
ENSCHIP00000008416	EFG_IV	PF03764.18	2.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHIT00000016176	EFTUD2-201	7054	XM_005693941	ENSCHIP00000008416	972 (aa)	XP_005693998	UPI0000EBDE99

Gene Model

Click here to download ENSCHIG00000011603's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
chx03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCHIG00000011603's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	87	39.061	ENSCHIG00000013910	-	99	39.061
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	83	31.681	ENSCHIG00000007833	-	90	31.681

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.181	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.691	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	88.683	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.477	Amphilophus_citrinellus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.284	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.078	Amphiprion_percula
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.593	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.387	Anabas_testudineus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	99	94.233	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.233	Anas_platyrhynchos
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.428	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.428	Anolis_carolinensis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.181	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	Astatotilapia_calliptera
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.505	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	Astyanax_mexicanus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	100.000	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	100.000	Bos_taurus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	99	70.248	WBGene00001166	eftu-2	99	70.041	Caenorhabditis_elegans
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	Callithrix_jacchus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.691	Canis_familiaris
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	Canis_lupus_dingo
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.074	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	Carlito_syrichta
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.074	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.074	Cavia_aperea
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.074	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	Cavia_porcellus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.486	Cebus_capucinus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	Cercocebus_atys
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.971	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	Chinchilla_lanigera
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.457	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	77.744	ENSCING00000009372	-	100	77.744	Ciona_intestinalis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	99	77.902	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.486	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.564	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.593	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	Cyprinodon_variegatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	90.956	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	Danio_rerio
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.868	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.868	Dasypus_novemcinctus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	Dipodomys_ordii
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	75.179	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.691	Equus_asinus_asinus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.588	Equus_caballus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	Felis_catus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.840	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	Ficedula_albicollis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	Fukomys_damarensis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.695	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.387	Fundulus_heteroclitus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	90.947	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.564	Gadus_morhua
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.942	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	Gallus_gallus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.387	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.181	Gambusia_affinis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.667	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.486	Gorilla_gorilla
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.078	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	Haplochromis_burtoni
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.280	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	99.280	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.280	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.280	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.284	Ictalurus_punctatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.872	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.461	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	95	91.694	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	94.033	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.656	Latimeria_chalumnae
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.975	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	91.975	Lepisosteus_oculatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.971	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.971	Loxodonta_africana
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.486	Macaca_fascicularis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.486	Macaca_nemestrina
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.486	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.593	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.387	Mastacembelus_armatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.181	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.975	Maylandia_zebra
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.947	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	Meleagris_gallopavo
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.383	Mesocricetus_auratus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.486	Microcebus_murinus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSMOCG00000009039	-	100	99.486	Microtus_ochrogaster
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	92	81.573	ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	Microtus_ochrogaster
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.177	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	Monodelphis_domestica
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.383	Mus_caroli
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.383	Mus_musculus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.383	Mus_pahari
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.383	Mus_spretus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	97	99.470	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.470	Mustela_putorius_furo
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.691	Myotis_lucifugus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	Nannospalax_galili
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.078	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	Neolamprologus_brichardi
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	97	97.662	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	Nomascus_leucogenys
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	95.473	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	Notamacropus_eugenii
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.358	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.765	ENSODEG00000018041	-	100	98.765	Octodon_degus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.181	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.975	Oreochromis_niloticus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes_hni
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.222	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.222	Otolemur_garnettii
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	100.000	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	100.000	Ovis_aries
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.588	Pan_paniscus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.691	Panthera_pardus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.691	Panthera_tigris_altaica
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	Pan_troglodytes
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.486	Papio_anubis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	84.671	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.588	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.177	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.177	Phascolarctos_cinereus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.387	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.181	Poecilia_formosa
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.387	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.181	Poecilia_latipinna
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.387	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.181	Poecilia_mexicana
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.045	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	Pongo_abelii
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	95.165	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	Procavia_capensis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	Propithecus_coquereli
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	94.959	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	Pteropus_vampyrus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.078	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.872	Pundamilia_nyererei
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.770	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	Pygocentrus_nattereri
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.486	Rattus_norvegicus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.383	Rhinopithecus_bieti
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	Rhinopithecus_roxellana
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	97	34.190	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	97	99.147	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	Sarcophilus_harrisii
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.564	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	Scleropages_formosus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.770	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.564	Scophthalmus_maximus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.284	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	Seriola_dumerili
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.387	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.181	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.049	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	Sorex_araneus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.325	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	Sphenodon_punctatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.387	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.181	Stegastes_partitus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	Sus_scrofa
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	84	97.202	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	Taeniopygia_guttata
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.358	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	Takifugu_rubripes
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	86.885	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	Tetraodon_nigroviridis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	93.827	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	Tupaia_belangeri
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.563	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	Ursus_americanus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.691	Ursus_maritimus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.691	Vulpes_vulpes
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	96	95.192	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.387	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	Xiphophorus_maculatus