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Description

Ensembl ID: ENSCHIG00000011848 (Gene tree)
Gene ID: 102180718
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Capra_hircus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30894 bases
Position: chr3:10918153-10949046
Accession: 102180718
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHIP00000008893	PAZ	PF02170.22	9.6e-29	1	1
ENSCHIP00000008881	PAZ	PF02170.22	4.1e-24	1	1
ENSCHIP00000008845	PAZ	PF02170.22	8.4e-24	1	1
ENSCHIP00000008858	PAZ	PF02170.22	8.4e-24	1	1
ENSCHIP00000008858	Piwi	PF02171.17	1.5e-110	1	1
ENSCHIP00000008845	Piwi	PF02171.17	1.5e-110	1	1
ENSCHIP00000008893	Piwi	PF02171.17	1.6e-110	1	1
ENSCHIP00000008881	Piwi	PF02171.17	1.7e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHIT00000016645	-	2751	-	ENSCHIP00000008881	916 (aa)	-	UPI000D1909B1
ENSCHIT00000016609	-	2589	XM_005678708	ENSCHIP00000008845	862 (aa)	XP_005678765	UPI000D194151
ENSCHIT00000016622	-	2583	-	ENSCHIP00000008858	860 (aa)	-	UPI000D18F7CB
ENSCHIT00000016657	-	2715	-	ENSCHIP00000008893	904 (aa)	-	UPI000D193E25

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCHIG00000011848	-	99	83.762	ENSCHIG00000011536	AGO3	99	84.806
ENSCHIG00000011848	-	98	83.037	ENSCHIG00000010156	AGO2	99	83.412
ENSCHIG00000011848	-	99	82.523	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	83.255

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSG00000092847	AGO1	100	99.488	Homo_sapiens
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSAPOG00000024299	ago1	99	96.222	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	99.072	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHIG00000011848	-	82	91.089	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSAOCG00000017727	ago1	99	96.222	Amphiprion_ocellaris
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.222	Amphiprion_percula
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSATEG00000008523	ago1	99	96.222	Anabas_testudineus
ENSCHIG00000011848	-	99	93.015	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	92.807	Anas_platyrhynchos
ENSCHIG00000011848	-	92	98.475	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.361	Anolis_carolinensis
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSANAG00000037711	AGO1	100	99.072	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000011848	-	100	95.133	ENSACLG00000000890	ago1	99	95.986	Astatotilapia_calliptera
ENSCHIG00000011848	-	80	97.540	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.188	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.188	Bos_taurus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	99.072	Callithrix_jacchus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	99.072	Canis_familiaris
ENSCHIG00000011848	-	100	97.216	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSCHIG00000011848	-	100	77.958	ENSTSYG00000032426	-	99	79.286	Carlito_syrichta
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSTSYG00000009767	-	100	99.072	Carlito_syrichta
ENSCHIG00000011848	-	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.072	Cavia_porcellus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	99.072	Cebus_capucinus
ENSCHIG00000011848	-	100	98.378	ENSCATG00000031521	AGO1	100	99.488	Cercocebus_atys
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.072	Chinchilla_lanigera
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	99.072	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHIG00000011848	-	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSCHIG00000011848	-	100	98.840	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	98.840	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSCANG00000039798	AGO1	100	99.072	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	99.072	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHIG00000011848	-	99	99.063	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	99.528	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHIG00000011848	-	99	94.002	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.432	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHIG00000011848	-	100	95.133	ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.222	Cyprinodon_variegatus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.713	ENSDARG00000092644	ago1	99	96.458	Danio_rerio
ENSCHIG00000011848	-	92	98.602	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	99.488	Dasypus_novemcinctus
ENSCHIG00000011848	-	91	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCHIG00000011848	-	84	92.149	ENSETEG00000007626	AGO1	100	92.149	Echinops_telfairi
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSEASG00005012086	AGO1	100	99.072	Equus_asinus_asinus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSECAG00000024353	AGO1	100	99.072	Equus_caballus
ENSCHIG00000011848	-	92	90.909	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.105	Erinaceus_europaeus
ENSCHIG00000011848	-	92	95.807	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.675	Esox_lucius
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	99.072	Felis_catus
ENSCHIG00000011848	-	92	91.001	ENSFALG00000000790	AGO1	100	91.837	Ficedula_albicollis
ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	98.956	Fukomys_damarensis
ENSCHIG00000011848	-	99	91.901	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.326	Fundulus_heteroclitus
ENSCHIG00000011848	-	88	83.422	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.246	Gadus_morhua
ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	ENSGALG00000002249	AGO1	100	98.956	Gallus_gallus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.340	Gambusia_affinis
ENSCHIG00000011848	-	88	95.899	ENSGACG00000012443	ago1	100	96.804	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHIG00000011848	-	92	98.475	ENSGAGG00000012893	-	100	99.361	Gopherus_agassizii
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	99.072	Gorilla_gorilla
ENSCHIG00000011848	-	100	95.133	ENSHBUG00000010459	ago1	99	95.986	Haplochromis_burtoni
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	99.072	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	99.072	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000011848	-	99	95.775	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.222	Hippocampus_comes
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.222	Ictalurus_punctatus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	99.072	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	98.956	Jaculus_jaculus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSKMAG00000019464	ago1	99	96.222	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	ENSLBEG00000007694	ago1	99	96.340	Labrus_bergylta
ENSCHIG00000011848	-	99	92.623	ENSLACG00000017009	AGO1	100	92.515	Latimeria_chalumnae
ENSCHIG00000011848	-	100	93.279	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.986	Lepisosteus_oculatus
ENSCHIG00000011848	-	99	99.063	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.529	Loxodonta_africana
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	99.072	Macaca_fascicularis
ENSCHIG00000011848	-	99	94.070	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	94.781	Macaca_mulatta
ENSCHIG00000011848	-	100	95.128	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	99.488	Macaca_nemestrina
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	99.072	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSMAMG00000008381	ago1	99	96.222	Mastacembelus_armatus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.133	ENSMZEG00005007996	ago1	99	95.986	Maylandia_zebra
ENSCHIG00000011848	-	99	93.403	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	93.612	Meleagris_gallopavo
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	99.072	Mesocricetus_auratus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSMICG00000016147	AGO1	100	99.072	Microcebus_murinus
ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	98.956	Microtus_ochrogaster
ENSCHIG00000011848	-	78	97.630	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSCHIG00000011848	-	100	98.724	ENSMODG00000023335	AGO1	100	98.724	Monodelphis_domestica
ENSCHIG00000011848	-	99	95.657	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.420	Monopterus_albus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	Mus_caroli
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.458	Mus_musculus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.458	Mus_pahari
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.458	Mus_spretus
ENSCHIG00000011848	-	84	98.893	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	99.861	Mustela_putorius_furo
ENSCHIG00000011848	-	61	98.102	ENSMLUG00000009628	AGO1	100	98.664	Myotis_lucifugus
ENSCHIG00000011848	-	100	98.840	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	98.840	Nannospalax_galili
ENSCHIG00000011848	-	92	95.807	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.675	Neolamprologus_brichardi
ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	98.956	Nomascus_leucogenys
ENSCHIG00000011848	-	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCHIG00000011848	-	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSODEG00000005321	AGO1	100	99.072	Octodon_degus
ENSCHIG00000011848	-	99	95.540	ENSONIG00000016345	ago1	99	95.986	Oreochromis_niloticus
ENSCHIG00000011848	-	100	91.580	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.580	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	98.956	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSORLG00000014965	ago1	99	96.222	Oryzias_latipes
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSORLG00020018253	ago1	99	96.222	Oryzias_latipes_hni
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSORLG00015003287	ago1	99	96.222	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	ENSOMEG00000020528	ago1	99	96.222	Oryzias_melastigma
ENSCHIG00000011848	-	99	99.063	ENSOGAG00000010279	AGO1	100	99.185	Otolemur_garnettii
ENSCHIG00000011848	-	100	99.188	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.188	Ovis_aries
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	99.072	Pan_paniscus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	99.072	Panthera_pardus
ENSCHIG00000011848	-	100	98.840	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	98.840	Panthera_tigris_altaica
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	99.072	Pan_troglodytes
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSPANG00000009060	AGO1	100	99.072	Papio_anubis
ENSCHIG00000011848	-	98	98.111	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.575	Pelodiscus_sinensis
ENSCHIG00000011848	-	81	96.392	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.668	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.072	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHIG00000011848	-	100	98.724	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	98.724	Phascolarctos_cinereus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	ENSPFOG00000005867	ago1	99	96.340	Poecilia_formosa
ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	ENSPREG00000006534	ago1	99	96.340	Poecilia_reticulata
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ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	ENSPVAG00000005082	AGO1	100	99.072	Pteropus_vampyrus
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ENSCHIG00000011848	-	100	97.103	ENSXETG00000004364	ago1	100	97.103	Xenopus_tropicalis
ENSCHIG00000011848	-	92	95.172	ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.036	Xiphophorus_couchianus
ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.340	Xiphophorus_maculatus