EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCHIG00000015082 (Gene tree)
Gene ID: 102168640
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Capra_hircus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28485 bases
Position: chr11:43112278-43140762
Accession: 102168640
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHIP00000013796	PAP_RNA-bind	PF04926.15	9.6e-28	1	2
ENSCHIP00000013796	PAP_RNA-bind	PF04926.15	9.6e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHIT00000021589	PAPOLG-201	2907	XM_005686632	ENSCHIP00000013796	740 (aa)	XP_005686689	UPI0003AF8CE6

Gene Model

Click here to download ENSCHIG00000015082's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
chx03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCHIG00000015082's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	58.476	ENSCHIG00000025004	-	94	67.928

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	ENSG00000115421	PAPOLG	100	99.145	Homo_sapiens
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.340	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.580	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	96.341	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	96.341	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.850	ENSACIG00000010546	papolg	99	69.355	Amphilophus_citrinellus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.340	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.606	Amphiprion_ocellaris
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.473	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.739	Amphiprion_percula
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.836	ENSATEG00000009007	papolg	96	73.103	Anabas_testudineus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	98	74.764	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	74.764	Anas_platyrhynchos
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	81	64.039	ENSACAG00000015048	-	100	64.039	Anolis_carolinensis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	94.467	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.121	ENSACLG00000015592	papolg	89	69.884	Astatotilapia_calliptera
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.859	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.859	Astyanax_mexicanus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	99.459	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	99.459	Bos_taurus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.737	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.737	Callithrix_jacchus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.356	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	89.731	Canis_familiaris
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.716	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	95.716	Canis_lupus_dingo
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.142	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	95.142	Carlito_syrichta
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	51	91.339	ENSCAPG00000014901	-	100	91.339	Cavia_aperea
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.007	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.007	Cavia_porcellus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.737	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.737	Cebus_capucinus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	91	98.268	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.268	Cercocebus_atys
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.277	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.277	Chinchilla_lanigera
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.872	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	94.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	89	92.868	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.868	Choloepus_hoffmanni
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	68	64.752	ENSCING00000024664	-	94	64.752	Ciona_intestinalis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	65	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.007	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	95.007	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	92.906	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	92.906	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	92.906	ENSCGRG00000005552	-	100	92.906	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.282	ENSCSEG00000000771	papolg	99	69.839	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	90	81.802	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	Cyprinodon_variegatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	73.245	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.245	Danio_rerio
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	93.522	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.522	Dasypus_novemcinctus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	58	98.834	ENSDORG00000016228	Papolg	100	98.834	Dipodomys_ordii
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	73.306	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.243	Echinops_telfairi
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	65	57.113	ENSEBUG00000005042	-	82	57.113	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	60	70.573	ENSEBUG00000004020	papolg	94	70.573	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.356	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	96.356	Equus_asinus_asinus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.491	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	96.070	Equus_caballus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	83.941	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	Erinaceus_europaeus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.017	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.150	Esox_lucius
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.356	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	96.356	Felis_catus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	65.960	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.960	Ficedula_albicollis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	94.467	Fukomys_damarensis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	66	61.996	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.158	Fundulus_heteroclitus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	87	82.671	ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.671	Gadus_morhua
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	70.706	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.706	Gallus_gallus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.579	ENSGAFG00000003263	papolg	96	69.829	Gambusia_affinis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	71.448	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.318	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.602	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	94.602	Gorilla_gorilla
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.121	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.375	Haplochromis_burtoni
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	94.309	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.309	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.737	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	94.737	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	70.120	ENSHCOG00000006782	papolg	89	70.518	Hippocampus_comes
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	71.802	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.886	Ictalurus_punctatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.142	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.142	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	58	98.601	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	98.601	Jaculus_jaculus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	70.651	ENSKMAG00000016439	papolg	96	70.651	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.502	ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.374	Labrus_bergylta
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	70.667	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.667	Latimeria_chalumnae
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	73.987	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.987	Lepisosteus_oculatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	93.809	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	Loxodonta_africana
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.142	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	95.142	Macaca_fascicularis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.142	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	95.142	Macaca_mulatta
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	86.729	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	86.729	Macaca_nemestrina
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.007	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	95.007	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.074	ENSMAMG00000010667	papolg	99	69.839	Mastacembelus_armatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	70.274	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.999	Maylandia_zebra
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	70.912	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.912	Meleagris_gallopavo
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	93.179	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.179	Mesocricetus_auratus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.872	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	94.872	Microcebus_murinus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	93.252	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.252	Microtus_ochrogaster
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	71.485	ENSMMOG00000008020	papolg	99	72.016	Mola_mola
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	87.534	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.534	Monodelphis_domestica
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.074	ENSMALG00000007012	papolg	97	72.074	Monopterus_albus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.065	Mus_caroli
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.332	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.065	Mus_musculus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.062	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	Mus_pahari
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.197	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.065	Mus_spretus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.491	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	96.491	Mustela_putorius_furo
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	93.902	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	93.902	Myotis_lucifugus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.332	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	94.332	Nannospalax_galili
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	62.880	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.672	Neolamprologus_brichardi
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	58	98.834	ENSNLEG00000009507	-	100	98.834	Nomascus_leucogenys
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	81	78.767	ENSMEUG00000013605	-	87	78.767	Notamacropus_eugenii
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.737	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	94.737	Ochotona_princeps
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	58	93.897	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	93.897	Octodon_degus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	64.973	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.604	Oreochromis_niloticus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	86.193	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	86.193	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.412	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	95.412	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.221	ENSORLG00000001577	papolg	96	69.749	Oryzias_latipes
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.721	ENSORLG00020002482	papolg	96	70.479	Oryzias_latipes_hni
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.221	ENSORLG00015008836	papolg	96	69.749	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.774	ENSOMEG00000001406	papolg	99	69.525	Oryzias_melastigma
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	58	87.907	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	87.907	Otolemur_garnettii
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	99.730	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	99.730	Ovis_aries
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	94.467	Pan_paniscus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.356	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	96.356	Panthera_pardus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.221	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.221	Panthera_tigris_altaica
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	94.467	Pan_troglodytes
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	91.117	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	91.117	Papio_anubis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	91	71.802	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	71.802	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.244	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.244	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	78.812	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.812	Pelodiscus_sinensis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	92.633	ENSPEMG00000008960	-	100	92.633	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	53.704	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.704	Petromyzon_marinus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	66	63.395	ENSPMAG00000004864	-	96	63.395	Petromyzon_marinus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	87.450	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.450	Phascolarctos_cinereus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.880	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.120	Poecilia_formosa
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.970	ENSPLAG00000018445	papolg	96	69.777	Poecilia_latipinna
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.791	ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.856	Poecilia_mexicana
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.490	ENSPREG00000010358	papolg	96	68.979	Poecilia_reticulata
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.467	Pongo_abelii
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	81.633	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	Procavia_capensis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	84.076	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	84.076	Propithecus_coquereli
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	89	94.326	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.326	Pteropus_vampyrus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	70.350	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.350	Pundamilia_nyererei
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	73.190	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.190	Pygocentrus_nattereri
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.467	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	94.467	Rattus_norvegicus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	89.069	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	89.069	Rhinopithecus_bieti
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.872	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.872	Rhinopithecus_roxellana
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.737	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.737	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	94	87.801	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	Sarcophilus_harrisii
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	64.113	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.113	Scleropages_formosus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	71.049	ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.449	Scleropages_formosus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.074	ENSSDUG00000000912	papolg	99	70.310	Seriola_dumerili
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.112	ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.244	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	77.733	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	77.733	Sphenodon_punctatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	70.207	ENSSPAG00000009004	papolg	99	70.040	Stegastes_partitus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	97.706	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.706	Sus_scrofa
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	73	76.753	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	100	76.753	Taeniopygia_guttata
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	70.912	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.912	Takifugu_rubripes
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	66.316	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.316	Tetraodon_nigroviridis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	87.347	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	87.347	Tupaia_belangeri
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	92.038	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	92.038	Tursiops_truncatus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	96.453	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	96.453	Ursus_americanus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	96.453	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	96.453	Ursus_maritimus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	92.653	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	Vicugna_pacos
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.626	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	96.626	Vulpes_vulpes
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	74.403	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	Xenopus_tropicalis
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	67	85.484	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.484	Xiphophorus_couchianus
ENSCHIG00000015082	PAPOLG	73	82.897	ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.897	Xiphophorus_maculatus