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Description

Ensembl ID: ENSCHIG00000016410 (Gene tree)
Gene ID: 102172484
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Capra_hircus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5711 bases
Position: chr20:26305090-26310800
Accession: 102172484
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHIP00000015959	eRF1_2	PF03464.15	7.3e-37	1	1
ENSCHIP00000015959	eRF1_3	PF03465.15	3.8e-27	1	1
ENSCHIP00000015959	eRF1_1	PF03463.15	2e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHIT00000023765	PELO-201	5405	XM_005694722	ENSCHIP00000015959	386 (aa)	XP_005694779	UPI0008473987

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
chx03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.182	ENSG00000152684	PELO	100	98.182	Homo_sapiens
ENSCHIG00000016410	PELO	64	79.757	ENSAPOG00000023700	-	90	79.757	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000016410	PELO	64	79.757	ENSAPOG00000000616	pelo	90	79.757	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.221	ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.221	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.662	ENSAMEG00000007734	PELO	100	97.662	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHIG00000016410	PELO	97	76.676	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	Amphilophus_citrinellus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSAOCG00000023717	pelo	100	79.481	Amphiprion_ocellaris
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSAPEG00000011235	pelo	100	79.481	Amphiprion_percula
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	Anabas_testudineus
ENSCHIG00000016410	PELO	77	83.893	ENSAPLG00000013265	PELO	100	83.893	Anas_platyrhynchos
ENSCHIG00000016410	PELO	97	90.426	ENSACAG00000004352	PELO	100	90.130	Anolis_carolinensis
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.442	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSACLG00000010305	pelo	100	79.481	Astatotilapia_calliptera
ENSCHIG00000016410	PELO	97	80.697	ENSAMXG00000020299	pelo	100	79.534	Astyanax_mexicanus
ENSCHIG00000016410	PELO	100	99.741	ENSBTAG00000003268	PELO	100	99.741	Bos_taurus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	58.005	WBGene00011280	pelo-1	100	58.005	Caenorhabditis_elegans
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.701	Callithrix_jacchus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.922	ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.922	Canis_lupus_dingo
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.701	Carlito_syrichta
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	Cavia_porcellus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.701	Cebus_capucinus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.442	Cercocebus_atys
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.182	ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	Chinchilla_lanigera
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.442	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.922	ENSCHOG00000000523	PELO	100	97.922	Choloepus_hoffmanni
ENSCHIG00000016410	PELO	97	93.351	ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHIG00000016410	PELO	97	68.633	ENSCING00000001979	-	100	69.091	Ciona_intestinalis
ENSCHIG00000016410	PELO	99	70.649	ENSCSAVG00000006158	-	100	70.649	Ciona_savignyi
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.442	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	95.325	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.325	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHIG00000016410	PELO	99	96.623	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSCSEG00000008807	pelo	100	79.481	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.039	Cyprinodon_variegatus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.039	Danio_rerio
ENSCHIG00000016410	PELO	99	95.078	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.078	Dasypus_novemcinctus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.403	Dipodomys_ordii
ENSCHIG00000016410	PELO	96	67.385	FBgn0011207	pelo	96	67.018	Drosophila_melanogaster
ENSCHIG00000016410	PELO	71	81.871	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.871	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.182	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.182	Equus_asinus_asinus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.740	ENSELUG00000023229	pelo	100	79.740	Esox_lucius
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.922	ENSFCAG00000032341	PELO	100	97.922	Felis_catus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	94.026	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.026	Ficedula_albicollis
ENSCHIG00000016410	PELO	74	98.239	ENSFDAG00000002076	PELO	88	98.239	Fukomys_damarensis
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.221	ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.221	Fundulus_heteroclitus
ENSCHIG00000016410	PELO	98	79.841	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.481	Gadus_morhua
ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.260	ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.260	Gambusia_affinis
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSGACG00000007245	pelo	100	79.481	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHIG00000016410	PELO	97	93.617	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	Gopherus_agassizii
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.442	Gorilla_gorilla
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.481	Haplochromis_burtoni
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.182	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.182	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHIG00000016410	PELO	99	96.104	ENSHGLG00100017627	PELO	100	96.104	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000016410	PELO	99	77.662	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	Hippocampus_comes
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.221	ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.221	Ictalurus_punctatus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	94.026	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	94.026	Jaculus_jaculus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.519	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.519	Labrus_bergylta
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.442	Loxodonta_africana
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSMFAG00000000651	PELO	100	98.442	Macaca_fascicularis
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSMMUG00000039101	PELO	100	98.442	Macaca_mulatta
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.442	Macaca_nemestrina
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSMLEG00000039113	PELO	100	98.442	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHIG00000016410	PELO	97	82.574	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	Mastacembelus_armatus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSMZEG00005014258	pelo	100	79.481	Maylandia_zebra
ENSCHIG00000016410	PELO	99	96.623	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	96.623	Mesocricetus_auratus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.701	Microcebus_murinus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.143	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.143	Microtus_ochrogaster
ENSCHIG00000016410	PELO	99	78.442	ENSMMOG00000001324	pelo	100	78.442	Mola_mola
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	ENSMALG00000008194	pelo	100	81.299	Monopterus_albus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.403	Mus_caroli
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.403	Mus_musculus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.662	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.662	Mus_pahari
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.403	Mus_spretus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	95.584	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.584	Myotis_lucifugus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.662	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.662	Nannospalax_galili
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.481	Neolamprologus_brichardi
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSNLEG00000035970	PELO	100	98.442	Nomascus_leucogenys
ENSCHIG00000016410	PELO	99	94.545	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.545	Notamacropus_eugenii
ENSCHIG00000016410	PELO	98	97.098	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.098	Ochotona_princeps
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	Octodon_degus
ENSCHIG00000016410	PELO	96	80.000	ENSONIG00000011511	pelo	100	79.481	Oreochromis_niloticus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.182	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.182	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.519	ENSORLG00000005827	pelo	100	80.519	Oryzias_latipes
ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.779	ENSORLG00020016456	pelo	100	80.779	Oryzias_latipes_hni
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.039	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	ENSOMEG00000021567	pelo	100	81.299	Oryzias_melastigma
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	ENSOGAG00000027940	PELO	100	97.403	Otolemur_garnettii
ENSCHIG00000016410	PELO	100	99.741	ENSOARG00000008324	PELO	100	99.741	Ovis_aries
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.442	Pan_paniscus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.922	ENSPPRG00000018800	PELO	100	97.922	Panthera_pardus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.922	ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.922	Panthera_tigris_altaica
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.701	Pan_troglodytes
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.442	Papio_anubis
ENSCHIG00000016410	PELO	99	82.078	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCHIG00000016410	PELO	97	93.085	ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	Pelodiscus_sinensis
ENSCHIG00000016410	PELO	67	77.907	ENSPMGG00000014561	pelo	95	77.907	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.143	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHIG00000016410	PELO	99	96.883	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.883	Phascolarctos_cinereus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.039	Poecilia_formosa
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.299	Poecilia_latipinna
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.039	Poecilia_mexicana
ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	ENSPREG00000023071	pelo	100	81.299	Poecilia_reticulata
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.182	ENSPPYG00000015451	PELO	96	98.182	Pongo_abelii
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.701	Propithecus_coquereli
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSPNYG00000017325	pelo	100	79.481	Pundamilia_nyererei
ENSCHIG00000016410	PELO	97	81.233	ENSPNAG00000012458	pelo	100	80.052	Pygocentrus_nattereri
ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.143	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.143	Rattus_norvegicus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSRBIG00000007299	PELO	100	98.442	Rhinopithecus_bieti
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.442	Rhinopithecus_roxellana
ENSCHIG00000016410	PELO	97	34.115	YNL001W	-	98	34.115	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	ENSSBOG00000036140	PELO	100	98.442	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCHIG00000016410	PELO	63	95.492	ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	Sarcophilus_harrisii
ENSCHIG00000016410	PELO	98	83.289	ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	Scleropages_formosus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	ENSSMAG00000017171	pelo	100	79.481	Scophthalmus_maximus
ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.000	ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.000	Seriola_dumerili
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ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.299	Xiphophorus_maculatus