EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCHIG00000020874 (Gene tree)
Gene ID: 102183649
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Capra_hircus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8026 bases
Position: chr2:8218937-8226962
Accession: 102183649
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHIP00000023216	SYF2	PF08231.12	4.7e-54	1	1
ENSCHIP00000023211	SYF2	PF08231.12	5.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHIT00000031071	SYF2-201	726	-	ENSCHIP00000023211	241 (aa)	-	UPI000D18E94B
ENSCHIT00000031076	SYF2-202	732	XM_018055998	ENSCHIP00000023216	243 (aa)	XP_017911487	UPI000D194F63

Gene Model

Click here to download ENSCHIG00000020874's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
chx03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCHIG00000020874's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	91.770	ENSG00000117614	SYF2	100	91.770	Homo_sapiens
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	83.784	ENSAPOG00000001174	syf2	99	79.583	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000020874	SYF2	81	97.436	ENSAMEG00000010134	-	100	97.436	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	94.167	ENSAMEG00000010115	-	99	94.167	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHIG00000020874	SYF2	95	78.970	ENSACIG00000023688	syf2	93	78.970	Amphilophus_citrinellus
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	78.475	ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.475	Amphiprion_ocellaris
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	79.424	ENSAOCG00000022046	syf2	100	79.424	Amphiprion_ocellaris
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	80.000	ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.000	Amphiprion_percula
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	82.949	ENSATEG00000007745	syf2	99	77.917	Anabas_testudineus
ENSCHIG00000020874	SYF2	83	88.945	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	Anas_platyrhynchos
ENSCHIG00000020874	SYF2	69	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSCHIG00000020874	SYF2	85	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.724	ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.593	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	80.631	ENSACLG00000019916	syf2	99	76.667	Astatotilapia_calliptera
ENSCHIG00000020874	SYF2	97	78.059	ENSAMXG00000004051	syf2	99	78.059	Astyanax_mexicanus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	97.959	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	99.153	Bos_taurus
ENSCHIG00000020874	SYF2	86	50.952	WBGene00019402	syf-2	99	47.210	Caenorhabditis_elegans
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.724	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.593	Callithrix_jacchus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.496	ENSCAFG00000012895	-	100	93.496	Canis_familiaris
ENSCHIG00000020874	SYF2	94	88.106	ENSCAFG00000030331	-	97	88.106	Canis_familiaris
ENSCHIG00000020874	SYF2	75	89.011	ENSCAFG00020021094	-	83	97.436	Canis_lupus_dingo
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.496	ENSCAFG00020021091	-	100	93.496	Canis_lupus_dingo
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.277	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.181	Carlito_syrichta
ENSCHIG00000020874	SYF2	82	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.653	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.653	Cavia_porcellus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	94.142	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.004	Cebus_capucinus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.469	ENSCATG00000026917	SYF2	100	90.535	Cercocebus_atys
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	95.763	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.469	Chinchilla_lanigera
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.469	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.535	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHIG00000020874	SYF2	75	77.901	ENSCHOG00000005273	-	100	77.901	Choloepus_hoffmanni
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	85.062	ENSCPBG00000025073	SYF2	97	85.477	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHIG00000020874	SYF2	88	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSCHIG00000020874	SYF2	88	51.643	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.643	Ciona_savignyi
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	79.498	ENSCANG00000037322	SYF2	100	77.778	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.857	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.358	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHIG00000020874	SYF2	83	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	100	72.016	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	81.448	ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.178	Cyprinodon_variegatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	97	78.571	ENSDARG00000004706	syf2	100	78.571	Danio_rerio
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.469	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.469	Dasypus_novemcinctus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.213	ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.213	Dipodomys_ordii
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	56.818	FBgn0033556	CG12343	97	56.818	Drosophila_melanogaster
ENSCHIG00000020874	SYF2	93	77.578	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	Echinops_telfairi
ENSCHIG00000020874	SYF2	82	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	84.362	ENSEASG00005004232	-	100	84.362	Equus_asinus_asinus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.469	ENSEASG00005004224	-	100	93.469	Equus_asinus_asinus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	96.653	ENSECAG00000012023	-	100	95.102	Equus_caballus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	95.763	ENSECAG00000010440	-	99	95.763	Equus_caballus
ENSCHIG00000020874	SYF2	75	83.152	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	83.152	Erinaceus_europaeus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	80.335	ENSELUG00000003465	syf2	100	79.012	Esox_lucius
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000043095	-	100	93.089	Felis_catus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	94.937	ENSFCAG00000010324	-	82	94.937	Felis_catus
ENSCHIG00000020874	SYF2	85	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	93	82.251	Ficedula_albicollis
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	94.538	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	Fukomys_damarensis
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	66.816	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.816	Fundulus_heteroclitus
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSCHIG00000020874	SYF2	93	88.000	ENSGALG00000013639	SYF2	92	86.207	Gallus_gallus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	75.000	ENSGAFG00000019435	syf2	99	75.000	Gambusia_affinis
ENSCHIG00000020874	SYF2	89	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.178	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	85.477	ENSGAGG00000010670	SYF2	97	85.892	Gopherus_agassizii
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	92.181	Gorilla_gorilla
ENSCHIG00000020874	SYF2	95	78.970	ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.970	Haplochromis_burtoni
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.653	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	84.685	ENSHGLG00000004304	-	100	77.778	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.653	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	77.178	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	Hippocampus_comes
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	79.412	ENSIPUG00000019859	syf2	99	78.750	Ictalurus_punctatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	61	97.260	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	83	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	77.178	ENSKMAG00000013856	syf2	98	78.879	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHIG00000020874	SYF2	91	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	100	77.366	Labrus_bergylta
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	85.780	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.780	Latimeria_chalumnae
ENSCHIG00000020874	SYF2	93	83.857	ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.857	Lepisosteus_oculatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	76	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.653	ENSLAFG00000023150	-	100	92.653	Loxodonta_africana
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.887	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	90.947	Macaca_fascicularis
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	90.947	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	Macaca_mulatta
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.887	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	90.947	Macaca_nemestrina
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.469	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	97	77.083	Mastacembelus_armatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	76.667	ENSMZEG00005006429	syf2	99	76.667	Maylandia_zebra
ENSCHIG00000020874	SYF2	83	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	90.947	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	Mesocricetus_auratus
ENSCHIG00000020874	SYF2	83	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.593	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.593	Microtus_ochrogaster
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	79.279	ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.279	Mola_mola
ENSCHIG00000020874	SYF2	94	87.336	ENSMODG00000013951	-	100	87.336	Monodelphis_domestica
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	77.500	ENSMALG00000010706	syf2	100	76.639	Monopterus_albus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	93.220	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	99	91.701	Mus_caroli
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	93.220	ENSMUSG00000028821	Syf2	99	91.701	Mus_musculus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	93.220	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	99	91.701	Mus_pahari
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	93.220	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	99	91.701	Mus_spretus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.902	ENSMPUG00000015802	-	100	93.902	Mustela_putorius_furo
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.776	ENSMPUG00000015801	-	98	93.776	Mustela_putorius_furo
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.437	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.500	Myotis_lucifugus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.276	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	Nannospalax_galili
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	71.008	ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.130	Neolamprologus_brichardi
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.181	Nomascus_leucogenys
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	90.535	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	Ochotona_princeps
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	82.041	ENSODEG00000014338	-	99	83.898	Octodon_degus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	93.644	ENSODEG00000017664	-	99	93.644	Octodon_degus
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	80.631	ENSONIG00000008213	syf2	99	76.667	Oreochromis_niloticus
ENSCHIG00000020874	SYF2	84	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	94.915	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.623	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	78.059	ENSORLG00000028820	syf2	100	78.059	Oryzias_latipes
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	76.543	ENSORLG00020018333	syf2	98	79.741	Oryzias_latipes_hni
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	82.569	ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	82.432	ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.432	Oryzias_melastigma
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.623	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.623	Otolemur_garnettii
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	97.166	ENSOARG00000006348	-	100	97.166	Ovis_aries
ENSCHIG00000020874	SYF2	81	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	67.179	Ovis_aries
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	92.181	Pan_paniscus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	94.606	ENSPPRG00000001638	-	98	94.606	Panthera_pardus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001651	-	100	93.089	Panthera_pardus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.089	ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	Panthera_tigris_altaica
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	98.624	ENSPTIG00000005711	-	80	98.624	Panthera_tigris_altaica
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.181	Pan_troglodytes
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.887	ENSPANG00000008139	SYF2	100	90.947	Papio_anubis
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	77.778	ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.778	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	84.454	ENSPSIG00000011816	SYF2	93	84.454	Pelodiscus_sinensis
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	81.900	ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.900	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.181	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHIG00000020874	SYF2	93	93.304	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	92.174	Phascolarctos_cinereus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	76.596	ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.586	Poecilia_formosa
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	74.390	ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.371	Poecilia_latipinna
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	74.043	ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.000	Poecilia_mexicana
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	99	75.104	Poecilia_reticulata
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.724	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	Pongo_abelii
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	61.728	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	61.317	Propithecus_coquereli
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	82.041	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.041	Pteropus_vampyrus
ENSCHIG00000020874	SYF2	92	80.631	ENSPNYG00000004979	syf2	99	76.667	Pundamilia_nyererei
ENSCHIG00000020874	SYF2	97	80.591	ENSPNAG00000015570	syf2	99	80.591	Pygocentrus_nattereri
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	93.220	ENSRNOG00000060597	Syf2	99	91.701	Rattus_norvegicus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	90.795	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.889	Rhinopithecus_bieti
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.887	ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	Rhinopithecus_roxellana
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.181	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCHIG00000020874	SYF2	94	91.189	ENSSHAG00000015630	-	92	90.435	Sarcophilus_harrisii
ENSCHIG00000020874	SYF2	85	93.204	ENSSHAG00000007152	-	100	93.204	Sarcophilus_harrisii
ENSCHIG00000020874	SYF2	93	83.036	ENSSFOG00015023647	syf2	95	83.036	Scleropages_formosus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	76.955	ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.955	Scophthalmus_maximus
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	92	83.028	Seriola_dumerili
ENSCHIG00000020874	SYF2	90	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.028	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	75.820	ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.820	Sorex_araneus
ENSCHIG00000020874	SYF2	98	83.966	ENSSPUG00000005251	SYF2	94	83.966	Sphenodon_punctatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	78.661	ENSSPAG00000009626	syf2	100	77.366	Stegastes_partitus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	96.735	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	96.735	Sus_scrofa
ENSCHIG00000020874	SYF2	62	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.857	Taeniopygia_guttata
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	74.897	ENSTRUG00000001499	syf2	89	80.180	Takifugu_rubripes
ENSCHIG00000020874	SYF2	93	78.924	ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	Tetraodon_nigroviridis
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	70.588	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.136	Tupaia_belangeri
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	97.059	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	95.902	Tursiops_truncatus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.683	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	92.683	Ursus_americanus
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.089	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.089	Ursus_maritimus
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	95.378	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	94.262	Vicugna_pacos
ENSCHIG00000020874	SYF2	85	97.561	ENSVVUG00000027181	-	96	92.827	Vulpes_vulpes
ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.496	ENSVVUG00000027175	-	100	93.496	Vulpes_vulpes
ENSCHIG00000020874	SYF2	99	81.250	ENSXETG00000022797	syf2	96	81.250	Xenopus_tropicalis
ENSCHIG00000020874	SYF2	89	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	99	74.583	Xiphophorus_maculatus