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Description

Ensembl ID: ENSCHIG00000023462 (Gene tree)
Gene ID: 102183104
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Capra_hircus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 84293 bases
Position: chr20:8747758-8832050
Accession: 102183104
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHIP00000027795	IBN_N	PF03810.19	6.4e-16	1	1
ENSCHIP00000027783	IBN_N	PF03810.19	6.6e-16	1	1
ENSCHIP00000027738	IBN_N	PF03810.19	6.9e-16	1	1
ENSCHIP00000027760	IBN_N	PF03810.19	7.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHIT00000035628	TNPO1-202	2636	-	ENSCHIP00000027760	866 (aa)	-	UPI000D18ED65
ENSCHIT00000035651	TNPO1-203	2685	-	ENSCHIP00000027783	894 (aa)	-	UPI000D18D7C1
ENSCHIT00000035663	TNPO1-204	2667	-	ENSCHIP00000027795	888 (aa)	-	UPI000D196B82
ENSCHIT00000035606	TNPO1-201	2732	XM_018065583	ENSCHIP00000027738	898 (aa)	XP_017921072	UPI000847366D

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	81.271	ENSCHIG00000011718	TNPO2	99	81.382

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.820	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	98.670	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	92.894	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	Amphilophus_citrinellus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.933	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_ocellaris
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.933	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_percula
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.483	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	Anabas_testudineus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	98	92.559	ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	Anas_platyrhynchos
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	96.966	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.966	Anolis_carolinensis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	88.307	ENSANAG00000025351	-	100	88.307	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	64.309	ENSANAG00000027118	-	99	64.199	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.220	ENSANAG00000022453	-	100	99.220	Aotus_nancymaae
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	91.573	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	Astatotilapia_calliptera
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.713	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.601	Astyanax_mexicanus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.889	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.889	Bos_taurus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	Callithrix_jacchus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	99.417	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	Canis_familiaris
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	96.629	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.629	Canis_lupus_dingo
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	95.593	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.849	Carlito_syrichta
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.220	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	Cebus_capucinus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.666	Cercocebus_atys
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.220	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	Chinchilla_lanigera
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.777	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.777	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	94	87.013	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	Choloepus_hoffmanni
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	97.531	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.531	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	75.421	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.666	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.332	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	99.298	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.298	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.247	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.034	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.034	Cyprinodon_variegatus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.368	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.031	Danio_rerio
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.527	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.527	Dasypus_novemcinctus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	92	99.639	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.638	Dipodomys_ordii
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.223	Drosophila_melanogaster
ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	Echinops_telfairi
ENSCHIG00000023462	TNPO1	94	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.666	Equus_asinus_asinus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.443	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.443	Equus_caballus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	86.383	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	Esox_lucius
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.666	Felis_catus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	97.191	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.191	Ficedula_albicollis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	Fukomys_damarensis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.378	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.378	Fundulus_heteroclitus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	89.744	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.744	Gadus_morhua
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	96.102	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.517	Gallus_gallus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.152	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.152	Gambusia_affinis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.953	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	97.303	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.303	Gopherus_agassizii
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	82.905	ENSGGOG00000022535	-	99	82.905	Gorilla_gorilla
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.666	Gorilla_gorilla
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.146	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	Haplochromis_burtoni
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.443	ENSHGLG00000000970	-	100	99.443	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	75.390	ENSHGLG00100000963	-	100	74.833	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	99.299	ENSHGLG00100017090	-	99	99.299	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.329	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	Jaculus_jaculus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.371	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.371	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	90	89.889	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.889	Labrus_bergylta
ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	88.953	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.953	Latimeria_chalumnae
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	95.078	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.078	Lepisosteus_oculatus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	96	98.845	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	Loxodonta_africana
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.666	Macaca_fascicularis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.555	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	Macaca_mulatta
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.666	Macaca_nemestrina
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.666	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.483	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	Mastacembelus_armatus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.921	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	Maylandia_zebra
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.219	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	95.521	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	Microcebus_murinus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.217	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.217	Microtus_ochrogaster
ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	92.526	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.360	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	Monopterus_albus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.443	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.109	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.555	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.555	Mustela_putorius_furo
ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	98.952	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	Myotis_lucifugus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.332	Nannospalax_galili
ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	92.765	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	Neolamprologus_brichardi
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.666	Nomascus_leucogenys
ENSCHIG00000023462	TNPO1	91	92.966	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.220	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	Octodon_degus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.222	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	Oreochromis_niloticus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	91	97.683	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	93.107	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	92.737	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	Oryzias_latipes
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.010	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hni
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.123	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.785	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.785	Oryzias_melastigma
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.777	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.777	Otolemur_garnettii
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.889	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.889	Ovis_aries
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.666	Pan_paniscus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.666	Panthera_pardus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.666	Panthera_tigris_altaica
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.666	Pan_troglodytes
ENSCHIG00000023462	TNPO1	93	86.602	ENSPTRG00000047731	-	100	86.602	Pan_troglodytes
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.666	Papio_anubis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	90.337	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.337	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	96.771	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.771	Pelodiscus_sinensis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	90.460	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	99.298	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.298	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	98.315	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	Phascolarctos_cinereus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.945	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.945	Poecilia_formosa
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.945	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.945	Poecilia_latipinna
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.146	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.146	Poecilia_mexicana
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ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.555	ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	Propithecus_coquereli
ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.332	Pteropus_vampyrus
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.929	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.929	Pundamilia_nyererei
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.161	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.825	Pygocentrus_nattereri
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ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.820	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	93.820	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.663	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	99.663	Ursus_maritimus
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ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.663	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	99.663	Vulpes_vulpes
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	94.382	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	Xenopus_tropicalis
ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.817	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.817	Xiphophorus_maculatus