EuRBPDB

Description

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCHOG00000001746 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Choloepus_hoffmanni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 48233 bases
Position: chrGeneScaffold_925:10518-58750
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHOP00000001550	IBN_N	PF03810.19	4.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHOT00000001758	TNPO1-201	2520	-	ENSCHOP00000001550	840 (aa)	-	UPI0001F9E636

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSG00000083312	TNPO1	87	100.000	Homo_sapiens
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.122	ENSAPOG00000003453	tnpo1	94	82.122	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	85.194	ENSAMEG00000007147	TNPO1	94	86.134	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	83.787	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	83.658	Amphilophus_citrinellus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.241	ENSAOCG00000008154	tnpo1	94	82.241	Amphiprion_ocellaris
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.241	ENSAPEG00000001112	tnpo1	94	82.241	Amphiprion_percula
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.883	ENSATEG00000010408	tnpo1	94	81.883	Anabas_testudineus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	98	79.785	ENSAPLG00000009619	-	91	80.586	Anas_platyrhynchos
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	84.625	ENSACAG00000009599	TNPO1	94	84.625	Anolis_carolinensis
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.659	ENSANAG00000022453	-	94	86.659	Aotus_nancymaae
ENSCHOG00000001746	TNPO1	98	55.662	ENSANAG00000027118	-	94	55.357	Aotus_nancymaae
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	76.359	ENSANAG00000025351	-	94	76.359	Aotus_nancymaae
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.357	ENSACLG00000027223	tnpo1	94	80.238	Astatotilapia_calliptera
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.094	ENSAMXG00000009842	tnpo1	94	80.618	Astyanax_mexicanus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSBTAG00000007979	TNPO1	94	87.131	Bos_taurus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	ENSCJAG00000016409	TNPO1	94	86.777	Callithrix_jacchus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	86.228	ENSCAFG00000008081	TNPO1	94	86.228	Canis_familiaris
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	83.790	ENSCAFG00020017397	TNPO1	81	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	ENSCHIG00000023462	TNPO1	94	87.013	Capra_hircus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.948	ENSTSYG00000001871	TNPO1	91	84.826	Carlito_syrichta
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.659	ENSCCAG00000026472	TNPO1	94	86.659	Cebus_capucinus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSCATG00000043792	TNPO1	99	86.504	Cercocebus_atys
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.659	ENSCLAG00000016191	TNPO1	94	86.659	Chinchilla_lanigera
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.249	ENSCSAG00000015616	TNPO1	94	87.249	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	84.970	ENSCPBG00000000260	TNPO1	89	85.238	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	66.548	ENSCSAVG00000010981	-	99	63.569	Ciona_savignyi
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSCANG00000004353	TNPO1	94	87.131	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	94	86.777	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	86.070	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	94	86.070	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.691	ENSCSEG00000012674	tnpo1	94	80.691	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.764	ENSCVAG00000001010	tnpo1	94	81.764	Cyprinodon_variegatus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.833	ENSDARG00000035390	tnpo1	94	80.714	Danio_rerio
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.828	ENSDNOG00000006647	TNPO1	94	80.828	Dasypus_novemcinctus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	92	86.008	ENSDORG00000006476	Tnpo1	94	85.990	Dipodomys_ordii
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	50.299	FBgn0035693	CG8219	94	49.820	Drosophila_melanogaster
ENSCHOG00000001746	TNPO1	79	98.305	ENSETEG00000017805	TNPO1	78	98.305	Echinops_telfairi
ENSCHOG00000001746	TNPO1	93	74.018	ENSEBUG00000001895	tnpo1	94	73.638	Eptatretus_burgeri
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSEASG00005018055	TNPO1	94	87.131	Equus_asinus_asinus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.895	ENSECAG00000024424	TNPO1	94	86.895	Equus_caballus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	76.852	ENSELUG00000002821	tnpo1	94	76.416	Esox_lucius
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSFCAG00000013181	TNPO1	94	87.131	Felis_catus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	84.863	ENSFALG00000010292	TNPO1	94	84.863	Ficedula_albicollis
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	ENSFDAG00000013345	TNPO1	94	86.777	Fukomys_damarensis
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.190	ENSFHEG00000019234	tnpo1	94	81.190	Fundulus_heteroclitus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	78.605	ENSGMOG00000000347	tnpo1	94	78.605	Gadus_morhua
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	83.943	ENSGALG00000015014	TNPO1	97	83.943	Gallus_gallus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.499	ENSGAFG00000000943	tnpo1	94	80.975	Gambusia_affinis
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.257	ENSGACG00000015841	tnpo1	94	81.257	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	85.101	ENSGAGG00000013419	TNPO1	94	85.101	Gopherus_agassizii
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSGGOG00000026800	TNPO1	94	87.131	Gorilla_gorilla
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	71.700	ENSGGOG00000022535	-	93	71.700	Gorilla_gorilla
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.526	ENSHBUG00000008068	tnpo1	94	81.526	Haplochromis_burtoni
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.423	ENSHGLG00000000970	-	94	86.423	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	65.366	ENSHGLG00100000963	-	94	64.775	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	85.590	ENSHGLG00100017090	-	94	85.590	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	86.714	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	92	86.714	Jaculus_jaculus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.002	ENSKMAG00000018195	tnpo1	94	82.002	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	83.808	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	83.290	Labrus_bergylta
ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	79.529	ENSLACG00000012199	TNPO1	94	79.529	Latimeria_chalumnae
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	83.630	ENSLOCG00000011092	tnpo1	92	83.630	Lepisosteus_oculatus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	96	85.890	ENSLAFG00000011796	TNPO1	94	85.890	Loxodonta_africana
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSMFAG00000003636	TNPO1	94	87.131	Macaca_fascicularis
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	ENSMMUG00000020923	TNPO1	86	97.436	Macaca_mulatta
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSMNEG00000044581	TNPO1	94	87.131	Macaca_nemestrina
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSMLEG00000030740	TNPO1	94	87.131	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.002	ENSMAMG00000001357	tnpo1	94	81.883	Mastacembelus_armatus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.406	ENSMZEG00005004913	tnpo1	94	81.287	Maylandia_zebra
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	86.627	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	94	86.627	Mesocricetus_auratus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.660	ENSMICG00000008468	TNPO1	94	82.660	Microcebus_murinus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	86.595	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	94	86.595	Microtus_ochrogaster
ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	82.794	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	83.053	Mola_mola
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.339	ENSMODG00000001721	TNPO1	76	81.862	Monodelphis_domestica
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.810	ENSMALG00000009782	tnpo1	94	80.691	Monopterus_albus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.541	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	85.998	Mus_caroli
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	86.245	Mus_musculus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.659	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	86.121	Mus_pahari
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.541	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	85.998	Mus_spretus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	ENSMPUG00000014387	TNPO1	94	87.013	Mustela_putorius_furo
ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	85.891	ENSMLUG00000016317	TNPO1	94	85.891	Myotis_lucifugus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	94	86.777	Nannospalax_galili
ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	83.528	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	83.528	Neolamprologus_brichardi
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSNLEG00000004572	TNPO1	94	87.131	Nomascus_leucogenys
ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	81.651	ENSOPRG00000012390	TNPO1	85	81.651	Ochotona_princeps
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.423	ENSODEG00000001771	TNPO1	94	86.423	Octodon_degus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.801	ENSONIG00000011151	tnpo1	94	80.683	Oreochromis_niloticus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	84.950	ENSOANG00000015785	TNPO1	98	84.950	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	79.255	ENSOCUG00000013318	TNPO1	94	78.634	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	83.724	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	83.724	Oryzias_latipes
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.579	ENSORLG00020011559	tnpo1	94	81.579	Oryzias_latipes_hni
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.699	ENSORLG00015019113	tnpo1	94	81.699	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.699	ENSOMEG00000014567	tnpo1	94	81.699	Oryzias_melastigma
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.249	ENSOGAG00000000808	TNPO1	94	87.249	Otolemur_garnettii
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSOARG00000005038	TNPO1	80	87.131	Ovis_aries
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSPPAG00000042518	TNPO1	94	87.131	Pan_paniscus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSPPRG00000022336	TNPO1	94	87.131	Panthera_pardus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSPTIG00000018839	TNPO1	94	87.131	Panthera_tigris_altaica
ENSCHOG00000001746	TNPO1	89	82.759	ENSPTRG00000047731	-	93	82.759	Pan_troglodytes
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSPTRG00000016972	TNPO1	94	87.131	Pan_troglodytes
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSPANG00000006074	TNPO1	94	87.131	Papio_anubis
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	77.830	ENSPKIG00000019795	tnpo1	94	77.830	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	84.534	ENSPSIG00000014366	TNPO1	94	84.534	Pelodiscus_sinensis
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	78.929	ENSPMGG00000017014	tnpo1	94	79.048	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	86.070	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	94	86.070	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	85.697	ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	85.542	Phascolarctos_cinereus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.116	ENSPFOG00000011447	tnpo1	94	81.354	Poecilia_formosa
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.116	ENSPLAG00000018696	tnpo1	94	81.354	Poecilia_latipinna
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.883	ENSPMEG00000024121	tnpo1	94	81.883	Poecilia_mexicana
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.737	ENSPREG00000020705	tnpo1	94	81.213	Poecilia_reticulata
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	ENSPPYG00000015545	TNPO1	94	87.013	Pongo_abelii
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	ENSPCOG00000004254	TNPO1	94	87.013	Propithecus_coquereli
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	ENSPVAG00000013051	TNPO1	94	87.013	Pteropus_vampyrus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.833	ENSPNYG00000001522	tnpo1	94	80.833	Pundamilia_nyererei
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.116	ENSPNAG00000021484	tnpo1	94	80.737	Pygocentrus_nattereri
ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	86.412	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	94	86.412	Rattus_norvegicus
ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	ENSRBIG00000021642	TNPO1	94	87.131	Rhinopithecus_bieti
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