EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCHOG00000010031 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Choloepus_hoffmanni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28088 bases
Position: chrGeneScaffold_1827:319-28406
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHOP00000008897	GTP_EFTU	PF00009.27	3.2e-39	1	1
ENSCHOP00000008897	EFG_IV	PF03764.18	6.7e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHOT00000010071	EFTUD2-201	2691	-	ENSCHOP00000008897	897 (aa)	-	UPI0001FA01DA

Gene Model

Click here to download ENSCHOG00000010031's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCHOG00000010031's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	66	42.373	ENSCHOG00000005308	EEF2	71	42.373

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSG00000108883	EFTUD2	90	100.000	Homo_sapiens
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.194	ENSAPOG00000002433	eftud2	91	81.194	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	91	86.824	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	79.279	ENSACIG00000009096	eftud2	91	79.279	Amphilophus_citrinellus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	89	76.654	ENSAOCG00000023385	eftud2	94	76.654	Amphiprion_ocellaris
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.306	ENSAPEG00000003321	eftud2	91	81.306	Amphiprion_percula
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.532	ENSATEG00000000457	eftud2	91	81.532	Anabas_testudineus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.573	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	92	81.573	Anas_platyrhynchos
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	98	85.311	ENSACAG00000007637	EFTUD2	91	85.248	Anolis_carolinensis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSANAG00000025320	EFTUD2	91	86.824	Aotus_nancymaae
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.081	ENSACLG00000001296	eftud2	91	81.081	Astatotilapia_calliptera
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.623	ENSAMXG00000000568	eftud2	91	81.644	Astyanax_mexicanus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	91	86.824	Bos_taurus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	100	60.177	WBGene00001166	eftu-2	91	60.879	Caenorhabditis_elegans
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	91	86.824	Callithrix_jacchus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	91	86.824	Canis_familiaris
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	91	86.824	Canis_lupus_dingo
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	91	86.824	Capra_hircus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.486	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	91	86.486	Carlito_syrichta
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.261	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	91	86.261	Cavia_aperea
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.261	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	91	86.261	Cavia_porcellus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	91	86.824	Cebus_capucinus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCATG00000035809	EFTUD2	91	86.824	Cercocebus_atys
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.261	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	91	86.261	Chinchilla_lanigera
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	91	86.824	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.923	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	91	85.923	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	68.462	ENSCING00000009372	-	92	68.462	Ciona_intestinalis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	69.248	ENSCSAVG00000004985	-	95	69.900	Ciona_savignyi
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCANG00000026557	EFTUD2	91	86.824	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCGRG00001009904	Eftud2	91	86.824	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSCGRG00000003825	Eftud2	91	86.824	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.631	ENSCSEG00000016775	eftud2	91	80.631	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.419	ENSCVAG00000012537	eftud2	91	81.419	Cyprinodon_variegatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.722	ENSDARG00000012261	eftud2	92	81.876	Danio_rerio
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.149	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	91	86.149	Dasypus_novemcinctus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.599	ENSDORG00000011566	Eftud2	91	86.599	Dipodomys_ordii
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	65.781	FBgn0039566	CG4849	91	66.591	Drosophila_melanogaster
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	90	99.346	ENSETEG00000005678	EFTUD2	83	99.346	Echinops_telfairi
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	73	96.133	ENSEBUG00000004047	-	77	96.133	Eptatretus_burgeri
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSEASG00005010321	EFTUD2	91	86.824	Equus_asinus_asinus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSECAG00000019363	EFTUD2	85	86.824	Equus_caballus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	77	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	79	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.405	ENSELUG00000017169	eftud2	92	80.405	Esox_lucius
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	91	86.824	Felis_catus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.586	ENSFALG00000007551	EFTUD2	91	85.586	Ficedula_albicollis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	91	86.712	Fukomys_damarensis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	90	98.101	ENSFHEG00000013479	eftud2	84	98.101	Fundulus_heteroclitus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.743	ENSGMOG00000014277	eftud2	91	80.743	Gadus_morhua
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.698	ENSGALG00000000988	EFTUD2	96	85.698	Gallus_gallus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.306	ENSGAFG00000002263	eftud2	91	81.306	Gambusia_affinis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.518	ENSGACG00000009163	eftud2	91	80.518	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	91	86.824	Gorilla_gorilla
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.081	ENSHBUG00000023546	eftud2	93	81.081	Haplochromis_burtoni
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.486	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	91	86.486	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.486	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	91	86.486	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.631	ENSHCOG00000017689	eftud2	91	80.631	Hippocampus_comes
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.194	ENSIPUG00000023182	Eftud2	91	81.194	Ictalurus_punctatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	86.114	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	95	85.092	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSJJAG00000018268	Eftud2	95	86.824	Jaculus_jaculus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.856	ENSKMAG00000021027	eftud2	91	80.856	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	97	80.549	ENSLBEG00000005875	eftud2	94	81.398	Labrus_bergylta
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	83.108	ENSLACG00000012918	EFTUD2	91	83.108	Latimeria_chalumnae
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.869	ENSLOCG00000011460	eftud2	92	81.869	Lepisosteus_oculatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	91	86.712	Loxodonta_africana
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	91	86.824	Macaca_fascicularis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	90	100.000	Macaca_mulatta
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	91	86.824	Macaca_nemestrina
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	91	86.824	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.419	ENSMAMG00000022190	eftud2	92	81.419	Mastacembelus_armatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.081	ENSMZEG00005022885	eftud2	91	81.081	Maylandia_zebra
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.618	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	91	85.618	Meleagris_gallopavo
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	ENSMAUG00000021178	Eftud2	91	86.712	Mesocricetus_auratus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSMICG00000016592	EFTUD2	91	86.824	Microcebus_murinus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSMOCG00000009039	-	91	86.824	Microtus_ochrogaster
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	93	70.729	ENSMOCG00000017653	-	84	70.729	Microtus_ochrogaster
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	89	82.772	ENSMMOG00000020811	eftud2	94	82.772	Mola_mola
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.599	ENSMODG00000011347	EFTUD2	91	86.599	Monodelphis_domestica
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	89	81.898	ENSMALG00000014501	eftud2	94	81.898	Monopterus_albus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	91	86.712	Mus_caroli
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	ENSMUSG00000020929	Eftud2	91	86.712	Mus_musculus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	91	86.712	Mus_pahari
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	91	86.712	Mus_spretus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	85	86.824	Mustela_putorius_furo
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	91	86.824	Myotis_lucifugus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSNGAG00000017834	Eftud2	91	86.824	Nannospalax_galili
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.968	ENSNBRG00000020081	eftud2	91	80.968	Neolamprologus_brichardi
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.327	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	91	85.327	Nomascus_leucogenys
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	86.033	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	88	86.033	Notamacropus_eugenii
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	77.703	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	91	77.703	Ochotona_princeps
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.261	ENSODEG00000018041	-	91	86.261	Octodon_degus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	91	70.075	ENSODEG00000003385	-	90	70.075	Octodon_degus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.081	ENSONIG00000000912	eftud2	91	81.081	Oreochromis_niloticus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	91	86.824	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.856	ENSORLG00000003109	eftud2	91	80.856	Oryzias_latipes
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.856	ENSORLG00020009865	eftud2	91	80.856	Oryzias_latipes_hni
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.856	ENSORLG00015002611	eftud2	97	80.834	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	84.459	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	91	84.459	Otolemur_garnettii
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSOARG00000009078	EFTUD2	89	86.824	Ovis_aries
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	91	86.824	Pan_paniscus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	91	86.824	Panthera_pardus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	91	86.824	Panthera_tigris_altaica
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	91	86.824	Pan_troglodytes
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSPANG00000021284	EFTUD2	91	86.824	Papio_anubis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	83.958	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	94	83.958	Pelodiscus_sinensis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	93	96.685	ENSPMGG00000007281	eftud2	85	96.685	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSPEMG00000005129	Eftud2	91	86.824	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.599	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	91	86.599	Phascolarctos_cinereus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.306	ENSPFOG00000008515	eftud2	91	81.306	Poecilia_formosa
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.306	ENSPLAG00000010393	eftud2	91	81.306	Poecilia_latipinna
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.306	ENSPMEG00000005087	eftud2	91	81.306	Poecilia_mexicana
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	87.275	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	91	87.275	Pongo_abelii
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	86.150	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	88	86.150	Procavia_capensis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	91	86.712	Propithecus_coquereli
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.644	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	91	81.644	Pteropus_vampyrus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.968	ENSPNYG00000012448	eftud2	91	80.968	Pundamilia_nyererei
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.419	ENSPNAG00000012490	eftud2	91	81.419	Pygocentrus_nattereri
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	ENSRNOG00000002818	Eftud2	91	86.712	Rattus_norvegicus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	91	86.712	Rhinopithecus_bieti
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	ENSRROG00000042925	EFTUD2	91	86.712	Rhinopithecus_roxellana
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	84	44.526	YKL173W	SNU114	83	38.798	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	91	86.824	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.599	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	95	86.599	Sarcophilus_harrisii
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.194	ENSSFOG00015023272	eftud2	92	81.194	Scleropages_formosus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.631	ENSSMAG00000010174	eftud2	92	81.081	Scophthalmus_maximus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.194	ENSSDUG00000022675	eftud2	91	81.194	Seriola_dumerili
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.306	ENSSLDG00000001595	eftud2	91	81.306	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	77.590	ENSSARG00000008664	EFTUD2	91	77.590	Sorex_araneus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	84.910	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	91	84.910	Sphenodon_punctatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.194	ENSSPAG00000016235	eftud2	91	81.194	Stegastes_partitus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	91	86.824	Sus_scrofa
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	89	83.811	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	83.811	Taeniopygia_guttata
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.068	ENSTRUG00000016422	eftud2	91	80.068	Takifugu_rubripes
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	93	97.238	ENSTNIG00000005346	eftud2	86	97.238	Tetraodon_nigroviridis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.631	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	91	80.631	Tupaia_belangeri
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	82.706	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	82.706	Tursiops_truncatus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.811	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	91	85.811	Ursus_americanus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	91	86.824	Ursus_maritimus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	86	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	79	100.000	Vicugna_pacos
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	91	86.824	Vulpes_vulpes
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	100	82.301	ENSXETG00000003394	eftud2	95	82.883	Xenopus_tropicalis
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	85	82.115	ENSXCOG00000017309	eftud2	94	82.115	Xiphophorus_couchianus
ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.306	ENSXMAG00000008494	eftud2	91	81.306	Xiphophorus_maculatus