EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCHOG00000011591 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Choloepus_hoffmanni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21248 bases
Position: chrGeneScaffold_1128:314-21561
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHOP00000010258	PAZ	PF02170.22	9.1e-29	1	1
ENSCHOP00000010258	Piwi	PF02171.17	3.1e-47	1	2
ENSCHOP00000010258	Piwi	PF02171.17	3.1e-47	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHOT00000011637	AGO1-201	2538	-	ENSCHOP00000010258	845 (aa)	-	UPI0001FA0571

Gene Model

Click here to download ENSCHOG00000011591's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCHOG00000011591's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCHOG00000011591	AGO1	57	93.137	ENSCHOG00000008938	-	58	93.137
ENSCHOG00000011591	AGO1	74	91.429	ENSCHOG00000011621	AGO3	74	91.429
ENSCHOG00000011591	AGO1	61	89.157	ENSCHOG00000006867	AGO4	61	89.157

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSG00000092847	AGO1	85	94.574	Homo_sapiens
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSAPOG00000024299	ago1	85	91.473	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSAMEG00000000504	AGO1	85	94.574	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHOG00000011591	AGO1	67	90.909	ENSACIG00000005298	ago1	83	90.909	Amphilophus_citrinellus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSAOCG00000017727	ago1	85	91.473	Amphiprion_ocellaris
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSAPEG00000004458	ago1	86	91.473	Amphiprion_percula
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSATEG00000008523	ago1	85	91.473	Anabas_testudineus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSAPLG00000010440	AGO1	84	94.574	Anas_platyrhynchos
ENSCHOG00000011591	AGO1	78	94.574	ENSACAG00000029174	AGO1	85	94.574	Anolis_carolinensis
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSANAG00000037711	AGO1	85	94.574	Aotus_nancymaae
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSACLG00000000890	ago1	85	91.473	Astatotilapia_calliptera
ENSCHOG00000011591	AGO1	67	91.473	ENSAMXG00000001917	ago1	81	91.473	Astyanax_mexicanus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSBTAG00000012253	AGO1	85	94.574	Bos_taurus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCJAG00000032023	AGO1	85	94.574	Callithrix_jacchus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCAFG00000003443	AGO1	85	94.574	Canis_familiaris
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCAFG00020009251	AGO1	86	94.574	Canis_lupus_dingo
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCHIG00000011848	-	85	94.574	Capra_hircus
ENSCHOG00000011591	AGO1	85	72.093	ENSTSYG00000032426	-	84	72.093	Carlito_syrichta
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSTSYG00000009767	-	86	94.574	Carlito_syrichta
ENSCHOG00000011591	AGO1	74	97.170	ENSCAPG00000010228	AGO1	81	97.170	Cavia_aperea
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCPOG00000011568	AGO1	85	94.574	Cavia_porcellus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCCAG00000011823	AGO1	85	94.574	Cebus_capucinus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCATG00000031521	AGO1	86	94.574	Cercocebus_atys
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCLAG00000011507	AGO1	86	94.574	Chinchilla_lanigera
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCSAG00000001091	AGO1	85	94.574	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCPBG00000018594	AGO1	85	94.574	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCANG00000039798	AGO1	85	94.574	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCGRG00001022708	Ago1	85	94.574	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSCGRG00000010386	Ago1	86	94.574	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSCSEG00000001051	ago1	86	91.473	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSCVAG00000018173	ago1	85	91.473	Cyprinodon_variegatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	90.698	ENSDARG00000092644	ago1	85	90.698	Danio_rerio
ENSCHOG00000011591	AGO1	78	94.574	ENSDNOG00000008077	AGO1	85	94.574	Dasypus_novemcinctus
ENSCHOG00000011591	AGO1	83	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	91	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCHOG00000011591	AGO1	71	98.339	ENSETEG00000007626	AGO1	83	98.339	Echinops_telfairi
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSEASG00005012086	AGO1	85	94.574	Equus_asinus_asinus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSECAG00000024353	AGO1	85	94.574	Equus_caballus
ENSCHOG00000011591	AGO1	79	94.574	ENSEEUG00000005349	AGO1	78	94.574	Erinaceus_europaeus
ENSCHOG00000011591	AGO1	78	91.473	ENSELUG00000016803	ago1	85	91.473	Esox_lucius
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSFCAG00000000746	AGO1	87	93.636	Felis_catus
ENSCHOG00000011591	AGO1	78	94.574	ENSFALG00000000790	AGO1	85	94.574	Ficedula_albicollis
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSFDAG00000017210	AGO1	85	94.574	Fukomys_damarensis
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSFHEG00000017927	ago1	86	91.473	Fundulus_heteroclitus
ENSCHOG00000011591	AGO1	63	92.553	ENSGMOG00000019413	ago1	71	92.553	Gadus_morhua
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSGALG00000002249	AGO1	85	94.574	Gallus_gallus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSGAFG00000009775	ago1	85	91.473	Gambusia_affinis
ENSCHOG00000011591	AGO1	74	91.473	ENSGACG00000012443	ago1	84	91.473	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	78	94.574	ENSGAGG00000012893	-	85	94.574	Gopherus_agassizii
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSGGOG00000003316	AGO1	85	94.574	Gorilla_gorilla
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSHBUG00000010459	ago1	85	91.473	Haplochromis_burtoni
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSHGLG00000011540	AGO1	85	94.574	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSHGLG00100005568	AGO1	85	94.574	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSHCOG00000005708	ago1	86	91.473	Hippocampus_comes
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSIPUG00000023216	ago1	83	96.154	Ictalurus_punctatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSSTOG00000010857	AGO1	85	94.574	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSJJAG00000019449	Ago1	85	94.574	Jaculus_jaculus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSKMAG00000019464	ago1	85	91.473	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSLBEG00000007694	ago1	81	96.154	Labrus_bergylta
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSLACG00000017009	AGO1	86	94.574	Latimeria_chalumnae
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	88.372	ENSLOCG00000000504	AGO1	85	88.372	Lepisosteus_oculatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSLAFG00000010835	AGO1	86	94.574	Loxodonta_africana
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSMFAG00000002846	AGO1	86	94.574	Macaca_fascicularis
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSMMUG00000006251	AGO1	87	94.574	Macaca_mulatta
ENSCHOG00000011591	AGO1	85	94.574	ENSMNEG00000028881	AGO1	86	94.574	Macaca_nemestrina
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSMLEG00000038388	AGO1	86	94.574	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSMAMG00000008381	ago1	85	91.473	Mastacembelus_armatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSMZEG00005007996	ago1	85	91.473	Maylandia_zebra
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	93.130	ENSMGAG00000003822	AGO1	86	93.130	Meleagris_gallopavo
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSMAUG00000015189	Ago1	85	94.574	Mesocricetus_auratus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSMICG00000016147	AGO1	85	94.574	Microcebus_murinus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSMOCG00000000537	Ago1	85	94.574	Microtus_ochrogaster
ENSCHOG00000011591	AGO1	65	91.743	ENSMMOG00000018459	ago1	77	91.743	Mola_mola
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSMODG00000023335	AGO1	85	94.574	Monodelphis_domestica
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSMALG00000011057	ago1	86	91.473	Monopterus_albus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	85	94.574	Mus_caroli
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSMUSG00000041530	Ago1	85	94.574	Mus_musculus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	85	94.574	Mus_pahari
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	85	94.574	Mus_spretus
ENSCHOG00000011591	AGO1	71	94.574	ENSMPUG00000014872	AGO1	84	94.574	Mustela_putorius_furo
ENSCHOG00000011591	AGO1	62	90.787	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	90.787	Myotis_lucifugus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSNGAG00000017448	Ago1	85	94.574	Nannospalax_galili
ENSCHOG00000011591	AGO1	78	91.473	ENSNBRG00000010867	ago1	85	91.473	Neolamprologus_brichardi
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSNLEG00000011181	AGO1	85	94.574	Nomascus_leucogenys
ENSCHOG00000011591	AGO1	64	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	69	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCHOG00000011591	AGO1	73	95.181	ENSOPRG00000012325	AGO1	73	95.181	Ochotona_princeps
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSODEG00000005321	AGO1	85	94.574	Octodon_degus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSONIG00000016345	ago1	86	91.473	Oreochromis_niloticus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSOANG00000002080	AGO1	85	94.574	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSOCUG00000023116	AGO1	85	94.574	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSORLG00000014965	ago1	85	91.473	Oryzias_latipes
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSORLG00020018253	ago1	85	91.473	Oryzias_latipes_hni
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSORLG00015003287	ago1	85	91.473	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSOMEG00000020528	ago1	85	91.473	Oryzias_melastigma
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSOGAG00000010279	AGO1	85	94.574	Otolemur_garnettii
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSOARG00000019591	AGO1	85	94.574	Ovis_aries
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPPAG00000034838	AGO1	85	94.574	Pan_paniscus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPPRG00000006475	AGO1	85	94.574	Panthera_pardus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPTIG00000020991	AGO1	85	94.574	Panthera_tigris_altaica
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPTRG00000000528	AGO1	85	94.574	Pan_troglodytes
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPANG00000009060	AGO1	86	94.574	Papio_anubis
ENSCHOG00000011591	AGO1	85	93.130	ENSPSIG00000017482	AGO1	87	93.130	Pelodiscus_sinensis
ENSCHOG00000011591	AGO1	67	90.698	ENSPMGG00000024099	ago1	82	90.698	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPEMG00000023313	Ago1	85	94.574	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPCIG00000000172	AGO1	85	94.574	Phascolarctos_cinereus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSPFOG00000005867	ago1	85	91.473	Poecilia_formosa
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSPLAG00000002824	ago1	85	91.473	Poecilia_latipinna
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSPMEG00000001787	ago1	85	91.473	Poecilia_mexicana
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSPREG00000006534	ago1	85	91.473	Poecilia_reticulata
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPPYG00000001551	AGO1	85	94.574	Pongo_abelii
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPCOG00000022061	AGO1	85	94.574	Propithecus_coquereli
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSPVAG00000005082	AGO1	85	94.574	Pteropus_vampyrus
ENSCHOG00000011591	AGO1	68	96.552	ENSPNYG00000012586	ago1	77	96.552	Pundamilia_nyererei
ENSCHOG00000011591	AGO1	80	91.398	ENSPNAG00000000597	ago1	85	91.398	Pygocentrus_nattereri
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSRNOG00000055915	Ago1	85	94.574	Rattus_norvegicus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSRBIG00000032611	AGO1	85	94.574	Rhinopithecus_bieti
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSRROG00000044469	AGO1	85	94.574	Rhinopithecus_roxellana
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSSBOG00000020867	AGO1	85	94.574	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSSHAG00000017468	AGO1	86	94.574	Sarcophilus_harrisii
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSSFOG00015020982	ago1	85	91.473	Scleropages_formosus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSSMAG00000002841	ago1	85	91.473	Scophthalmus_maximus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSSDUG00000010864	ago1	85	91.473	Seriola_dumerili
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSSLDG00000000386	ago1	85	91.473	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCHOG00000011591	AGO1	61	100.000	ENSSARG00000011520	AGO1	60	100.000	Sorex_araneus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSSPUG00000000836	AGO1	86	94.574	Sphenodon_punctatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSSPAG00000019154	ago1	85	91.473	Stegastes_partitus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSTRUG00000024431	ago1	86	91.473	Takifugu_rubripes
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSTNIG00000012102	ago1	85	91.473	Tetraodon_nigroviridis
ENSCHOG00000011591	AGO1	71	90.780	ENSTBEG00000016514	AGO1	84	90.780	Tupaia_belangeri
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSTTRG00000015088	AGO1	85	94.574	Tursiops_truncatus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSUAMG00000027154	AGO1	85	94.574	Ursus_americanus
ENSCHOG00000011591	AGO1	83	100.000	ENSUMAG00000002480	AGO1	84	100.000	Ursus_maritimus
ENSCHOG00000011591	AGO1	82	92.473	ENSVPAG00000006663	AGO1	85	92.473	Vicugna_pacos
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSVVUG00000000405	AGO1	83	100.000	Vulpes_vulpes
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	ENSXETG00000004364	ago1	85	94.574	Xenopus_tropicalis
ENSCHOG00000011591	AGO1	78	91.473	ENSXCOG00000007669	ago1	85	91.473	Xiphophorus_couchianus
ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	ENSXMAG00000021899	ago1	85	91.473	Xiphophorus_maculatus