EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCHOG00000012088 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Choloepus_hoffmanni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 31011 bases
Position: chrGeneScaffold_917:1246-32256
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHOP00000010701	CRM1_C	PF08767.11	1.3e-55	1	2
ENSCHOP00000010701	CRM1_C	PF08767.11	1.3e-55	2	2
ENSCHOP00000010701	Xpo1	PF08389.12	2.4e-41	1	1
ENSCHOP00000010701	IBN_N	PF03810.19	1.4e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHOT00000012137	XPO1-201	3216	-	ENSCHOP00000010701	1071 (aa)	-	UPI0001FA0C66

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.406	ENSAPOG00000004984	-	83	97.406	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	91.719	ENSAPOG00000002354	xpo1a	80	91.719	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.870	ENSAMEG00000003460	XPO1	83	99.870	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	98.281	ENSACIG00000010818	-	80	98.281	Amphilophus_citrinellus
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	95.000	ENSACIG00000010259	xpo1a	80	95.000	Amphilophus_citrinellus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.774	ENSAOCG00000018914	xpo1a	83	93.774	Amphiprion_ocellaris
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.406	ENSAOCG00000010121	-	83	97.406	Amphiprion_ocellaris
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.406	ENSAPEG00000007038	-	83	97.406	Amphiprion_percula
ENSCHOG00000012088	XPO1	73	94.784	ENSAPEG00000006583	xpo1a	81	94.784	Amphiprion_percula
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.406	ENSATEG00000008816	-	83	97.406	Anabas_testudineus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.126	ENSATEG00000020750	xpo1a	83	93.126	Anabas_testudineus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.741	ENSAPLG00000004008	XPO1	83	99.741	Anas_platyrhynchos
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSACAG00000002501	XPO1	83	99.481	Anolis_carolinensis
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSANAG00000020802	XPO1	83	99.481	Aotus_nancymaae
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	95.156	ENSACLG00000015669	xpo1a	80	95.156	Astatotilapia_calliptera
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.276	ENSACLG00000015192	-	83	97.276	Astatotilapia_calliptera
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.536	ENSAMXG00000012704	xpo1b	83	97.536	Astyanax_mexicanus
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	95.031	ENSAMXG00000003069	xpo1a	80	95.031	Astyanax_mexicanus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSBTAG00000013254	XPO1	83	100.000	Bos_taurus
ENSCHOG00000012088	XPO1	82	53.777	WBGene00002078	xpo-1	83	53.777	Caenorhabditis_elegans
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSCJAG00000008877	XPO1	83	99.481	Callithrix_jacchus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSCAFG00000003050	XPO1	83	100.000	Canis_familiaris
ENSCHOG00000012088	XPO1	76	99.856	ENSCAFG00020026910	XPO1	81	99.856	Canis_lupus_dingo
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSCHIG00000018132	XPO1	83	100.000	Capra_hircus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSTSYG00000004330	XPO1	83	100.000	Carlito_syrichta
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.925	ENSCPOG00000034053	XPO1	83	97.925	Cavia_porcellus
ENSCHOG00000012088	XPO1	75	90.323	ENSCCAG00000037445	XPO1	76	90.323	Cebus_capucinus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	96.899	ENSCATG00000032674	XPO1	83	96.899	Cercocebus_atys
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.611	ENSCLAG00000012953	XPO1	83	99.611	Chinchilla_lanigera
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSCSAG00000014606	XPO1	83	99.481	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.741	ENSCPBG00000026239	XPO1	83	99.741	Chrysemys_picta_bellii
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	82.300	ENSCING00000024562	-	83	82.300	Ciona_intestinalis
ENSCHOG00000012088	XPO1	81	81.226	ENSCSAVG00000005965	-	82	81.226	Ciona_savignyi
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	94.828	ENSCANG00000028883	XPO1	82	94.828	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.314	ENSCGRG00001000263	Xpo1	83	98.314	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.314	ENSCGRG00000001520	Xpo1	83	98.314	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	97.656	ENSCSEG00000001693	XPO1	81	97.656	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	92.348	ENSCVAG00000016558	xpo1a	83	92.348	Cyprinodon_variegatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.147	ENSCVAG00000016788	-	83	97.147	Cyprinodon_variegatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.665	ENSDARG00000063229	xpo1b	83	97.665	Danio_rerio
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	95.460	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.511	Danio_rerio
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.870	ENSDNOG00000005805	XPO1	83	99.870	Dasypus_novemcinctus
ENSCHOG00000012088	XPO1	69	100.000	ENSDORG00000013050	Xpo1	81	99.595	Dipodomys_ordii
ENSCHOG00000012088	XPO1	82	72.193	FBgn0020497	emb	82	72.193	Drosophila_melanogaster
ENSCHOG00000012088	XPO1	77	98.708	ENSETEG00000018045	XPO1	77	98.708	Echinops_telfairi
ENSCHOG00000012088	XPO1	73	84.483	ENSEBUG00000012580	-	76	89.263	Eptatretus_burgeri
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSEASG00005007223	XPO1	83	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSECAG00000024920	XPO1	83	100.000	Equus_caballus
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	94.286	ENSEEUG00000009479	XPO1	71	94.286	Erinaceus_europaeus
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	96.719	ENSELUG00000012707	xpo1a	80	96.719	Esox_lucius
ENSCHOG00000012088	XPO1	70	92.902	ENSELUG00000014306	-	79	92.902	Esox_lucius
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSFCAG00000002702	XPO1	83	100.000	Felis_catus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSFALG00000010989	XPO1	83	99.481	Ficedula_albicollis
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.414	ENSFDAG00000014716	XPO1	83	97.414	Fukomys_damarensis
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.126	ENSFHEG00000002412	xpo1a	83	93.126	Fundulus_heteroclitus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	89.655	ENSGMOG00000019063	-	83	89.655	Gadus_morhua
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.774	ENSGMOG00000004441	xpo1a	83	93.774	Gadus_morhua
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.741	ENSGALG00000029476	XPO1	83	99.741	Gallus_gallus
ENSCHOG00000012088	XPO1	73	97.615	ENSGAFG00000003355	-	80	97.615	Gambusia_affinis
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	94.844	ENSGAFG00000004408	xpo1a	80	94.844	Gambusia_affinis
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.276	ENSGACG00000002743	-	83	97.276	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.385	ENSGACG00000019736	xpo1a	83	93.385	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.741	ENSGAGG00000017558	XPO1	83	99.741	Gopherus_agassizii
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSGGOG00000034878	XPO1	83	99.481	Gorilla_gorilla
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.276	ENSHBUG00000020037	-	83	97.276	Haplochromis_burtoni
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.645	ENSHBUG00000007128	xpo1a	83	93.645	Haplochromis_burtoni
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSHGLG00000003115	XPO1	83	99.481	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSHGLG00100012227	XPO1	83	99.481	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	96.875	ENSHCOG00000006949	XPO1	80	96.875	Hippocampus_comes
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.665	ENSIPUG00000012891	Xpo1	83	97.665	Ictalurus_punctatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	95.071	ENSIPUG00000024394	XPO1	83	95.071	Ictalurus_punctatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.870	ENSSTOG00000016122	XPO1	83	99.870	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.611	ENSJJAG00000020468	Xpo1	83	99.611	Jaculus_jaculus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	96.757	ENSKMAG00000016218	-	83	96.757	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	92.866	ENSKMAG00000004830	xpo1a	83	92.866	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	91.875	ENSLBEG00000002104	xpo1a	80	91.875	Labrus_bergylta
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.536	ENSLBEG00000005740	-	83	97.536	Labrus_bergylta
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	92.241	ENSLACG00000018213	XPO1	83	92.241	Latimeria_chalumnae
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.054	ENSLOCG00000016095	xpo1b	82	98.054	Lepisosteus_oculatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.741	ENSLAFG00000014553	XPO1	83	99.741	Loxodonta_africana
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSMFAG00000038679	XPO1	83	99.481	Macaca_fascicularis
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSMMUG00000006941	XPO1	83	99.481	Macaca_mulatta
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	ENSMNEG00000030909	XPO1	83	99.481	Macaca_nemestrina
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	96.903	ENSMLEG00000032004	XPO1	83	96.903	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.645	ENSMAMG00000023037	xpo1a	83	93.645	Mastacembelus_armatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.276	ENSMAMG00000010568	-	83	97.276	Mastacembelus_armatus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.276	ENSMZEG00005018158	-	80	97.765	Maylandia_zebra
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.645	ENSMZEG00005005105	xpo1a	83	93.645	Maylandia_zebra
ENSCHOG00000012088	XPO1	51	99.296	ENSMGAG00000001496	-	75	99.296	Meleagris_gallopavo
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.314	ENSMAUG00000006769	Xpo1	83	98.314	Mesocricetus_auratus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSMICG00000027770	XPO1	83	100.000	Microcebus_murinus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.833	ENSMOCG00000012169	Xpo1	83	98.833	Microtus_ochrogaster
ENSCHOG00000012088	XPO1	70	97.488	ENSMMOG00000008001	-	80	97.488	Mola_mola
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	95.312	ENSMMOG00000018767	xpo1a	80	95.312	Mola_mola
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.444	ENSMODG00000002831	XPO1	83	98.444	Monodelphis_domestica
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.017	ENSMALG00000007085	-	83	97.017	Monopterus_albus
ENSCHOG00000012088	XPO1	71	93.760	ENSMALG00000008617	xpo1a	80	93.760	Monopterus_albus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.962	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	83.755	Mus_caroli
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.962	ENSMUSG00000020290	Xpo1	99	83.755	Mus_musculus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.962	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	83.755	Mus_pahari
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.962	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	83.755	Mus_spretus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	ENSMPUG00000005560	XPO1	83	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.870	ENSMLUG00000010670	XPO1	83	99.870	Myotis_lucifugus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.870	ENSNGAG00000022158	Xpo1	83	99.870	Nannospalax_galili
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.645	ENSNBRG00000003776	xpo1a	83	93.645	Neolamprologus_brichardi
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.276	ENSNBRG00000012229	-	85	97.276	Neolamprologus_brichardi
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	94.828	ENSNLEG00000009680	XPO1	83	94.828	Nomascus_leucogenys
ENSCHOG00000012088	XPO1	52	100.000	ENSMEUG00000013277	-	53	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.414	ENSOPRG00000012615	XPO1	83	97.414	Ochotona_princeps
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.925	ENSODEG00000012632	XPO1	83	97.925	Octodon_degus
ENSCHOG00000012088	XPO1	83	88.860	ENSONIG00000000019	xpo1a	83	88.860	Oreochromis_niloticus
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