EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCHOG00000014028 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Choloepus_hoffmanni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18793 bases
Position: chrscaffold_5145:5657-24449
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCHOP00000012433	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.9e-28	1	2
ENSCHOP00000012433	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.9e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCHOT00000014070	PAPOLG-201	1977	-	ENSCHOP00000012433	658 (aa)	-	UPI0001FA0E57

Gene Model

Click here to download ENSCHOG00000014028's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCHOG00000014028's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.627	ENSG00000115421	PAPOLG	100	85.086	Homo_sapiens
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.492	ENSAPOG00000004798	papolg	88	68.892	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.475	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	89	93.475	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.768	ENSACIG00000010546	papolg	88	67.273	Amphilophus_citrinellus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.343	ENSAOCG00000010254	papolg	80	70.641	Amphiprion_ocellaris
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.492	ENSAPEG00000006944	papolg	80	70.790	Amphiprion_percula
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.896	ENSATEG00000009007	papolg	87	71.194	Anabas_testudineus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.963	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	90	70.963	Anas_platyrhynchos
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	91	62.829	ENSACAG00000015048	-	100	62.829	Anolis_carolinensis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.475	ENSANAG00000024627	PAPOLG	89	93.475	Aotus_nancymaae
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.860	ENSACLG00000015592	papolg	89	67.728	Astatotilapia_calliptera
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	71.429	ENSAMXG00000004611	papolg	89	71.429	Astyanax_mexicanus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.323	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	89	93.323	Bos_taurus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.778	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	89	93.778	Callithrix_jacchus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.617	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.539	Canis_familiaris
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.922	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	89	92.922	Canis_lupus_dingo
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.868	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	89	92.868	Capra_hircus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.930	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	89	93.930	Carlito_syrichta
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	53	90.202	ENSCAPG00000014901	-	90	90.202	Cavia_aperea
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.171	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	89	93.171	Cavia_porcellus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.778	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	89	93.778	Cebus_capucinus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	89	99.329	ENSCATG00000044395	PAPOLG	88	99.329	Cercocebus_atys
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.716	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	89	92.716	Chinchilla_lanigera
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.627	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	89	93.627	Chlorocebus_sabaeus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	66	65.904	ENSCING00000024664	-	81	65.904	Ciona_intestinalis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	63	66.268	ENSCSAVG00000009085	-	84	66.268	Ciona_savignyi
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.778	ENSCANG00000038120	PAPOLG	89	93.778	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.199	ENSCGRG00001014951	Papolg	90	91.199	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.199	ENSCGRG00000005552	-	90	91.199	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	67.164	ENSCSEG00000000771	papolg	88	68.524	Cynoglossus_semilaevis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	65.936	ENSCVAG00000016602	papolg	76	86.385	Cyprinodon_variegatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	72.173	ENSDARG00000012141	papolg	89	72.173	Danio_rerio
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.958	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	89	91.958	Dasypus_novemcinctus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	53	98.559	ENSDORG00000016228	Papolg	81	98.559	Dipodomys_ordii
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	98	75.538	ENSETEG00000011815	PAPOLG	88	75.538	Echinops_telfairi
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	65	57.746	ENSEBUG00000005042	-	72	57.746	Eptatretus_burgeri
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	58	69.010	ENSEBUG00000004020	papolg	77	69.010	Eptatretus_burgeri
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	94.385	ENSEASG00005002038	PAPOLG	89	94.385	Equus_asinus_asinus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	94.234	ENSECAG00000009859	PAPOLG	88	94.234	Equus_caballus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	81.184	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	89	81.184	Erinaceus_europaeus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.436	ENSELUG00000014497	papolg	90	62.184	Esox_lucius
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.020	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	89	93.020	Felis_catus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	99	63.636	ENSFALG00000011079	PAPOLG	87	63.636	Ficedula_albicollis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.868	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	86	92.868	Fukomys_damarensis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	75	60.234	ENSFHEG00000019080	papolg	90	60.506	Fundulus_heteroclitus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	80	82.627	ENSGMOG00000018772	papolg	80	82.627	Gadus_morhua
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.945	ENSGALG00000007853	PAPOLG	89	68.945	Gallus_gallus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	65.936	ENSGAFG00000003263	papolg	89	67.552	Gambusia_affinis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	69.585	ENSGACG00000002718	papolg	89	69.778	Gasterosteus_aculeatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.475	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	89	93.475	Gorilla_gorilla
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	67.004	ENSHBUG00000004882	papolg	90	67.977	Haplochromis_burtoni
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.009	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	89	93.009	Heterocephalus_glaber_female
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.009	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	89	93.009	Heterocephalus_glaber_male
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.256	ENSHCOG00000006782	papolg	79	68.703	Hippocampus_comes
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	71.280	ENSIPUG00000021642	papolg	90	71.131	Ictalurus_punctatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.475	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	89	93.475	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	53	98.271	ENSJJAG00000015601	Papolg	81	98.271	Jaculus_jaculus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.703	ENSKMAG00000016439	papolg	89	68.703	Kryptolebias_marmoratus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.334	ENSLBEG00000023218	papolg	89	66.619	Labrus_bergylta
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.563	ENSLACG00000009543	PAPOLG	89	68.563	Latimeria_chalumnae
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.925	ENSLOCG00000016130	papolg	89	70.925	Lepisosteus_oculatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.020	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	89	93.020	Loxodonta_africana
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.930	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	89	93.930	Macaca_fascicularis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.930	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	85.330	Macaca_mulatta
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	84.187	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	88	84.187	Macaca_nemestrina
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.778	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	89	93.778	Mandrillus_leucophaeus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.790	ENSMAMG00000010667	papolg	88	68.168	Mastacembelus_armatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.860	ENSMZEG00005018140	papolg	89	67.820	Maylandia_zebra
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	69.955	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	89	69.955	Meleagris_gallopavo
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.047	ENSMAUG00000009088	Papolg	89	91.047	Mesocricetus_auratus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	94.082	ENSMICG00000010042	PAPOLG	89	94.082	Microcebus_murinus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.351	ENSMOCG00000006857	Papolg	89	91.351	Microtus_ochrogaster
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	69.837	ENSMMOG00000008020	papolg	89	70.431	Mola_mola
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	85.757	ENSMODG00000002160	PAPOLG	89	85.757	Monodelphis_domestica
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.194	ENSMALG00000007012	papolg	88	70.194	Monopterus_albus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.109	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	89	92.109	Mus_caroli
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.958	ENSMUSG00000020273	Papolg	89	91.958	Mus_musculus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.806	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	90	91.806	Mus_pahari
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.806	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	89	91.806	Mus_spretus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.171	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	80	93.171	Mustela_putorius_furo
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.109	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	89	92.109	Myotis_lucifugus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.868	ENSNGAG00000001120	Papolg	89	92.868	Nannospalax_galili
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	60.088	ENSNBRG00000011943	papolg	88	60.677	Neolamprologus_brichardi
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	53	98.559	ENSNLEG00000009507	-	81	98.559	Nomascus_leucogenys
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	79	98.438	ENSMEUG00000013605	-	75	98.438	Notamacropus_eugenii
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.868	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	89	92.868	Ochotona_princeps
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	53	94.236	ENSODEG00000012424	PAPOLG	81	94.236	Octodon_degus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	62.369	ENSONIG00000002985	papolg	89	62.969	Oreochromis_niloticus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	84.328	ENSOANG00000012403	PAPOLG	89	84.328	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	94.385	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	89	94.385	Oryctolagus_cuniculus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.468	ENSORLG00000001577	papolg	86	68.398	Oryzias_latipes
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.806	ENSORLG00020002482	papolg	79	68.601	Oryzias_latipes_hni
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.318	ENSORLG00015008836	papolg	86	68.249	Oryzias_latipes_hsok
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	69.208	ENSOMEG00000001406	papolg	89	69.139	Oryzias_melastigma
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	65	86.744	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	86.744	Otolemur_garnettii
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.868	ENSOARG00000001563	PAPOLG	81	92.868	Ovis_aries
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.627	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	89	93.627	Pan_paniscus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.868	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	89	92.868	Panthera_pardus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.716	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	89	92.716	Panthera_tigris_altaica
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.627	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	89	93.627	Pan_troglodytes
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	89.259	ENSPANG00000014543	PAPOLG	89	89.259	Papio_anubis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.282	ENSPKIG00000003313	papolg	89	70.282	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	93	68.982	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	86	68.982	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	77.661	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	89	77.661	Pelodiscus_sinensis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	90.288	ENSPEMG00000008960	-	90	90.288	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	64	65.877	ENSPMAG00000004864	-	83	65.877	Petromyzon_marinus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	52.212	ENSPMAG00000002961	papolg	89	52.212	Petromyzon_marinus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	85.157	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	89	85.157	Phascolarctos_cinereus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.228	ENSPFOG00000012909	papolg	89	67.308	Poecilia_formosa
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.082	ENSPLAG00000018445	papolg	79	67.507	Poecilia_latipinna
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.277	ENSPMEG00000003961	papolg	79	67.456	Poecilia_mexicana
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	65.793	ENSPREG00000010358	papolg	79	66.422	Poecilia_reticulata
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.475	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	89	93.475	Pongo_abelii
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	85.432	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	90	85.432	Procavia_capensis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	81.915	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	87	81.915	Propithecus_coquereli
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	87	90.456	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	78	90.456	Pteropus_vampyrus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	67.982	ENSPNYG00000006729	papolg	89	67.728	Pundamilia_nyererei
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	71.684	ENSPNAG00000015521	papolg	89	71.684	Pygocentrus_nattereri
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	90.592	ENSRNOG00000006261	Papolg	89	90.592	Rattus_norvegicus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	87.102	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	88	87.102	Rhinopithecus_bieti
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.627	ENSRROG00000035954	PAPOLG	89	93.627	Rhinopithecus_roxellana
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.627	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	89	93.627	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	85.307	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	94	85.307	Sarcophilus_harrisii
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	61.422	ENSSFOG00015011874	papolg	88	61.422	Scleropages_formosus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.249	ENSSFOG00015002383	papolg	89	68.343	Scleropages_formosus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	99	80.567	ENSSMAG00000015598	papolg	85	65.455	Scophthalmus_maximus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.331	ENSSDUG00000000912	papolg	89	70.482	Seriola_dumerili
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.162	ENSSLDG00000001217	papolg	89	70.343	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	76.900	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	89	76.900	Sphenodon_punctatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.307	ENSSPAG00000009004	papolg	88	68.285	Stegastes_partitus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	94.234	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	89	94.234	Sus_scrofa
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	72	74.684	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	87	74.684	Taeniopygia_guttata
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.381	ENSTRUG00000006410	papolg	88	68.381	Takifugu_rubripes
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	99	65.390	ENSTNIG00000017106	papolg	90	65.390	Tetraodon_nigroviridis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	85.281	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	90	85.281	Tupaia_belangeri
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	88.467	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	89	88.467	Tursiops_truncatus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.323	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	90	93.323	Ursus_americanus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.323	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	81	93.323	Ursus_maritimus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	88.923	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	90	88.923	Vicugna_pacos
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.769	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	88	93.769	Vulpes_vulpes
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	74.107	ENSXETG00000002208	papolg	89	74.107	Xenopus_tropicalis
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	64	86.557	ENSXCOG00000006611	papolg	62	86.557	Xiphophorus_couchianus
ENSCHOG00000014028	PAPOLG	80	83.529	ENSXMAG00000007383	papolg	87	83.529	Xiphophorus_maculatus