EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000000198 (Gene tree)
Gene ID: 100387554
Gene Symbol: TRMU
Alias: FLJ10140|MTO2|TRMT
Full Name: tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24015 bases
Position: chrNTIC01000001.1:5904347-5928361
Accession: 100387554
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000065010	tRNA_Me_trans	PF03054.16	1e-140	1	1
ENSCJAP00000000331	tRNA_Me_trans	PF03054.16	6.2e-124	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000081646	TRMU-201	6590	-	ENSCJAP00000065010	421 (aa)	XP_002743906	F7D8I5
ENSCJAT00000000358	TRMU-202	1131	-	ENSCJAP00000000331	377 (aa)	-	F7D8A1

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000000198's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000000198's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	92.637	ENSG00000100416	TRMU	100	93.656	Homo_sapiens
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	68.193	ENSAPOG00000014458	trmu	99	68.193	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	88.193	ENSAMEG00000003319	TRMU	99	88.193	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	66.667	ENSACIG00000002101	trmu	99	66.667	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	68.750	ENSAOCG00000013155	trmu	99	68.750	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	68.510	ENSAPEG00000013350	trmu	99	68.510	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000000198	TRMU	94	69.270	ENSATEG00000007814	trmu	97	69.270	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000000198	TRMU	91	76.364	ENSAPLG00000016380	TRMU	98	76.364	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	77.349	ENSACAG00000007720	TRMU	99	77.349	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	95.225	ENSANAG00000038053	TRMU	100	95.225	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	68.106	ENSACLG00000005395	trmu	98	69.648	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	68.447	ENSAMXG00000005282	trmu	99	68.447	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	88.916	ENSBTAG00000005595	TRMU	99	88.916	Bos_taurus
ENSCJAG00000000198	TRMU	90	40.568	WBGene00007114	mttu-1	98	40.568	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	89.781	ENSCAFG00000000779	TRMU	99	88.599	Canis_familiaris
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	89.781	ENSCAFG00020009184	TRMU	99	88.599	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	89.398	ENSCHIG00000017074	TRMU	99	89.398	Capra_hircus
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	87.648	ENSTSYG00000003853	TRMU	100	87.648	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000000198	TRMU	96	79.245	ENSCAPG00000013034	TRMU	99	79.245	Cavia_aperea
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	84.524	ENSCPOG00000020780	TRMU	99	84.524	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	95.491	ENSCCAG00000021641	TRMU	100	94.537	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	92.363	ENSCATG00000032800	TRMU	99	92.363	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	85.000	ENSCLAG00000017269	TRMU	99	85.000	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	92.363	ENSCSAG00000005279	TRMU	99	92.363	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000000198	TRMU	88	78.649	ENSCPBG00000011621	TRMU	93	78.649	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000000198	TRMU	90	51.026	ENSCING00000019371	-	95	48.329	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	91.247	ENSCANG00000041645	TRMU	100	91.247	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.747	ENSCGRG00001001739	Trmu	99	86.747	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	80.000	ENSCGRG00000002781	Trmu	99	80.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	66.908	ENSCSEG00000012382	trmu	99	66.908	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	68.434	ENSCVAG00000001366	trmu	99	68.434	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	94	67.254	ENSDARG00000043734	trmu	95	67.254	Danio_rerio
ENSCJAG00000000198	TRMU	53	82.143	ENSDNOG00000047245	-	84	78.661	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	86.375	ENSDORG00000007455	Trmu	100	86.375	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000000198	TRMU	89	42.627	FBgn0040337	CG3021	95	43.229	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000000198	TRMU	51	88.136	ENSETEG00000009394	-	66	88.136	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000000198	TRMU	94	53.383	ENSEBUG00000007454	trmu	99	53.509	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	89.487	ENSEASG00005021725	TRMU	100	88.124	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	89.487	ENSECAG00000000467	TRMU	99	88.304	Equus_caballus
ENSCJAG00000000198	TRMU	70	66.892	ENSEEUG00000000074	-	77	92.593	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000000198	TRMU	94	67.085	ENSELUG00000009464	trmu	99	66.576	Esox_lucius
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	89.487	ENSFCAG00000006533	TRMU	100	88.361	Felis_catus
ENSCJAG00000000198	TRMU	91	74.555	ENSFALG00000010035	TRMU	99	74.555	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000000198	TRMU	93	84.439	ENSFDAG00000017472	TRMU	99	84.439	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	68.675	ENSFHEG00000003162	trmu	98	70.300	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000000198	TRMU	95	63.275	ENSGMOG00000001323	trmu	99	63.275	Gadus_morhua
ENSCJAG00000000198	TRMU	96	75.604	ENSGALG00000031922	TRMU	98	75.604	Gallus_gallus
ENSCJAG00000000198	TRMU	95	70.677	ENSGAFG00000013331	trmu	96	70.677	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	65.558	ENSGACG00000019024	trmu	99	65.558	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	92.399	ENSGGOG00000000203	TRMU	100	92.399	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	67.626	ENSHBUG00000023421	trmu	98	69.106	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	83.810	ENSHGLG00000009278	TRMU	99	83.810	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	83.810	ENSHGLG00100018863	TRMU	99	83.810	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	68.204	ENSHCOG00000013459	trmu	99	68.204	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000000198	TRMU	95	69.424	ENSIPUG00000009785	trmu	98	69.424	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	87.857	ENSSTOG00000010993	TRMU	99	87.857	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.265	ENSJJAG00000000667	Trmu	99	86.265	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	67.229	ENSKMAG00000008516	trmu	99	67.229	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	67.554	ENSLBEG00000018831	trmu	99	67.554	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	72.315	ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.315	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	70.238	ENSLOCG00000016066	trmu	99	70.238	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	74.880	ENSLAFG00000005129	TRMU	99	74.880	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	92.573	ENSMFAG00000039767	TRMU	99	92.573	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	92.363	ENSMMUG00000000807	TRMU	99	92.363	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	92.573	ENSMNEG00000028164	TRMU	100	92.573	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	92.363	ENSMLEG00000033884	TRMU	99	92.363	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	67.711	ENSMAMG00000004717	trmu	99	67.711	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	95	69.925	ENSMZEG00005015797	trmu	96	69.925	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000000198	TRMU	77	74.474	ENSMGAG00000007550	TRMU	97	74.474	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.988	ENSMAUG00000022282	Trmu	99	86.988	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	88.830	ENSMICG00000029046	TRMU	100	88.830	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	87.073	ENSMOCG00000014641	Trmu	98	87.073	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	66.346	ENSMMOG00000007229	trmu	99	66.346	Mola_mola
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	76.442	ENSMODG00000007433	TRMU	96	76.442	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000000198	TRMU	95	68.421	ENSMALG00000007721	trmu	96	68.421	Monopterus_albus
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	86.585	MGP_CAROLIEiJ_G0020134	Trmu	98	86.585	Mus_caroli
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.506	ENSMUSG00000022386	Trmu	99	86.506	Mus_musculus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.265	MGP_PahariEiJ_G0020139	Trmu	99	86.265	Mus_pahari
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.506	MGP_SPRETEiJ_G0021031	Trmu	99	86.506	Mus_spretus
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	88.361	ENSMPUG00000002523	TRMU	100	88.361	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.298	ENSNGAG00000005132	Trmu	99	86.298	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	67.866	ENSNBRG00000022690	trmu	98	69.849	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	93.103	ENSNLEG00000015773	TRMU	99	93.103	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000000198	TRMU	87	69.207	ENSMEUG00000000216	TRMU	99	69.207	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	85.372	ENSODEG00000014745	TRMU	99	85.372	Octodon_degus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	67.866	ENSONIG00000009821	trmu	99	67.866	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000000198	TRMU	93	75.127	ENSOANG00000001891	TRMU	99	75.127	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000000198	TRMU	92	86.856	ENSOCUG00000003664	TRMU	97	85.222	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	66.993	ENSORLG00000019015	trmu	99	66.993	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	66.993	ENSORLG00020006830	trmu	99	66.993	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	66.993	ENSORLG00015003907	trmu	99	66.993	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000000198	TRMU	57	64.730	ENSOMEG00000015541	trmu	87	64.730	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	88.675	ENSOGAG00000008096	TRMU	99	88.675	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	81.446	ENSOARG00000019475	TRMU	99	81.446	Ovis_aries
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	92.399	ENSPPAG00000033944	TRMU	100	92.399	Pan_paniscus
ENSCJAG00000000198	TRMU	96	89.877	ENSPPRG00000004197	TRMU	100	88.599	Panthera_pardus
ENSCJAG00000000198	TRMU	72	88.603	ENSPTIG00000014122	TRMU	98	89.474	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	92.399	ENSPTRG00000014510	TRMU	100	92.399	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	92.042	ENSPANG00000023074	TRMU	100	92.042	Papio_anubis
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	67.961	ENSPKIG00000002849	trmu	99	67.961	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000000198	TRMU	86	77.901	ENSPSIG00000013020	TRMU	95	77.901	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	68.689	ENSPMGG00000004083	trmu	99	68.689	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.905	ENSPEMG00000014007	Trmu	99	86.905	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000000198	TRMU	95	79.648	ENSPCIG00000009923	TRMU	97	77.831	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000000198	TRMU	95	66.667	ENSPFOG00000008197	trmu	90	66.667	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	68.916	ENSPLAG00000008414	trmu	99	68.916	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	69.157	ENSPMEG00000004326	trmu	99	69.157	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	68.916	ENSPREG00000007980	trmu	99	68.916	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	92.162	ENSPPYG00000011949	TRMU	100	92.162	Pongo_abelii
ENSCJAG00000000198	TRMU	92	77.519	ENSPCAG00000013462	TRMU	99	77.519	Procavia_capensis
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	89.311	ENSPCOG00000016539	TRMU	100	89.311	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000000198	TRMU	96	80.494	ENSPVAG00000013202	TRMU	99	79.518	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	67.626	ENSPNYG00000005629	trmu	99	67.626	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	67.961	ENSPNAG00000006339	trmu	97	67.961	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	86.988	ENSRNOG00000016465	Trmu	99	86.988	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	91.512	ENSRBIG00000038973	TRMU	99	91.647	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	91.512	ENSRROG00000004267	TRMU	99	91.512	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000000198	TRMU	90	30.673	YDL033C	SLM3	91	30.673	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	94.299	ENSSBOG00000030184	TRMU	100	94.299	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000000198	TRMU	89	67.647	ENSSFOG00015020664	trmu	98	67.647	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	67.797	ENSSMAG00000019450	trmu	99	67.797	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	69.565	ENSSDUG00000011913	trmu	99	69.565	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	69.807	ENSSLDG00000011684	trmu	99	69.807	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	67.153	ENSSPUG00000017123	TRMU	98	67.153	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	68.599	ENSSPAG00000021875	trmu	99	68.599	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000000198	TRMU	97	90.196	ENSSSCG00000000007	TRMU	100	88.599	Sus_scrofa
ENSCJAG00000000198	TRMU	88	76.676	ENSTGUG00000003663	-	100	76.676	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	68.523	ENSTRUG00000001231	trmu	100	68.523	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	68.333	ENSTNIG00000010484	trmu	99	68.333	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000000198	TRMU	93	53.435	ENSTBEG00000011276	-	100	53.435	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	87.648	ENSTTRG00000004160	TRMU	100	87.648	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000000198	TRMU	77	89.726	ENSUAMG00000024825	TRMU	97	89.726	Ursus_americanus
ENSCJAG00000000198	TRMU	98	72.749	ENSUMAG00000019079	TRMU	97	89.105	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000000198	TRMU	58	78.539	ENSVPAG00000000685	-	100	78.539	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000000198	TRMU	100	88.124	ENSVVUG00000024963	TRMU	100	88.124	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	72.275	ENSXETG00000023304	trmu	99	72.275	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	66.507	ENSXCOG00000015105	trmu	99	66.507	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000000198	TRMU	99	68.916	ENSXMAG00000006697	trmu	99	68.916	Xiphophorus_maculatus