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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000001094 (Gene tree)
Gene ID: 100407781
Gene Symbol: CNOT3
Alias: KIAA0691|LENG2|NOT3|NOT3H
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 3
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18034 bases
Position: chrNTIC01011113.1:24336585-24354618
Accession: 7879
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000001895	Not3	PF04065.15	6.6e-95	1	1
ENSCJAP00000042495	Not3	PF04065.15	2.9e-11	1	1
ENSCJAP00000001895	NOT2_3_5	PF04153.18	8.1e-41	1	1
ENSCJAP00000042495	NOT2_3_5	PF04153.18	1.3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000002009	CNOT3-201	3330	-	ENSCJAP00000001895	754 (aa)	-	U3F509
ENSCJAT00000057545	CNOT3-202	1698	-	ENSCJAP00000042495	565 (aa)	-	F6Z6Q5

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03018	RNA degradation	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	98.674	ENSG00000088038	CNOT3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000001094	CNOT3	69	81.720	ENSAPOG00000015499	CNOT3	95	81.720	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	94.430	ENSAMEG00000004528	CNOT3	100	93.899	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000001094	CNOT3	75	89.145	ENSACIG00000006635	cnot3a	99	93.162	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	59	89.732	ENSACIG00000003652	cnot3b	76	88.987	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	66	86.425	ENSAOCG00000018385	-	78	77.903	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000001094	CNOT3	83	90.132	ENSAOCG00000023769	cnot3a	67	89.836	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000001094	CNOT3	66	86.425	ENSAPEG00000002640	cnot3b	75	90.741	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000001094	CNOT3	84	90.132	ENSAPEG00000006624	cnot3a	68	89.836	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000001094	CNOT3	84	90.789	ENSATEG00000022737	cnot3a	67	90.492	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	74	90.323	ENSATEG00000015777	cnot3b	66	92.105	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	80.952	ENSACAG00000016085	CNOT3	100	80.530	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	99.735	ENSANAG00000025756	CNOT3	100	99.735	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	92.459	ENSACLG00000016702	cnot3b	67	92.763	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000001094	CNOT3	84	90.132	ENSACLG00000021136	cnot3a	68	89.836	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000001094	CNOT3	75	89.180	ENSAMXG00000012359	cnot3a	76	75.573	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	91.148	ENSAMXG00000009447	cnot3b	74	88.770	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	93.236	ENSBTAG00000014900	CNOT3	100	93.369	Bos_taurus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	60	52.332	WBGene00003826	ntl-3	97	52.332	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	96.419	ENSCAFG00000002699	CNOT3	100	96.419	Canis_familiaris
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	96.419	ENSCAFG00020018359	CNOT3	100	96.419	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000001094	CNOT3	99	90.969	ENSCHIG00000015302	CNOT3	99	91.102	Capra_hircus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	96.684	ENSTSYG00000008058	CNOT3	100	96.684	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	93.767	ENSCAPG00000009533	CNOT3	100	93.767	Cavia_aperea
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	94.695	ENSCPOG00000020741	CNOT3	100	94.828	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	99.735	ENSCCAG00000036290	CNOT3	100	99.735	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	98.011	ENSCATG00000030324	CNOT3	100	98.011	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	93.369	ENSCLAG00000003302	CNOT3	100	93.236	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	98.276	ENSCSAG00000001900	CNOT3	100	98.276	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	81.234	ENSCPBG00000011655	CNOT3	100	80.341	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	48.557	ENSCING00000000293	-	83	68.240	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	98.408	ENSCANG00000013408	CNOT3	100	98.408	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	94.430	ENSCGRG00001000855	Cnot3	100	94.297	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000001094	CNOT3	62	76.046	ENSCGRG00000012929	Cnot3	75	75.665	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	80.328	ENSCSEG00000016892	cnot3b	100	61.408	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	88.852	ENSCSEG00000003574	cnot3a	68	88.852	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000001094	CNOT3	91	89.508	ENSCVAG00000008168	cnot3a	69	88.103	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	73	90.164	ENSCVAG00000022122	cnot3b	70	76.692	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	89.508	ENSDARG00000007135	cnot3a	69	88.387	Danio_rerio
ENSCJAG00000001094	CNOT3	87	88.235	ENSDARG00000019842	cnot3b	69	88.235	Danio_rerio
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	96.154	ENSDNOG00000045972	CNOT3	100	96.154	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	94.430	ENSDORG00000008021	Cnot3	100	94.297	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000001094	CNOT3	60	66.111	FBgn0033029	Not3	51	66.111	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000001094	CNOT3	71	100.000	ENSETEG00000006305	CNOT3	71	100.000	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	56.187	ENSEBUG00000010437	cnot3a	100	56.116	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	96.954	ENSEASG00005021591	CNOT3	100	96.954	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	97.086	ENSECAG00000023181	CNOT3	100	97.086	Equus_caballus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	80.909	ENSELUG00000014743	cnot3a	70	80.000	Esox_lucius
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	88.889	ENSELUG00000000953	cnot3b	66	88.525	Esox_lucius
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	95.889	ENSFCAG00000014042	CNOT3	100	95.889	Felis_catus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	75	87.869	ENSFHEG00000023166	cnot3a	84	83.088	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	75	89.836	ENSFHEG00000001696	cnot3b	74	75.127	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	80	84.039	ENSGMOG00000005365	cnot3a	65	84.039	Gadus_morhua
ENSCJAG00000001094	CNOT3	72	88.525	ENSGAFG00000003459	cnot3b	75	74.112	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000001094	CNOT3	75	89.180	ENSGAFG00000013094	cnot3a	68	89.180	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000001094	CNOT3	77	83.987	ENSGACG00000011489	cnot3a	64	83.987	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	99	78.961	ENSGAGG00000012677	CNOT3	100	79.192	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	98.674	ENSGGOG00000012996	CNOT3	100	98.674	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000001094	CNOT3	99	75.908	ENSHBUG00000019699	cnot3b	57	84.163	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000001094	CNOT3	84	90.132	ENSHBUG00000005275	cnot3a	68	89.836	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	94.430	ENSHGLG00000008821	CNOT3	100	94.430	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000001094	CNOT3	82	75.810	ENSHGLG00100006181	CNOT3	100	81.609	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000001094	CNOT3	84	89.145	ENSHCOG00000020968	cnot3a	75	86.328	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000001094	CNOT3	99	82.119	ENSIPUG00000000167	cnot3	71	84.194	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	95	91.398	ENSIPUG00000009046	cnot3b	67	91.398	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	97.215	ENSSTOG00000028248	CNOT3	100	97.215	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	95.358	ENSJJAG00000014594	Cnot3	100	95.225	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	72	91.803	ENSKMAG00000018723	cnot3b	67	92.105	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	89.836	ENSKMAG00000004863	cnot3a	71	87.108	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	86	90.492	ENSLBEG00000018278	cnot3b	71	89.508	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	75.849	ENSLACG00000009742	CNOT3	100	75.033	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000001094	CNOT3	64	94.426	ENSLOCG00000000005	cnot3b	83	88.060	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	90.873	ENSLAFG00000022133	CNOT3	100	90.873	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	98.011	ENSMFAG00000040073	CNOT3	100	98.011	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	89.920	ENSMMUG00000009698	CNOT3	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	97.745	ENSMNEG00000036750	CNOT3	100	97.745	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	93.140	ENSMLEG00000036579	CNOT3	100	93.272	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	74	90.323	ENSMAMG00000019357	cnot3b	65	91.776	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	84	90.461	ENSMAMG00000019397	cnot3a	68	90.164	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	92.459	ENSMZEG00005002466	cnot3b	67	92.763	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000001094	CNOT3	84	90.132	ENSMZEG00005016304	cnot3a	68	89.836	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	94.960	ENSMAUG00000014996	Cnot3	100	94.828	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	97.616	ENSMICG00000002370	CNOT3	100	97.616	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	71	100.000	ENSMOCG00000013249	Cnot3	99	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000001094	CNOT3	72	85.197	ENSMMOG00000016446	cnot3a	67	84.918	Mola_mola
ENSCJAG00000001094	CNOT3	60	87.917	ENSMMOG00000013086	cnot3b	73	87.917	Mola_mola
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	86.508	ENSMODG00000004066	CNOT3	100	86.905	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	88.852	ENSMALG00000009204	cnot3a	77	73.086	Monopterus_albus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	95.093	MGP_CAROLIEiJ_G0029095	Cnot3	100	99.000	Mus_caroli
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	95.093	ENSMUSG00000035632	Cnot3	100	99.000	Mus_musculus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	94.828	MGP_PahariEiJ_G0020964	Cnot3	100	99.000	Mus_pahari
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	95.093	MGP_SPRETEiJ_G0030148	Cnot3	100	99.000	Mus_spretus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	95.756	ENSMPUG00000010352	CNOT3	100	95.889	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	96.021	ENSNGAG00000013266	Cnot3	100	95.889	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000001094	CNOT3	78	90.157	ENSNBRG00000002401	cnot3a	63	90.157	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000001094	CNOT3	99	64.637	ENSNBRG00000003336	cnot3b	85	87.611	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	92.573	ENSNLEG00000006272	CNOT3	100	92.063	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000001094	CNOT3	78	100.000	ENSMEUG00000002952	CNOT3	78	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000001094	CNOT3	61	100.000	ENSOPRG00000001605	-	66	100.000	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	94.297	ENSODEG00000000705	CNOT3	100	94.164	Octodon_degus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	84	90.132	ENSONIG00000006568	cnot3a	70	89.836	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	72	92.131	ENSONIG00000007047	cnot3b	67	92.434	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	100	96.419	ENSOCUG00000007691	CNOT3	100	96.419	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000001094	CNOT3	71	91.803	ENSORLG00000005982	cnot3b	72	86.527	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	89.836	ENSORLG00000011174	cnot3a	68	89.836	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000001094	CNOT3	85	89.508	ENSORLG00020008009	cnot3a	68	89.508	Oryzias_latipes_hni
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