EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000001148 (Gene tree)
Gene ID: 100405267
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10257 bases
Position: chrNTIC01002224.1:35607882-35618138
Accession: 100405267
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000001975	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.6e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000002092	TWISTNB-201	1155	-	ENSCJAP00000001975	339 (aa)	XP_002751566	F6WGE7

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	92.262	ENSG00000105849	TWISTNB	97	92.793	Homo_sapiens
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	65	51.316	ENSAPOG00000011796	twistnb	51	55.330	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	70.026	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	97	71.391	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	67	53.191	ENSAOCG00000024200	twistnb	52	57.353	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	67	53.191	ENSAPEG00000016750	twistnb	84	43.860	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	50	63.314	ENSACAG00000011817	TWISTNB	86	63.314	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	98	95.195	ENSANAG00000026418	TWISTNB	98	95.195	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	58	55.330	ENSACLG00000022280	twistnb	78	47.284	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	56	54.974	ENSAMXG00000035868	twistnb	60	55.224	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	77.876	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	98	76.877	Bos_taurus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	74.640	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	97	76.833	Canis_familiaris
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	76.968	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	91	78.338	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	77.581	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	98	77.477	Capra_hircus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	86.053	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	97	86.486	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	80.826	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	98	81.081	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	95.252	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	97	95.495	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.369	ENSCATG00000035621	TWISTNB	97	91.892	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	82.493	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	98	82.583	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.667	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	97	92.192	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	79	88.636	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	77	88.636	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	93	60.377	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	85	61.754	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.964	ENSCANG00000038759	TWISTNB	97	92.492	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	74.777	ENSCGRG00001000499	Twistnb	99	75.758	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	60	55.665	ENSCVAG00000014324	twistnb	52	55.665	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	62	54.630	ENSDARG00000024416	twistnb	56	54.338	Danio_rerio
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	80.236	ENSDNOG00000006438	-	98	81.381	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	91	78.135	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	78.135	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	83.186	ENSEASG00005021702	TWISTNB	94	83.784	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	83.481	ENSECAG00000014563	TWISTNB	94	84.084	Equus_caballus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	90	47.003	ENSELUG00000000098	TWISTNB	83	48.852	Esox_lucius
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	82.596	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	98	82.831	Felis_catus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	85	53.443	ENSFALG00000009761	TWISTNB	55	70.238	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	98	81.381	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	98	81.381	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	69	51.261	ENSFHEG00000013318	twistnb	60	53.333	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	93	54.747	ENSGALG00000010863	TWISTNB	69	55.401	Gallus_gallus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	51	60.345	ENSGAFG00000018309	twistnb	54	57.143	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	64	50.661	ENSGACG00000006425	twistnb	87	48.899	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.667	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	97	92.192	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	58	54.822	ENSHBUG00000020155	twistnb	78	46.519	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	81.602	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	98	81.381	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	98	81.381	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	98	81.381	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	93	43.917	ENSIPUG00000004117	twistnb	90	44.109	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	83.086	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	91	83.183	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	73.746	ENSJJAG00000015887	Twistnb	98	73.874	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	54	57.609	ENSKMAG00000001591	twistnb	56	53.991	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	96	44.058	ENSLBEG00000024225	twistnb	51	55.941	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	92	51.402	ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	52.443	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	54	63.043	ENSLOCG00000011399	twistnb	55	63.243	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	82.196	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.282	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.667	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	97	92.192	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.667	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	96	92.192	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.071	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	97	91.592	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.667	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	97	92.192	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	58	55.330	ENSMZEG00005007561	twistnb	78	47.284	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	87.021	ENSMICG00000036489	TWISTNB	99	87.879	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	96	76.852	ENSMOCG00000003458	Twistnb	98	77.329	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	64	48.899	ENSMMOG00000020085	twistnb	50	53.093	Mola_mola
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	87	58.416	ENSMODG00000001402	-	65	59.801	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	53	55.249	ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.492	Monopterus_albus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	75.588	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	99	76.577	Mus_caroli
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	74.926	ENSMUSG00000020561	Twistnb	99	76.133	Mus_musculus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	97	75.227	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.227	Mus_pahari
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	75.221	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	99	76.435	Mus_spretus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	82.891	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	92	82.883	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	93	75.478	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	98	77.273	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	59	83.417	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.417	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	59	54.774	ENSNBRG00000008652	twistnb	83	45.886	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	95	91.900	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	93	92.429	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	76.023	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	97	76.647	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	80.117	ENSODEG00000007222	TWISTNB	98	80.060	Octodon_degus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	88	48.562	ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.667	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	88	45.223	ENSORLG00015013403	twistnb	71	48.515	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	88.427	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	98	88.889	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	77.581	ENSOARG00000009803	TWISTNB	97	77.477	Ovis_aries
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.964	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	97	92.793	Pan_paniscus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	81.416	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	98	81.627	Panthera_pardus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	88	82.667	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	97	82.935	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	92.560	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	97	93.093	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.071	ENSPANG00000015736	TWISTNB	97	91.592	Papio_anubis
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	53	64.045	ENSPKIG00000025635	twistnb	52	61.905	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	94	44.083	ENSPMGG00000019023	twistnb	50	57.868	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	86	57.966	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	92	57.929	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.071	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	97	91.592	Pongo_abelii
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	97	88.110	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	88.110	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	78.571	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	97	78.679	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	92	47.840	ENSPNYG00000002674	twistnb	83	47.284	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	93	45.322	ENSPNAG00000011956	twistnb	63	52.838	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	95	76.471	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	76.471	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.395	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	96	92.192	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	91.395	ENSRROG00000040155	TWISTNB	97	92.192	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	98	94.294	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	98	94.895	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	53	57.377	ENSSFOG00015012788	twistnb	58	57.377	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	93	42.939	ENSSDUG00000007038	twistnb	63	48.438	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	87	49.675	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	90	51.027	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	85	47.651	ENSSPAG00000005871	twistnb	82	46.795	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	80.588	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	96	80.488	Sus_scrofa
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	85	43.813	ENSTNIG00000017778	twistnb	84	44.863	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	81.548	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	97	81.982	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	83.186	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	98	83.183	Ursus_americanus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	82.891	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	98	82.883	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	77.551	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	98	78.932	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000001148	TWISTNB	66	54.222	ENSXCOG00000020199	twistnb	55	56.650	Xiphophorus_couchianus