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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000001567 (Gene tree)
Gene ID: 100398024
Gene Symbol: CNOT2
Alias: CDC36|NOT2|NOT2H
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 69300 bases
Position: chrNTIC01000002.1:61513056-61582355
Accession: 7878
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000002888	NOT2_3_5	PF04153.18	1.2e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000062743	CNOT2-202	1222	-	ENSCJAP00000050282	256 (aa)	-	F7EYY9
ENSCJAT00000003052	CNOT2-201	1506	-	ENSCJAP00000002888	501 (aa)	-	F7I6N9

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSG00000111596	CNOT2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.672	ENSAPOG00000021013	cnot2	100	78.626	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	73	66.568	ENSAPOG00000017950	CNOT2	97	66.568	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSAMEG00000011938	CNOT2	100	89.630	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000001567	CNOT2	74	74.269	ENSACIG00000007480	CNOT2	98	74.269	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	86	80.426	ENSACIG00000020740	cnot2	99	80.625	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.863	ENSAOCG00000022167	cnot2	100	78.817	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.863	ENSAPEG00000011343	cnot2	100	78.817	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	70.803	ENSAPEG00000024152	CNOT2	97	75.294	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	71.349	ENSATEG00000023619	CNOT2	100	71.904	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	79.541	ENSATEG00000018641	cnot2	100	79.541	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	90.323	ENSAPLG00000012657	CNOT2	100	90.323	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	90.267	ENSACAG00000004779	CNOT2	85	90.267	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.259	ENSANAG00000024330	CNOT2	99	91.221	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.672	ENSACLG00000004020	cnot2	100	78.626	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	71.698	ENSACLG00000008724	CNOT2	100	72.264	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	79.159	ENSAMXG00000000972	cnot2	100	79.159	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSBTAG00000003748	CNOT2	95	96.923	Bos_taurus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	55	32.153	WBGene00003825	ntl-2	75	36.667	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSCAFG00000000441	CNOT2	100	89.630	Canis_familiaris
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSCAFG00020016849	CNOT2	100	89.444	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSCHIG00000021610	CNOT2	99	91.412	Capra_hircus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.259	ENSTSYG00000012927	CNOT2	99	91.048	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000001567	CNOT2	99	79.960	ENSCAPG00000012192	CNOT2	98	79.960	Cavia_aperea
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.522	ENSCPOG00000004756	CNOT2	100	89.522	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSCCAG00000033920	CNOT2	97	96.923	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSCATG00000036994	CNOT2	97	95.455	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSCLAG00000014354	CNOT2	100	90.330	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSCSAG00000004177	CNOT2	100	89.630	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	93	100.000	ENSCHOG00000001283	CNOT2	86	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	90.769	ENSCPBG00000013399	CNOT2	100	90.769	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	92.439	ENSCANG00000037683	CNOT2	99	94.542	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSCGRG00001016595	Cnot2	100	89.630	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000001567	CNOT2	74	89.320	ENSCGRG00000001043	Cnot2	99	89.320	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	71.429	ENSCSEG00000020129	-	97	76.829	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000001567	CNOT2	86	80.000	ENSCSEG00000015529	cnot2	99	80.208	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000001567	CNOT2	58	74.164	ENSCVAG00000003227	cnot2	99	73.574	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	64.522	ENSCVAG00000019882	CNOT2	95	75.224	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	79.350	ENSDARG00000061802	cnot2	100	79.350	Danio_rerio
ENSCJAG00000001567	CNOT2	99	89.796	ENSDNOG00000019444	CNOT2	99	89.796	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSDORG00000011201	Cnot2	100	90.330	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSETEG00000007655	CNOT2	100	89.444	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	56.597	ENSEBUG00000004355	cnot2	100	56.597	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	88.704	ENSEASG00005008113	CNOT2	99	90.649	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	88.889	ENSECAG00000013864	CNOT2	99	90.840	Equus_caballus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	70	95.092	ENSEEUG00000003003	CNOT2	66	95.322	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	98	80.150	ENSELUG00000012055	CNOT2	99	80.150	Esox_lucius
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	76.302	ENSELUG00000007279	cnot2	99	76.481	Esox_lucius
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSFCAG00000024278	CNOT2	100	89.630	Felis_catus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	90.304	ENSFALG00000010251	CNOT2	100	90.304	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.074	ENSFDAG00000008421	CNOT2	100	89.670	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	67.712	ENSFHEG00000012921	-	100	67.712	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	74.857	ENSFHEG00000009600	cnot2	100	75.619	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.567	ENSGMOG00000016382	cnot2	100	78.517	Gadus_morhua
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	90.769	ENSGALG00000010042	CNOT2	100	90.769	Gallus_gallus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	67.100	ENSGAFG00000018811	-	100	67.472	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	74.667	ENSGAFG00000021852	cnot2	100	75.429	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.841	ENSGACG00000013517	cnot2	100	78.788	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	65.913	ENSGACG00000015711	-	100	65.913	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	90.840	ENSGAGG00000025593	CNOT2	99	90.840	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSGGOG00000027402	CNOT2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.672	ENSHBUG00000000166	cnot2	100	78.626	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	71.698	ENSHBUG00000016226	CNOT2	100	72.264	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSHGLG00000007294	CNOT2	100	90.110	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSHGLG00100014317	CNOT2	100	90.110	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	76.190	ENSHCOG00000008229	cnot2	100	77.143	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	79.735	ENSIPUG00000018563	cnot2	100	79.885	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	76.571	ENSIPUG00000016424	CNOT2	95	76.571	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSSTOG00000011114	CNOT2	99	91.412	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.259	ENSJJAG00000021519	Cnot2	100	89.259	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	75.954	ENSKMAG00000000577	cnot2	100	76.908	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	66.360	ENSKMAG00000008167	-	100	68.324	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	70.909	ENSLBEG00000014428	-	100	74.390	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.290	ENSLBEG00000004046	cnot2	100	78.244	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	87.833	ENSLACG00000007016	CNOT2	100	87.931	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000001567	CNOT2	98	85.094	ENSLOCG00000016216	cnot2	99	85.094	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSLAFG00000004789	CNOT2	100	89.630	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSMFAG00000034373	CNOT2	97	95.455	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSMMUG00000014853	CNOT2	99	91.603	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	92.030	ENSMNEG00000045426	CNOT2	99	94.129	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSMLEG00000041145	CNOT2	97	95.455	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.672	ENSMAMG00000002615	cnot2	100	78.626	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	68.132	ENSMAMG00000019519	CNOT2	100	75.000	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	71.698	ENSMZEG00005016159	CNOT2	100	72.264	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.672	ENSMZEG00005017275	cnot2	100	78.626	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	84.061	ENSMGAG00000010615	CNOT2	97	84.061	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSMAUG00000012049	Cnot2	100	90.330	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSMICG00000001644	CNOT2	99	91.603	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSMOCG00000011255	Cnot2	100	90.110	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	76.908	ENSMMOG00000018877	cnot2	100	77.863	Mola_mola
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	72.505	ENSMMOG00000006017	CNOT2	100	72.881	Mola_mola
ENSCJAG00000001567	CNOT2	97	90.076	ENSMODG00000020387	CNOT2	94	90.076	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.629	ENSMALG00000013354	cnot2	100	78.394	Monopterus_albus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	70.718	ENSMALG00000008200	CNOT2	100	70.620	Monopterus_albus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.074	MGP_CAROLIEiJ_G0015822	Cnot2	99	91.031	Mus_caroli
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSMUSG00000020166	Cnot2	100	90.110	Mus_musculus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.074	MGP_PahariEiJ_G0031265	Cnot2	99	91.031	Mus_pahari
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	MGP_SPRETEiJ_G0016644	Cnot2	99	91.412	Mus_spretus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSMPUG00000017494	CNOT2	100	89.630	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSMLUG00000012301	CNOT2	100	89.444	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.444	ENSNGAG00000020842	Cnot2	100	90.110	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	71.698	ENSNBRG00000015257	CNOT2	100	72.264	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSNLEG00000004064	CNOT2	97	96.923	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000001567	CNOT2	91	95.389	ENSOPRG00000002600	CNOT2	84	95.389	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.630	ENSODEG00000004532	CNOT2	100	89.630	Octodon_degus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	69.316	ENSONIG00000009907	CNOT2	100	71.933	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	96	77.290	ENSONIG00000010467	cnot2	100	78.244	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000001567	CNOT2	100	89.259	ENSOANG00000005959	CNOT2	98	89.259	Ornithorhynchus_anatinus
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