EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000001610 (Gene tree)
Gene ID: 100389074
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 49202 bases
Position: chrNTIC01036611.1:85568899-85618100
Accession: 100389074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000054094	PAZ	PF02170.22	9.9e-28	1	1
ENSCJAP00000003042	PAZ	PF02170.22	9.9e-28	1	1
ENSCJAP00000054094	Piwi	PF02171.17	4.5e-105	1	1
ENSCJAP00000003042	Piwi	PF02171.17	4.5e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000085405	AGO4-202	2586	-	ENSCJAP00000054094	861 (aa)	-	A0A2R8P2S1
ENSCJAT00000003211	AGO4-201	7442	-	ENSCJAP00000003042	861 (aa)	XP_017830045	U3DZG7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	83.489	ENSCJAG00000032023	AGO1	98	83.489
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	81.062	ENSCJAG00000031580	AGO3	99	81.062
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	79.034	ENSCJAG00000004132	AGO2	100	77.701

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSG00000134698	AGO4	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000001610	AGO4	96	96.301	ENSAPOG00000023867	ago4	99	96.301	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	100.000	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	99.534	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	97.733	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	93.073	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000001610	AGO4	98	99.528	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	99.528	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	98.480	ENSACAG00000017275	AGO4	99	98.480	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.884	ENSANAG00000031428	AGO4	100	99.884	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	ENSACLG00000005181	ago4	100	96.224	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.453	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	98.947	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.947	Bos_taurus
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	100.000	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.884	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	99.884	Capra_hircus
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.883	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	99.883	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000001610	AGO4	94	96.197	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	96.197	Cavia_aperea
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	97.897	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	97.897	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.649	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	99.649	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000001610	AGO4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.532	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	100.000	ENSCANG00000016914	AGO4	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.419	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	99.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.415	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	99.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	91.709	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	97.683	ENSDARG00000100854	ago4	100	97.683	Danio_rerio
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.768	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	99.768	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.884	ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000001610	AGO4	60	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSEASG00005012079	AGO4	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSECAG00000024686	AGO4	100	100.000	Equus_caballus
ENSCJAG00000001610	AGO4	79	97.173	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	97.173	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	95.786	ENSELUG00000023873	ago4	100	95.786	Esox_lucius
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.884	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	99.884	Felis_catus
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.883	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	99.883	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000001610	AGO4	97	88.756	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.756	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	97.206	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.206	Gadus_morhua
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.535	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.535	Gallus_gallus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	97.666	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.666	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	99.496	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	96.592	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.592	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.884	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	99.884	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	100.000	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.110	ENSHCOG00000003725	ago4	100	96.110	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSIPUG00000015600	ago4	100	96.339	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.884	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSKMAG00000018602	ago4	100	96.339	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	95.682	ENSLBEG00000010670	ago4	100	95.682	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	98.490	ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.334	ENSLOCG00000000584	ago4	100	96.334	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000001610	AGO4	93	99.251	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	99.251	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.883	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	100.000	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.224	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	ENSMZEG00005026346	ago4	100	96.224	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.181	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.181	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000001610	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	98.723	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.766	ENSMICG00000033507	AGO4	100	99.766	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.535	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	99.535	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	96.725	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.725	Mola_mola
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.652	ENSMODG00000017888	AGO4	100	99.652	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	95.688	ENSMALG00000011797	ago4	100	95.688	Monopterus_albus
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ENSCJAG00000001610	AGO4	100	98.839	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	Mus_musculus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	98.490	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	Mus_pahari
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	98.606	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	98.606	Mus_spretus
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ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.883	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	99.883	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	ENSNBRG00000013492	ago4	100	96.224	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	100.000	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000001610	AGO4	90	98.462	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	98.462	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	92.389	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	92.389	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000001610	AGO4	93	99.875	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	Octodon_degus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	ENSONIG00000013603	ago4	100	96.224	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	99.622	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.622	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.768	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	99.768	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSORLG00000009865	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSORLG00020016978	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSORLG00015008800	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSOMEG00000006399	ago4	100	96.339	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000001610	AGO4	93	98.498	ENSOGAG00000004233	-	100	98.498	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	90.825	ENSOGAG00000027107	-	100	90.825	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.415	ENSOARG00000019568	AGO4	98	99.415	Ovis_aries
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	100.000	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.884	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	99.884	Panthera_pardus
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.883	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	99.883	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	100.000	ENSPANG00000007232	AGO4	100	100.000	Papio_anubis
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	ENSPKIG00000022598	ago4	100	96.224	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.532	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	99.532	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000001610	AGO4	92	97.607	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	88.992	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSPMEG00000005049	ago4	100	96.339	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.339	ENSPREG00000010315	ago4	100	96.339	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000001610	AGO4	99	100.000	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	100.000	Pongo_abelii
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