EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000002084 (Gene tree)
Gene ID: 100415573
Gene Symbol: ZNF577
Alias: MGC4400
Full Name: zinc finger protein 577
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9828 bases
Position: chrNTIC01011113.1:26346676-26356503
Accession: 28673
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000003778	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-46	1	8
ENSCJAP00000003778	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-46	2	8
ENSCJAP00000003778	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-46	3	8
ENSCJAP00000003778	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-46	4	8
ENSCJAP00000003778	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-46	5	8
ENSCJAP00000003778	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-46	6	8
ENSCJAP00000003778	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-46	7	8
ENSCJAP00000003778	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-46	8	8
ENSCJAP00000003778	zf-met	PF12874.7	6.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000003979	ZNF577-201	1455	-	ENSCJAP00000003778	484 (aa)	-	F7DTQ0

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000002084's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc05168	Herpes simplex virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000002084's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000002084	ZNF577	73	53.968	ENSCJAG00000039837	ZNF235	78	53.968
ENSCJAG00000002084	ZNF577	51	35.628	ENSCJAG00000007206	ZNF652	50	35.628
ENSCJAG00000002084	ZNF577	74	55.702	ENSCJAG00000018930	ZNF2	96	55.702
ENSCJAG00000002084	ZNF577	59	47.737	ENSCJAG00000044946	ZNF768	53	48.374
ENSCJAG00000002084	ZNF577	85	49.502	ENSCJAG00000020283	ZNF582	99	49.502
ENSCJAG00000002084	ZNF577	63	38.017	ENSCJAG00000043982	ZNF574	67	38.017
ENSCJAG00000002084	ZNF577	57	49.261	ENSCJAG00000040315	ZNF628	61	44.976
ENSCJAG00000002084	ZNF577	78	54.753	ENSCJAG00000015620	ZNF81	99	54.753
ENSCJAG00000002084	ZNF577	82	61.364	ENSCJAG00000002058	ZNF836	83	61.364
ENSCJAG00000002084	ZNF577	80	53.815	ENSCJAG00000009497	ZNF850	99	53.815
ENSCJAG00000002084	ZNF577	79	48.571	ENSCJAG00000006214	ZNF317	90	49.306
ENSCJAG00000002084	ZNF577	81	45.455	ENSCJAG00000045776	ZNF564	99	45.455
ENSCJAG00000002084	ZNF577	81	50.224	ENSCJAG00000013321	ZNF226	98	50.224
ENSCJAG00000002084	ZNF577	57	41.564	ENSCJAG00000003133	PRDM5	70	48.855
ENSCJAG00000002084	ZNF577	60	38.991	ENSCJAG00000019859	ZNF408	54	40.909
ENSCJAG00000002084	ZNF577	60	34.375	ENSCJAG00000000596	ZFP64	73	34.375
ENSCJAG00000002084	ZNF577	60	37.452	ENSCJAG00000039505	ZNF319	92	37.452
ENSCJAG00000002084	ZNF577	74	41.795	ENSCJAG00000011738	ZNF670	99	41.795
ENSCJAG00000002084	ZNF577	91	51.292	ENSCJAG00000040669	ZNF267	100	51.292
ENSCJAG00000002084	ZNF577	88	48.374	ENSCJAG00000048658	ZNF225	98	48.374
ENSCJAG00000002084	ZNF577	81	49.268	ENSCJAG00000047263	ZNF205	75	49.756
ENSCJAG00000002084	ZNF577	78	51.653	ENSCJAG00000013266	ZNF112	82	51.653
ENSCJAG00000002084	ZNF577	81	53.226	ENSCJAG00000046843	ZNF418	99	53.226
ENSCJAG00000002084	ZNF577	56	33.442	ENSCJAG00000012788	ZNF526	63	33.125
ENSCJAG00000002084	ZNF577	79	54.167	ENSCJAG00000019885	ZNF500	55	54.167
ENSCJAG00000002084	ZNF577	58	44.397	ENSCJAG00000005453	-	99	44.397
ENSCJAG00000002084	ZNF577	75	59.813	ENSCJAG00000014349	ZFP1	99	59.813
ENSCJAG00000002084	ZNF577	74	50.410	ENSCJAG00000018246	-	70	50.410