EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000002256 (Gene tree)
Gene ID: 100411883
Gene Symbol: FTSJ1
Alias: CDLIV|JM23|MRX44|MRX9|SPB1|TRM7|TRMT7
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4576 bases
Position: chrNTIC01038833.1:72340832-72345407
Accession: 13254
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000067473	FtsJ	PF01728.19	5.4e-69	1	1
ENSCJAP00000004060	FtsJ	PF01728.19	3.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000004280	FTSJ1-202	579	-	ENSCJAP00000004060	192 (aa)	-	F6XI06
ENSCJAT00000082622	FTSJ1-201	990	-	ENSCJAP00000067473	329 (aa)	-	A0A2R8MZZ4

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000002256's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000002256's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	61	30.918	ENSCJAG00000039994	-	84	30.918
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	61	33.816	ENSCJAG00000001457	-	90	33.577

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.872	ENSG00000068438	FTSJ1	100	97.872	Homo_sapiens
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	75.321	ENSAPOG00000018541	ftsj1	99	75.321	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	95.166	ENSAMEG00000012735	FTSJ1	100	95.166	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	74.434	ENSACIG00000001541	ftsj1	99	74.434	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	74.214	ENSAOCG00000009380	ftsj1	99	74.214	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	73.899	ENSAPEG00000020434	ftsj1	99	73.899	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	90	74.754	ENSATEG00000008408	ftsj1	96	74.754	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	81	73.548	ENSACAG00000016605	FTSJ1	88	75.000	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	99.088	ENSANAG00000030571	-	100	99.088	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	93.009	ENSANAG00000035537	-	99	93.009	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	73.270	ENSACLG00000014226	ftsj1	99	73.270	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	78.082	ENSAMXG00000037663	ftsj1	91	78.082	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	77.576	ENSBTAG00000046593	-	99	77.576	Bos_taurus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	85.061	ENSBTAG00000031829	FTSJ1	99	85.061	Bos_taurus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	55.667	WBGene00011281	R74.7	88	55.667	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	94.529	ENSCAFG00000015339	FTSJ1	100	94.529	Canis_familiaris
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	94.529	ENSCAFG00020021351	FTSJ1	100	94.529	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	78.485	ENSCHIG00000017370	-	99	78.485	Capra_hircus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	78.419	ENSCHIG00000021392	-	100	78.419	Capra_hircus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	91.768	ENSCHIG00000000441	-	99	91.768	Capra_hircus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	95.441	ENSTSYG00000029207	FTSJ1	100	95.441	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	84	95.679	ENSCAPG00000011705	FTSJ1	97	80.333	Cavia_aperea
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	91.768	ENSCPOG00000030576	FTSJ1	100	91.768	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	99.088	ENSCCAG00000027731	FTSJ1	100	99.088	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	96.960	ENSCATG00000013045	FTSJ1	100	96.960	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	91.185	ENSCLAG00000011582	FTSJ1	100	91.185	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.264	ENSCSAG00000013278	FTSJ1	100	97.264	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	95	66.250	ENSCING00000008473	-	99	66.250	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	68.543	ENSCSAVG00000010259	-	96	68.543	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.264	ENSCANG00000033841	FTSJ1	100	97.264	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	89.024	ENSCGRG00001023654	Ftsj1	100	89.024	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	88.485	ENSCGRG00000007253	Ftsj1	100	88.485	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	62.799	ENSCSEG00000018843	ftsj1	90	62.799	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	75.251	ENSCVAG00000009618	ftsj1	95	75.251	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	76.610	ENSDARG00000057089	ftsj1	98	85.714	Danio_rerio
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	95	62.102	ENSDNOG00000044320	-	99	62.102	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	87.195	ENSDNOG00000047923	-	99	87.195	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	96	87.066	ENSDORG00000000074	Ftsj1	100	86.250	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	74	56.641	FBgn0038471	CG5220	83	56.641	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	87	50.000	FBgn0038861	CG7009	89	50.000	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	66	75.576	ENSETEG00000014092	-	65	75.576	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	93	64.052	ENSETEG00000018343	-	99	63.492	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	80	71.895	ENSEBUG00000005843	ftsj1	72	73.684	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	95	93.407	ENSEASG00005008272	FTSJ1	70	94.000	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	93.921	ENSECAG00000019260	FTSJ1	100	93.921	Equus_caballus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	92.833	ENSEEUG00000001469	FTSJ1	100	92.833	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	76.667	ENSELUG00000011483	ftsj1	90	76.667	Esox_lucius
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	94.529	ENSFCAG00000026453	FTSJ1	100	94.529	Felis_catus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	90.854	ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.854	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	73.899	ENSFHEG00000008464	ftsj1	99	73.899	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	77.703	ENSGMOG00000004562	ftsj1	99	77.703	Gadus_morhua
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	83	70.625	ENSGAFG00000002036	ftsj1	96	74.312	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	75.748	ENSGACG00000008843	ftsj1	93	75.748	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.568	ENSGGOG00000028552	FTSJ1	100	97.568	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	93	73.418	ENSHBUG00000015883	ftsj1	98	73.418	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	91.768	ENSHGLG00000003132	FTSJ1	100	91.768	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	91.768	ENSHGLG00100014682	FTSJ1	100	91.768	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	76.923	ENSHCOG00000010145	ftsj1	95	76.923	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	76.610	ENSIPUG00000005052	FTSJ1	92	76.610	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	94.512	ENSSTOG00000027717	FTSJ1	99	94.512	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	89.058	ENSJJAG00000014517	-	100	89.058	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	96	85.759	ENSJJAG00000011596	-	98	86.495	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	90	75.667	ENSKMAG00000000645	ftsj1	95	75.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	90	75.244	ENSLBEG00000005293	ftsj1	86	75.244	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	77	84.848	ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	98	72.000	ENSLOCG00000015688	ftsj1	93	72.000	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	88.073	ENSLAFG00000032618	FTSJ1	100	88.073	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.264	ENSMFAG00000003467	FTSJ1	100	97.264	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	96.960	ENSMMUG00000018894	FTSJ1	100	96.960	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	96.657	ENSMNEG00000044348	FTSJ1	100	96.657	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.264	ENSMLEG00000016789	FTSJ1	100	97.264	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	90	76.821	ENSMAMG00000022841	ftsj1	92	76.821	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	73.270	ENSMZEG00005022583	ftsj1	99	73.270	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	88.415	ENSMAUG00000015442	Ftsj1	100	88.415	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	96.907	ENSMICG00000036228	-	98	96.907	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	92	86.799	ENSMOCG00000020523	-	95	86.799	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	66	94.037	ENSMOCG00000000507	-	100	94.037	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	96	85.489	ENSMOCG00000021218	-	95	85.489	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	91	71.569	ENSMMOG00000018969	ftsj1	95	71.569	Mola_mola
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	80.345	ENSMODG00000011356	FTSJ1	98	80.345	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	90	75.415	ENSMALG00000014209	ftsj1	99	73.885	Monopterus_albus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	86.850	MGP_CAROLIEiJ_G0032918	Ftsj1	100	86.850	Mus_caroli
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	86.544	ENSMUSG00000031171	Ftsj1	100	86.544	Mus_musculus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	86.626	MGP_PahariEiJ_G0031467	Ftsj1	100	86.850	Mus_pahari
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	86.239	MGP_SPRETEiJ_G0034067	Ftsj1	100	86.239	Mus_spretus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	94.225	ENSMPUG00000013493	FTSJ1	100	94.225	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	91.239	ENSMLUG00000003977	FTSJ1	99	91.239	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	86.890	ENSNGAG00000016847	-	99	86.890	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	90.549	ENSNGAG00000018629	-	100	90.549	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	66.286	ENSNBRG00000012481	ftsj1	99	66.286	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	96.859	ENSNLEG00000007816	FTSJ1	100	92.705	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	91.768	ENSODEG00000009855	FTSJ1	100	91.768	Octodon_degus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	91	73.802	ENSONIG00000003966	ftsj1	99	73.802	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	87	41.667	ENSOANG00000013572	-	99	41.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	91.818	ENSOCUG00000008009	-	99	91.818	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	98	88.580	ENSOCUG00000023277	-	99	88.580	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	98	87.346	ENSOCUG00000024620	-	99	87.346	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	76.027	ENSORLG00000028355	ftsj1	94	76.027	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	76.370	ENSORLG00020007897	ftsj1	94	76.370	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	75.685	ENSOMEG00000018497	ftsj1	86	75.685	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	98	92.284	ENSOGAG00000032641	-	100	92.284	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	92.147	ENSOGAG00000016174	-	100	82.831	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	91.768	ENSOARG00000012432	-	99	91.768	Ovis_aries
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	78.116	ENSOARG00000012099	-	100	78.116	Ovis_aries
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.872	ENSPPAG00000028540	FTSJ1	100	97.872	Pan_paniscus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	94.833	ENSPPRG00000000249	FTSJ1	100	94.833	Panthera_pardus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	94.225	ENSPTIG00000017680	FTSJ1	100	94.225	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.872	ENSPTRG00000049433	FTSJ1	100	97.872	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	96.657	ENSPANG00000010102	FTSJ1	100	96.657	Papio_anubis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	74.342	ENSPKIG00000019318	ftsj1	89	74.342	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	84	56.028	ENSPSIG00000007020	FTSJ1	93	57.197	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	79.268	ENSPEMG00000013262	-	97	79.268	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	88.110	ENSPEMG00000015698	-	100	88.110	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	72.635	ENSPMAG00000006943	FTSJ1	99	72.635	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	75.484	ENSPCIG00000007236	FTSJ1	98	75.484	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	90	73.667	ENSPFOG00000017003	ftsj1	96	73.667	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	78	77.344	ENSPLAG00000016190	ftsj1	91	77.344	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	91	72.667	ENSPMEG00000021719	ftsj1	96	72.667	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	91	73.913	ENSPREG00000016616	ftsj1	96	73.737	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	67	95.385	ENSPPYG00000020309	-	100	94.643	Pongo_abelii
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	57	92.405	ENSPCAG00000009437	-	65	92.405	Procavia_capensis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	97.595	ENSPCOG00000022716	-	93	97.595	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	92.097	ENSPCOG00000018822	-	100	92.097	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	70	89.908	ENSPVAG00000015621	FTSJ1	70	89.908	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	73.270	ENSPNYG00000011144	ftsj1	99	73.270	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	77.288	ENSPNAG00000016330	ftsj1	92	77.288	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	85.671	ENSRNOG00000004776	Ftsj1	99	85.671	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.264	ENSRBIG00000027511	FTSJ1	100	97.264	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	97.264	ENSRROG00000029757	FTSJ1	100	97.264	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	88	48.243	YBR061C	TRM7	100	48.243	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	98.958	ENSSBOG00000028146	FTSJ1	100	98.958	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	93	75.649	ENSSHAG00000012607	FTSJ1	100	75.649	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	75.415	ENSSFOG00015006275	ftsj1	88	75.415	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	95	74.367	ENSSMAG00000001754	ftsj1	99	74.367	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	74.026	ENSSDUG00000015226	ftsj1	99	74.026	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	74.757	ENSSLDG00000019859	ftsj1	99	74.757	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	77	77.075	ENSSARG00000007246	-	100	77.075	Sorex_araneus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	88.182	ENSSARG00000007091	-	100	88.182	Sorex_araneus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	94	73.585	ENSSPAG00000022047	ftsj1	99	73.585	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	92.705	ENSSSCG00000025599	FTSJ1	100	92.705	Sus_scrofa
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	76.271	ENSTRUG00000016142	ftsj1	93	76.271	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	74.411	ENSTNIG00000010402	ftsj1	96	74.411	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	91.489	ENSTTRG00000009027	FTSJ1	100	91.489	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	97	95.625	ENSUAMG00000013296	FTSJ1	95	95.625	Ursus_americanus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	87.537	ENSUMAG00000007966	FTSJ1	100	87.537	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	92	91.525	ENSVPAG00000008296	-	100	91.525	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	100	94.833	ENSVVUG00000017640	FTSJ1	100	94.833	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	70.748	ENSXCOG00000003344	ftsj1	90	70.748	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000002256	FTSJ1	89	74.744	ENSXMAG00000009372	ftsj1	96	74.744	Xiphophorus_maculatus