EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000002263 (Gene tree)
Gene ID: 100409587
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10061 bases
Position: chrNTIC01022223.1:135209165-135219225
Accession: 100409587
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000004259	rRNA_proc-arch	PF13234.6	9.8e-42	1	1
ENSCJAP00000004259	DEAD	PF00270.29	3.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000004490	SKIV2L-201	3741	XM_002746366	ENSCJAP00000004259	1246 (aa)	XP_002746412	F6Y4X2

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000002263's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000002263's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	79	36.561	ENSCJAG00000001773	MTREX	92	36.561

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.432	ENSG00000204351	SKIV2L	100	97.432	Homo_sapiens
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.905	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	62.249	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.783	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.783	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.208	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.596	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.380	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.508	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.221	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.656	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.306	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	61.396	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	66.170	ENSACAG00000011746	SKIV2L	100	66.484	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	98.475	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	98.475	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.667	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.977	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	98	59.552	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.442	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.703	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	94.703	Bos_taurus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	96	39.782	WBGene00008502	skih-2	99	40.107	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.783	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	94.783	Canis_familiaris
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.703	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	94.703	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.703	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	94.703	Capra_hircus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.543	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	94.543	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	92.295	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.295	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	98.154	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	98.154	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.191	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	97.191	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.178	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.178	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.191	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	97.191	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	87	65.497	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	65.497	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	94	50.975	ENSCING00000005576	-	99	50.975	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	97.510	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	97.510	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.986	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	93.986	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.385	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	61.384	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.532	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	61.557	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.791	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.978	Danio_rerio
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	94	94.744	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	88.622	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	93	44.184	FBgn0039117	tst	97	44.268	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	72	93.059	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	93.059	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	89	56.980	ENSEBUG00000013680	-	95	57.429	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	93	95.090	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	95.090	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	96	94.622	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	95.254	Equus_caballus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	54	98.419	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	98.419	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.443	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.494	Esox_lucius
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	95.104	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	95.104	Felis_catus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	90.217	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.537	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.045	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.236	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	59.410	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.514	Gadus_morhua
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	78	60.550	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.652	Gallus_gallus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.441	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.637	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.382	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.467	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.352	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	97.352	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.508	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.817	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	91.506	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	91.667	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	89.103	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	89.263	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	98	59.561	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.561	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.269	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	60.465	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.382	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.382	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	71	60.192	ENSLACG00000002986	-	73	60.553	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.900	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.900	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.432	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	97.432	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.352	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	97.352	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.352	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	97.352	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.271	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	97.271	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.270	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.464	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.508	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.817	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	70	51.775	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	51.775	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.023	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.349	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	95.265	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	95.265	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	92.302	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.382	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.236	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	61.314	Mola_mola
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	87.590	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.590	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	59.984	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	Monopterus_albus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.184	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	93.184	Mus_caroli
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.264	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	93.264	Mus_musculus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	92.702	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	92.702	Mus_pahari
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	92.943	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	92.943	Mus_spretus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.623	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	94.623	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.740	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	93.740	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.925	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	61.160	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	93.805	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	93.805	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	78	93.805	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	93.805	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.981	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.981	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	92.215	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	92.215	Octodon_degus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	62.072	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.359	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.543	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	94.543	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.410	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.606	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.252	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.526	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.014	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.205	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	62.192	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	62.319	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.783	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	94.783	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	89.272	ENSOARG00000002411	-	100	89.272	Ovis_aries
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	96.627	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	96.627	Pan_paniscus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	95.104	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	95.104	Panthera_pardus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.623	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.623	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.512	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	97.512	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	96.061	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	96.061	Papio_anubis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.047	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.190	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.418	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.894	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.745	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	93.745	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	87.600	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	87.600	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.234	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.427	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.362	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.313	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.508	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	59.807	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.951	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	96.790	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	96.790	Pongo_abelii
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	77	93.959	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	93.959	Procavia_capensis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	96.308	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	96.308	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.499	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	93.499	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.482	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	60.552	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	98	61.365	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	61.365	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.665	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	93.665	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	98	94.575	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	94.575	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.191	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	97.191	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	93	37.708	YLR398C	-	93	37.628	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	98.315	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	98.315	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	87.270	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.229	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.290	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.643	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.155	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.347	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.679	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.878	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.821	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.894	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	62.403	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.657	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	94	61.821	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	62.034	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.944	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	Sus_scrofa
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	73	63.939	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.042	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	59.745	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	94	93.252	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	89.727	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.727	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	95.265	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.265	Ursus_americanus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	93	95.349	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	95.349	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	98	94.866	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	94.866	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	58.506	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.777	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.427	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.619	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.124	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	61.316	Xiphophorus_maculatus